食管鳞癌mirna与全基因组表达谱及其调控网络的研究

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1、橇旦大擎万方数据硕士学位论文食管鳞癌miRNA与全基因组表达谱及其调控网络的研究miRNA—mRNAregulatorynetworksbyintegratingmiRNAandmRNAexpressionprofilingofesophagealsquamouscelIcarcinoma硕士研究生：魏巧专业：肿瘤学导师：孙孟红教授导师组成员：盛伟琪副教授赵快乐副教授万方数据复旦大学硕士学位论文食管鳞癌miRNA与全基因组表达谱及其调控网络研究目录lIllllllll[IlllltlII[1lIIIllll[1lllll[1111

2、{Y2702614主要缩略词表⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯1中文摘要⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯2Abstract．⋯．．⋯．．．．．⋯⋯⋯⋯．⋯⋯．．⋯．．⋯．⋯⋯．．．，．⋯⋯⋯．．⋯．．⋯⋯．．．⋯⋯⋯⋯．．⋯．．⋯．．．．．．．．⋯．6前言⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯。11第一部分食管鳞癌miRNA及全基因组表达谱筛选分析⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．15材料与方法⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．．15结果⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯

3、⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．．23讨论⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．．43小结⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．．48第二部分食管鳞癌miRNA及mRNA芯片结果验证⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．51材料与方法⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．．51结果⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．57讨论⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯一61小结⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯

4、⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．．63第三部分292例食管鳞癌中miRNA原位杂交和Sixl、Six4蛋白免疫组化分析及其与临床预后的关系⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯。64材料与方法⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯一64结果⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．．69讨论⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯～82小结⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．．86全文总结⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯

5、⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯90综述⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．92miRNA与食管鳞癌的研究进展⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯92致谢⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．．101万方数据复旦大学硕士学位论文食管鳞癌miRNA与全基因组表达谱及其调控网络研究主要缩略词表缩略词miRNAESCCEAC刚英文全称microRNA主要缩略词表中文全称微小RNAEsophagealsqumamous食管鳞状细胞癌cellcarcino

6、maEsophagealadenocarcinoma食管腺癌RNAintergritynumberRNA完整指数qRT·—PCRReal·-timequantitativeCtSDLNASSCDEPCEDTAISH刀订4DABreversetranscriptionpolymerasechainreactionCyclethresholdStandarddeviationLockedNucleicAcid实时定量逆转录聚合酶链反应循环阈值标准差核酸锁Sodiumcitrate-Hydrochloric柠檬酸钠缓冲液acidBuff

7、erDiethylpyrocarbonate焦碳酸二乙酯EthyleneDiamineTetraaceticAcid乙二胺四乙酸InSituHybridization原位杂交TissueMicroarray组织芯片Diaminobenzidine二氨基联苯胺万方数据复旦大学硕士学位论文食管鳞癌miRNA与全基因组表达谱及其调控网络研究中文摘要中文摘要第一部分食蕾躺miRNA及全基因组裹达谱筛选分析研究目的筛选食管鳞癌miRNA与全基因组mRNA表达谱，整合分析miRNA及其靶基因在食管鳞癌发生发展中的作用。材料与方法选择8例食管鳞

8、癌组织及其配对的癌旁正常组织用于研究。应用粗切割手段保证用于研究的组织中癌细胞成分大于70％。应用Agilent人类miRNA芯片和Agilent人类全基因组表达谱芯片进行miRNA和mRNA表达谱的检测，利用TargetScan数据库对筛选出的差