利用ssr标记对中国水稻品种进行遗传多样性评价和品种分类的研究

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1、专论与研究DOI：10．3969~．issn．1006—8082．2010．04．005中目稻米2010，16(4)：19-24利用SSR标记对中国水稻品种进行遗传多样性评价和品种分类的研究江云珠汤圣祥余汉勇杨保军唐健(中国水稻研究所，浙江杭州310006；通讯作者，E—maj1：tanian@mai】_hz．zj．12／1)摘要：利用54个水稻SSR标记对来自我国六大稻区22个省(市)在20世纪30-90年代育出，并在水稻育种中具有重要利用价值的94份种质材料进行了研究，用以评价SSR标记在检测DNA多态性、鉴别品种类型及种质资源遗传多样

2、性的作用，了解中国常用育种材料的遗传多样性背景。54个引物对在供试品种上扩增得到3l1条多态性带，58个位点的平均等位基因数为5．36；各位点的平均多态性信息量(PIC)的变幅为0．452-0．833，平均值为0．647；94x94对基因型的遗传相似系数(SM)变幅为0．009～0．845，平均为O．259。利用UPGMA法进行聚类分析，可将供试材料分成两大类，分别符合于籼、粳类型，符合系数95．7％。结果表明，可以有效利用微卫星标记来检测DNA多态性，并进行品种鉴定及遗传资源多样性的分析；中国水稻品种种内具有较高的遗传多样性，但亚种内遗传

3、多样性偏低，其中籼稻内遗传多样性要比粳稻内遗传多样性高。关键词：SSR标记；遗传多样性；品种分类；水稻品种中图分类号：$323s511文献标识码：A文章编号：1006—8082(2010)04-0019-06遗传变异性是品种改良的基础口1。亲本材料遗传背传作图和种质的区别与鉴定【I8I。景日趋狭窄，既所谓的遗传衰变，是导致水稻育种进程本文报导了利用54个微卫星引物检测94个水稻缓慢，阻碍产量进一步提高的主要原因之一。虽然我选育材料的试验结果。研究目的如下：(1)微卫星在水国丰富的稻种资源是稻作研究和生产上的一大优势，稻DNA多态性检测上的作

4、用及特殊SSR引物在基因但生物多样性的逐渐丧失依然威胁着水稻生产。品种型鉴定上的作用；(2)对94份育种中具有潜能的育种的单一化也是导致流行性病害大规模发生的重要原材料进行SSR水平上的遗传多样性评估。因。因此，了解水稻常用育种材料的遗传背景、扩大遗l材料与方法传多样性是育种家的迫切需要。优异亲本间的遗传差异是以提高产量、优化品质1．1种子材料为目的的育种工作的首要条件。不管最终目的是得到96份水稻选育材料来自22省(市)代表了中国六常规品种还是杂交组合，水稻育种首先要求选用多种大水稻生产稻区从20世纪30年代到90年代广泛应多样的基因型材

5、料。利用检测亲本间相似性(GS)或遗用于生产的优异材料，至今在水稻育种中仍被育种家传距离，可以预测杂种后代超亲基因型的期望值。为了直接或间接利用。材料取自中国水稻研究所种质资源评估有利资源材料的遗传多样性，采用同工酶标记库，材料信息及系谱和来源见表1。或其它分子标记如RFLP[~、RAPDlSJ、AFLpI9j。简单序列1．2基因组DNA提取长度多态性(SinpleSequencelengthPolymorphism)亦称利用改良CTAB方法对发芽6～10d的材料取芽为SSR(SimpleSequenceRepeats，简单序列重复)，已经

6、进行DNA微量提取㈣，用于PCR分析。成为植物遗传研究中重要的遗传标记I21。比较研究发1．3SSR分析现，在植物中，SSR标记更具有多态性，为共显性标从Comell大学提供439对水稻SSR引物中随机记，该技术具有简便、快速、稳定性高等特点，已经广泛选取分布于12条染色体上的54个引物对进行SSR分应用于遗传多样性分析和系统学研究㈣。近年来，相继析。PCR产物经4％的聚丙烯酰胺变性凝胶电泳，银染报道了小麦㈣、高粱、黄瓜、大麦【-51等几个自花授粉作物检测方法参照Panaudp~]。的平均等位基因数，在水稻上，WuIq和Yang等率先1．4

7、统计分析进行SSR分析，其后大量的试验表明不同的水稻基因型存在着丰富的SSR多态性，可以很好地用于水稻遗收稿日期：2010—03—22·19·江云珠等：利用SSR标记对中国水稻品种进行遗传多棒l眭评价和品种分类的研究中固私米2010，16(4)：19_24表I供试材料的籼粳类型、来源地、亲本和发放年份编号品种名称来源亲本籼／粳发放编号品种名称来源亲本籼，粳发放年分年分34南特号江西农科院鄱阳早系选籼I93442金优1号广西农科院金早4号，金粳1号籼70·s37胜利籼湖北华中农大胜利籼提纯籼193645香药糯江苏武进稻麦育种场02428／中明

8、6偏籼70·sl4陆财号福建仙游山尾公社南特号单穗选籼194848绍糯2号浙江绍兴农科所龙菲313／矮泉糯籼19745广场13广东华南农科所胜利籼／南特号籼5Ors53字红3号江