口腔疣状癌、口腔鳞癌全基因组及mirna表达谱研究

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1、分类号UDC博士学位论文密级口腔疣状癌、口腔鳞癌全基因组及miRNA表达谱研究StudiesofWholegenomeExpressionProfileandmiRNAinOralVerrucousCarcinomaandoralsquamouscellcarcinoma作者姓名：王月红学科专业学院(系、所)指导老师：耳鼻咽喉科学：湘雅医院：唐瞻贵教授论文答辩日期趋!兰：s。忱答辩委员会主席中南大学二。一二年三月原创性声明本人声明，所呈交的学位论文是本人在导师指导下进行的研究工作及取得的研究成果。尽我所知，除了论文中特别加以标注和致谢的地方外，

2、论文中不包括其他人已经发表或撰写过的研究成果，也不包含为获得中南大学或其他单位的学位或证书而使用过的材料。与我共同工作的同志对本研究所作的贡献均已在本论文中作了明确的说明。作者签名：墨叠业关于学位论文使用授权说明本人了解中南大学有关保留、使用学位论文的规定，即：学校有权保留学位论文，允许学位论文被查阅和借阅；学校可以公布学位论文的全部或部分内容，可以采用复印、缩印或其他手段保存学位论文；学校可根据国家或湖南省有关部门规定送交学位论文。日期：讼旺年上月监日博士学位论文中文摘要口腔疣状癌、口腔鳞癌全基因组及miRNA表达谱研究摘要研究背景及目的：疣

3、状癌是一种具有特殊临床特征、生物形态学及细胞动力学特征的恶性肿瘤，1948年Ackerman首次将它作为独立的实体瘤从鳞状细胞癌中划分出来并予以命名，发生于口腔的疣状癌称口腔疣状癌(oralverrucouscarcinoma,OVC)。本课题组自1992年开始对OVC进行了系列研究，2004年采用BiostarH-40S型含有3900个基因的芯片进行了OVC基因表达的初步筛选并与El腔鳞癌(oralsquamoUScellcarcinoma，oscc)进行对比研究发现，OVC与自身对照正常粘膜(OVC-N)及OSCC间存在多个差异表达基因。但

4、此前的研究芯片通量较低，为了进一步研究OVC的临床生物学特征、以及生物学行为机理，本研究应用全基因组寡核苷酸及miRNA芯片技术对OVC、OSCC及其相应的癌旁(ParacanceroUStissueofOVC，OVC．P、ParacanceroUStissueofOSCC，OSCC．P)及正常口腔黏膜(normalmucosatissueofOVC，OVC-N、normalmucosatissueofOSCC，OSCC-N)进行了全基因组基因及miRNA表达谱构建并进行生物信息学分析：为筛选出决定0VC主要生物学行为的基因及miRNA做前期准

5、备，为建立具有自主知识产权的OVC诊断用基因芯片奠定良好基础，并能更好的研究其与OSCC在发病机制方面的区别，以达到更好的指导临床诊断和治疗，提高OVC早期诊断率和治愈好转率的目的。博士学位论文中文摘要方法：运用人类全基因组寡核苷酸芯片HumanGenomeU133Plus2．0Array以及miRNA微阵列芯片技术对5例OVC、6例OSCC及相应患者的癌旁、正常口腔黏膜组织进行全基因组表达谱及miRNA表达谱(miRNA芯片OVC补充至6例)研究，筛选出差异表达基因及差异表达miRNA。运用RT．PCR分别检测5例OVC、OSCC及相关癌旁和

6、正常黏膜组织中MMPl、SERPINEl、MAL、DNASElL3的表达，分析其间的表达差异，以验证芯片的检测结果。进一步运用生物信息学方法对差异基因进行二次筛选，初步探讨差异基因及miRNA的功能，并运用IPA分析软件对差异基因进行通路和基因网络调控图分析。结果：芯片杂交结果符合质控要求，RT．PCR验证结果与基因芯片结果基本一致。差异基因表达分析结果显示：OVC与OVC-N差异表达已知基因109个，其中表达上调66个，下调43个；OVC与OVC．P差异表达已知基因29个，其中表达上调18个，下调11个；OVC．P与OVC-N差异表达已知基因

7、56个，其中表达上调26个，下调30个；OSCC与OSCC-N差异表达已知基因1172个，其中表达上调564个，下调608个；OSCC与OSCC．P差异表达已知基因949个，其中表达上调346个，下调603个；OSCC．P与OSCC-N差异表达己知基因220个，其中表达上调191个，下调29个。OSCC与OVC差异表达己知基因167个，其中表达上调108个，下调59个。miRNA差异表达分析显示：OVC与OVC-N差异表达miRNA2个，均表达下调；OVC与OVC．P差异表达miRNA2个，均表达上调；OVC．P与OVC-N差异表达miRNA8

8、个，其中表达上调2个，下调6个；OSCC与OSCC-N差异表达miRNA33个，其中表达上调22个，下调11个；OSCC与OSCC．P差异表达miRN