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时间:2019-03-08
《小鼠皮肤无绿藻感染差异表达基因的筛选》由会员上传分享,免费在线阅读,更多相关内容在学术论文-天天文库。
1、万方数据复旦大学硕士学位论文小鼠皮肤无绿藻唐染差异表达基因的筛选ScreendifferentiallyexpressedgenesinskinofmiceafterintradermalinoculationofPrototheca硕士研究生:硕士生导师:导师组成员:曾义斌章强强教授朱利平主任医师李莉主管技师万方数据复旦大学硕士学位论文目录中文摘要⋯一⋯⋯⋯⋯⋯一⋯⋯一一一一一一一⋯⋯⋯一⋯⋯⋯⋯⋯⋯一一1英文摘要一⋯一⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯一一⋯⋯⋯一一一⋯⋯⋯⋯⋯⋯~-3日Ⅱ雷第一部分:小鼠皮肤无绿藻感染动物模型的构建引言材料和方法结果讨论⋯⋯一一⋯⋯⋯一一..57⋯一7第
2、二部分:小鼠皮肤无绿藻感染差异表达基因的筛选引言一⋯⋯一材料和方法结果参考文献综述101516--.---.---..⋯............25-.........34一-···⋯-.--—-........3738附录⋯⋯⋯⋯一一⋯⋯一一一一⋯一⋯⋯⋯⋯一⋯一~⋯⋯⋯⋯⋯一一一一..48致谢⋯⋯一⋯⋯⋯~一一⋯⋯⋯⋯~⋯⋯⋯⋯⋯一⋯一一..49万方数据复旦大学硕士学位论文中文摘要第一部分:小鼠皮肤无绿藻感染动物模型的构建目的:构建小鼠皮肤无绿藻感染模型。方法:BALB/C小鼠分为4组,A组为免疫抑Nd,鼠,腹部皮下接种lxl09孢子数/ml中型无绿藻波多黎各变种悬液组:B组为
3、免疫抑制小鼠,腹部皮下接种lxl06孢子数/ml悬液组:C组为健康小鼠,腹部皮下接种lxl09孢子数/ml悬液组;D组为对照组,健康小鼠腹部皮下接种生理盐水溶液,每个部位接种量均为200J.tl。接种后第7、14、28天时观察各组小鼠腹部皮损变化,并进行腹部皮肤病理及真菌检查。结果:A、B、C组小鼠接种处均出现丘疹、脓肿,部分出现溃疡、结痂,感染率均为100%。A、B、C三组小鼠的腹部皮损直径,组内相比,均在第7天时最大(P<0.05),分别为(6.75+1.09)ml,'fl、(5.88+1.17)nlm和(5.96+0.99)姗;组间相比,在接种后第7、14天时,差异无统计学意
4、义(P>O。05),在第28天时,A组最大(P5、A,反转录成cDNA同时进行单色标记,和小鼠全基因组表达谱芯片杂交,经过芯片扫描和数据处理,分析出差异表达的基因,并对部分差异基因采用实时荧光定量PCR的方法进行验证。结果:感染无绿藻的小鼠皮肤组织中表达差异>2倍的基因共有9902个,其中表达上调的基因4974个,表达下调的基因4928个。生物信息学分析发现,差异基因功能主要涉及炎症反应、免疫应答、信号转导、细胞粘附等多个生物学过程。另外还发现了一些有意义的信号通路如趋化因子信号通路、Jak.STAT信号传导途径、Toll样受体信号传导途径等。差异基因的实时荧光定量PCR结果与基因芯片的结果趋势一致。结论:皮肤无绿藻病的发生涉及众6、多基因表达的改变,芯片技术可以有效地筛选出皮肤无绿藻感染小鼠的差异表达基因,对进一步探索皮肤无绿藻病的发病机制,有效干预或治疗皮肤无绿藻病具有重要意义。关键词:无绿藻属;疾病模型;基因芯片;差异表达;基因;皮肤组织中图分类号:R75皮肤病学与性科学万方数据AbstractPartI:EstablishmentofcutaneousprotothecosismodelinmiceObjective:Todevelopamousemodelofcutaneousprotothecosis.Methods:Atotalof48BALB/Cmicewereequallydividedint7、o4groups,includinggroupA(immuno-suppressedmiceinoculatedwithP.zopfiivar.portoricensissuspensionof1x109c如conidiaml以),groupB(immuno—suppressedmiceinoculatedwithsuspensionoflx106cfuconidiamlq),groupC(healthymiceinoculatedwithsuspensionoflx
5、A,反转录成cDNA同时进行单色标记,和小鼠全基因组表达谱芯片杂交,经过芯片扫描和数据处理,分析出差异表达的基因,并对部分差异基因采用实时荧光定量PCR的方法进行验证。结果:感染无绿藻的小鼠皮肤组织中表达差异>2倍的基因共有9902个,其中表达上调的基因4974个,表达下调的基因4928个。生物信息学分析发现,差异基因功能主要涉及炎症反应、免疫应答、信号转导、细胞粘附等多个生物学过程。另外还发现了一些有意义的信号通路如趋化因子信号通路、Jak.STAT信号传导途径、Toll样受体信号传导途径等。差异基因的实时荧光定量PCR结果与基因芯片的结果趋势一致。结论:皮肤无绿藻病的发生涉及众
6、多基因表达的改变,芯片技术可以有效地筛选出皮肤无绿藻感染小鼠的差异表达基因,对进一步探索皮肤无绿藻病的发病机制,有效干预或治疗皮肤无绿藻病具有重要意义。关键词:无绿藻属;疾病模型;基因芯片;差异表达;基因;皮肤组织中图分类号:R75皮肤病学与性科学万方数据AbstractPartI:EstablishmentofcutaneousprotothecosismodelinmiceObjective:Todevelopamousemodelofcutaneousprotothecosis.Methods:Atotalof48BALB/Cmicewereequallydividedint
7、o4groups,includinggroupA(immuno-suppressedmiceinoculatedwithP.zopfiivar.portoricensissuspensionof1x109c如conidiaml以),groupB(immuno—suppressedmiceinoculatedwithsuspensionoflx106cfuconidiamlq),groupC(healthymiceinoculatedwithsuspensionoflx
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