布莱凯特黑牛h--fabp基因遗传多态性及其与肉质性状的关联分析

布莱凯特黑牛h--fabp基因遗传多态性及其与肉质性状的关联分析

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1、万方数据Geneticpolymorphismof.H-FABPgeneandcorrelationanalysiswith.meatqualityinBlackCattleThesissubmittedto02r留daoAgriculturalUniversityInFulfillmentoftheRequirementfortheDegreeofMasterofAgronomy一ZhaoShiquan(CollegeofAnimalScienceandVerterinaryMedicine)Supervisor:DongYaj

2、uanBaiXuejinQingdao.ChinaJune,2013万方数据独创性声明本人声明所呈交的论文是我个人在导师指导下进行的研究工作及取得的研究成果。尽我所知,除了文中特别加以标注和致谢的地方外,论文中不包含其他人已经发表或撰写过的研究成果,也不包含为获得青岛农业大学或其它教育机构的学位或证书而使用过的材料。与我二同工作的同志对本研究所做的任何贡献均已在论文中作了明确的说明并表示了谢意。研究生签名:如但●时间:年。月日关于论文使用授权的说明本人完全了解青岛农业大学有关保留、使用学位论文的规定,即:学校有权保留送交论文的复印

3、件和磁盘,允许论文被查阅和借阅,可以采用影印、缩印或扫描等复制手段保存、汇编学位论文。同意青岛农业大学可以用不同方式在不同媒体上发表、传播学位论文的全部或部分内容。(保密的学位论文在解密后应遵守此协议)研究生签名:沙々时间:年月日导师签名:锄撕时间:年月日万方数据布莱凯特黑牛肛剐解基因遗传多态性及其与肉质性状的关联分析摘要利用PCR.SSCP方法对布莱凯特黑牛H-FABP基因编码区序列多态性进行检测,并对多态片段进行克隆测序。试验检测到布莱凯特黑牛H-FABP基因编码区第21位点的T/C突变、第1418位点的A/C突变、第4032

4、位点~G突变、第458l位点G/C突变、第6404位点T/C突变、第7141位点A/G突变、第7183位点T/C突变,共产生7个多态位点。对各多态位点的基因型频率、基因频率、遗传多态性指标等进行计算分析,发现除第6404位点、第7141位点和第7183位点的多态信息含量为低度多态(PIC

5、均符合Hardy-Weinberg平衡定律(z2szI;}_05,P-e_o.05)。采用索氏提取法测试样本中部分布莱凯特黑牛的肌内脂肪含量,参照NY/T676.2003((牛肉质量分级》对样本个体的大理石花纹进行评分。根据H-FABP基因的PCR.SSCP多态性,应用SPSSl7.0软件,用最小二乘法拟合一般线性模型(GLM)分析H-FABP基因多态性对部分肉质性状(肌内脂肪含量和大理石花纹评分)的影响。结果发现,第4032位点A—G的突变和第4581位点G_C的突变产生的州基因型对肌内脂肪含量的影响显著高于AB、BB基因型(P

6、<0.05);第458l位点G_c的突变产生的削基因型对大理石花纹丰富程度的影响显著高于AB、BB基因型(P<0.05)。证明H-FABP基因可以作为肉质·}生状的候选基因。关键词:H-FABP基因;布莱凯特黑牛;PCR—SSCP;肌内脂肪含量;大理石花纹万方数据壹璺壅些太堂亟±堂僮逾塞△鱼啦丛GeneticpolymorphismofH-FABPgeneandcorrelationanalysiswithmeatqualityinBlackCattleAbstractThesinglenucleotidepolymorphism

7、s(SNP)ofH-FABPgenein"BlackCattleweredetectedbyPCR—SSCPandDNAsequencing.Theresultsindicatedthat:thereare7SNPsloci,T2tC,At418C,A4032G,G4581C,T6404C,A7141GandT7183C.Withanalysisofgenotypefrequency,genefrequencyandindicatorsofgeneticpolymorphism,findingthatH-FABPgeneWaSin

8、termediatepolymorphism(0.25

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