白菜est标记的建立及其应用研究

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1、浙江大学硕士学位论文白菜EST标记的建立及其应用研究姓名：忻雅申请学位级别：硕士专业：生物物理学指导教师：崔海瑞20050501y732861单位代码：10339研究生学号：20216013白菜EST标记的建立及其应用研究论文评阅人：座态云婴究旦虫国盔整压是羞庭硒塞逸堑江省壅抖院胡置麴援堑盍壅堂院答辩委员会主席：夏墓武熬援逝盍壅堂瞳答辩委员会成员：翌垡羞班窥虽拉幽吏盘型暄昱羞庭硒究员逝、江省壅抖瞳扭盔金熬援浙太壅堂院崔瀣瑞班宜虽逝盔盔堂院论文答辩日期：2QQ5：互：2致谢本论文是在崔老师的精心指导和关心下完成的，导师严谨踏安的治

2、学、诲人不倦的精神品质以及对科研执着的追求令学生终生难忘和钦佩。三年求学期间，崔老OiTi对我的学习和实验给予了非常细致的指导，并在生活等很多方面提供了很大的帮助。值此论文完成之际，谨向导师崔海瑞研究员表示深深地感谢。本实验要特别感谢韩国忠南大学园艺系林容杓(Yong-PyoLira)教授提供白菜EST序列资料和gSSR信息，浙江省农科院韦顺恋研究员提供早熟5号的亲本材料，浙大园艺系寿森炎教授提供部分白菜种子，浙大茶学系种质资源圃提供茶树材料，本实验室张明龙副教授提供油菜材料，本实验室吴殿星副教授提供玉米材料。三年求学期间，本所

3、夏英武教授、徐步进教授、吴殿星副教授、舒庆尧教授、沈圣泉副教授、张明龙副教授、包劲松副教授、傅俊杰副教授、郭江峰副教授等曾给予热心的指导和帮助，在此向他们表示衷心的感谢。同时感谢研究生同仁卢美贞、姚艳玲、沈希宏、舒小丽、任学良、陈文岳、王彩霞、开美玲、汪海燕、朱小杨、赵海军、金基强、王玉华、刘庆龙、张琳琳、林宝刚、王雪艳、王桂荣、张磊、学妹张帆和学弟邵伟强、刘芦苇，还有朋友汪静儿、金沽，伴我度过了这段丰富多彩的日子．并给了我很多帮助。感谢周志丹先生和丁捷小姐在实验中的帮助。特别要感谢蒋爱兰女士三年来在日常工作生活中给予的帮助!最

4、后还要感谢我的家人、姑妈和姨妈姨父，是他们这么多年来一直对我的求学生涯给予不懈支持和鼓励，关怀和照顾我的生括，在此向他们表示最诚挚的谢意。忻稚2005年5月于浙大华家池缩略语ESTSSRgSSR表达序列标签(ExpressedSequenceTags)简单序列重复(SimpleSequenceRepeats)基因组SSR(geno谢cSimpleSequenceRepeats)EST-SSR表达序列标签SSR(ExpressedSequenceTagsSSR)PCR聚合酶链反应(PolymeraseChainReaction)A

5、FLP扩增片段长度多态性(AmplificationFragmentLengthPolymorphism)RFLP限制片段长度多态性(RestrictionFragmentLengthPolymorphism)RAPD随机扩增多态性DNA(RandomAmplifiedPolymorphicDNA)QTL数量性状位点(QuantitativeTraitLocus)CAP切割扩增多态性(CleavageAmplifiedPolymorphism)EST-SNPEST单核苷酸多态性(ESTSingleNucleotidePolymo

6、rphisms)EST-SSCPEST单链构象多态性(ESTSingleStrandConformationPolymorphism)YAC酵母人工染色体(YeastArtificialChromosome)NCBI美国国家生物技术信息中心(NationalCenterforBiotechnologyInformation)UTR非编码区(UntranslatedRegion)BSA分离群体分组分析法(BulkedSegregationAnalysis)CTAB十六烷基三甲基澳化铵(Cetyl—trimethylAmmonium

7、Bromide)Tris三羟甲氨基甲烷(Tris-hydrox3anethyl—aminomethane)EDTA乙二胺四乙酸(EthyleneDiamine-TetraceticAcid)TBETris硼酸EDTA(TrisBoricacidEDTA)4摘要利用现有的EST资源，首次在白菜中建立了2种EST分子标记——EsT—PCR标记和EST～SSR标记，比较了EST—PCR标记、EST—SSR标记和gSSR标记3种不同标记在白菜品种间显示多态性的能力，分析了多态性EST标记和gSSR标记在F2群体的分离，并对白菜EST—P

8、CR和EST—SSR标记对其它物种的通用性及EST—SSR标记在品种资源分析中的应用进行了探讨。主要结果如下：明确了白菜EST中SSR的类型、发生频率和特点。利用RepeatMasker对4584白菜EST进行了搜索，含有SSR的EST共434条，占EST总数的