牛angptl3基因组织表达、多态性及其与生长性状关联分析

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1、河南农业大学硕士学位论文牛Angptl3基因组织表达、多态性及其与生长性状关联分析姓名：杨婷申请学位级别：硕士专业：动物遗传育种与繁殖指导教师：林峰201205河南农业火学2012届硕+学位论文中文摘要Angptl3是一种与脂类代谢、葡萄糖代谢和能量代谓}密切相关的分泌性蛋白质。本研究以Angptl3基因为研究对象，利川实时荧光定量PCR方法检测其在3头郏县红牛(Jx)组织中的表达谱；采用DNA池测序、PCR．RFLP和PCR．SSCP技术对Angptl3基冈在郏县红牛、南m牛、鲁撕牛、渤海黑牛、秦川牛和高原牦牛

2、6个群体中共424个个体的遗传多态性进行检测，并分析了遗传变异与其牛长性状的相关性，旨在探索Angptl3基冈对牛生K发育性状的影响，试图寻找影响牛经济性状的主效基冈，为我国地方黄牛的遗传改良提供一定的理论依据，研究结果如卜．：1．Angptl3基冈在郯县红牛组织中的表达谱Angptl3基冈在郏县红牛组织中在肝脏中表达量最高，在脾脏和肺脏纲织中微量表达，在心脏、肾脏、瘤胃、骨骼肌、脂肪组织、睾丸组织中均不表达。2．牛Angptl3基冈群体遗传样性分析在上述6个牛群体上对Angptl3基冈编码

3、又：进行遗传多态性检

4、测，结果发现3处SNPs：g．104A>T、g．509A>G利g．8661T>C(与GenBank：NC一007301对照)，3个突变位点都何丁．编码区，属丁

5、错义突变。g．104A>T位点属丁．异亮氨酸>苯丙氨酸的错义突变；位点g．509A>G属丁-谷氨酰胺>精氨酸的错义突变，位点g．8661T>C属J：丝氮酸>脯氨酸的错义突变。g．104A>T利g．509A>G两个位点在秦川I牛群体中早现低度多态，在渤海黑牛和鲁两牛群体中早现中度多态；位点g．8661T>C在郯县红牛、鲁¨牛、南刚牛利渤海黑牛4个黄牛群体中牛

6、现低度多态。连锁不平衡分析表明，在黄牛群体中，g．104A>T利g．509A>G位点处丁．强连锁状态(r2>0．33)，而g．104A>T和g．8661T>C问、g．509A>G和g．8661T>C间的连锁极弱(r2<0．33)。3．牛Angptl3基冈多态位点与生K性状的关联分析单一位点与性状之间的关联分析表明，在鲁阳牛群体中，g．104A>T位点oj体高利体斜K指标显著相关(P<0．05)，AT基冈型人丁．TT基冈，忾g．509A>G位点与体斜l丈显并相关(Jp<0．05)，AA基冈型利AG基冈型人丁．GG基

7、冈牙!。在郯县红牛群体中，g．104A>T和g．8661T>C何点不同基冈型在各指标问差异不显著(P>0．05)，g．509A>G何点与胸同显著相关(P<0．05)，GG基冈型人丁．AA基冈型。在黄牛群体中3个多态侮点的组合基冈型与生长性状进行关联分析，结果显示ATAATT基冈型个体的体高、体斜K、胸罔利坐骨端宽显著高丁．AAAATT型个体(尸<0．os)。可能此组合基冈型对黄牛的生lj==性状具有一定的影响，是有利T-黄牛生长的基冈型组合。关键词：牛；Angptl3基冈；遗传多态性；表达谱；生长性状河南农业大学

8、2012届硕士学位论文ABSTRACTTissuesexpressionanalysis，novelSNPsofthebovineAngptl3geneanditseffectsongrowthtraitsSupervisor：Prof．LinfengMasterCandidate：YangtingAngiopoietin—likeprotein3(angptl3)isasecretedproteinthatregulateslipid，glucoseandenergymetabolism．Herein，theg

9、eneexpressionprofilewasdetectedinvarioustissuesinJiaxianredcattlebyquantitativereal—timePCR．WhilethepolymorphismoftheAngptl3genewereanalyzedbyDNApoolssequencing，PCR—RFLPandPCR—SSCPmethodinJiaxianredcattle，Nanyangcattle，Luxicattle，Bohaiblackcattle，Qinchuancatt

10、leandGaoyuanyak，fltotalnumberof424，andinvestigatedtheirassociationswithgrowthtraits．ToassesswhetherAngptl3genecouldbeefficientmolecularmarkersformarker—assistedselection(MAS)，theassociati