基于SSR标记的板栗地方品种遗传多样性与关联分析

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1、园艺学报，2015，42(12)：2478–2488.ActaHorticulturaeSinica2478doi：10.16420/j.issn.0513-353x.2015-0484；http：//www.ahs.ac.cn基于SSR标记的板栗地方品种遗传多样性与关联分析111,*2江锡兵，汤丹，龚榜初，赖俊声12（中国林业科学研究院亚热带林业研究所，浙江省林木育种技术研究重点实验室，杭州311400；庆元县林业局，浙江庆元323800）摘要：采用SSR标记对山东等10个省份95个板栗地方品种的遗传多样性、群体结构进行分析，并进行板栗18个农艺性状与SSR标记关联分析。结

2、果表明：（1）17对SSR引物在95个板栗品种中检测出44个等位位点，平均为2.6个，Shannon’s指数（I）和多态性信息含量（PIC）平均值分别为0.67和0.352，遗传多样性较为丰富；（2）山东群体和江苏群体的多态性位点比率（P）最高，均达到94.12%，观察等位基因数（Na）分别为2.53和2.18，亦高于其他群体；（3）根据Evanno等统计模型，92个板栗品种被划分为3个亚群，分别包含25、40和27个品种，且均有着复杂的地理起源，另有3个品种没有明确的类群归属；（4）利用GLM和MLM模型进行关联分析，并经过假阳性检验，发现叶柄长度和淀粉含量分别与标记CsC

3、AT5和CsCAT22显著关联，关联系数分别为0.4027和0.1869。关键词：板栗；SSR；遗传多样性；群体结构；关联分析中图分类号：S664.2文献标志码：A文章编号：0513-353X（2015）12-2478-11GeneticDiversityandAssociationAnalysisofLocalCultivarsofChineseChestnutBasedonSSRMarkers111,*2JIANGXi-bing，TANGDan，GONGBang-chu，andLAIJun-sheng1（ResearchInstituteofSubtropicalFore

4、stry，ChineseAcademyofForestry，KeyLaboratoryofTreeBreedingofZhejiang2Province，Hangzhou311400，China；ForestryAdministrationofQingyuanCounty，Qingyuan，Zhejiang323800，China）Abstract：Geneticdiversityandpopulationstructureof95localcultivarsofChinesechestnut（CastaneamollissimaBL.）from10provinces，suc

5、hasShandongetc.，wereanalyzedusingSSRmarkers，andassociationanalysiswasconductedwith18agronomictraits，alloftheselaidthetheoreticalbasisforrationaluseandprotectionofthegermplasmresources，andmolecularmarker-assistedbreedingofChinesechestnut.Theresultsshowed：（1）Forty-fouralleliclociweredetectedf

6、rom95chestnutcultivarsin17SSRmarkers，theaveragewas2.6，andthemeanofShannon’sindex（I）andpolymorphisminformationcontent（PIC）were0.67and0.352，respectively，whichrevealthatthegeneticdiversitywereabundant；收稿日期：2015–08–03；修回日期：2015–12–10基金项目：浙江省竹木农业新品种选育重大科技专项重点项目（2012C12908-18）；中国林业科学院亚热带林业研究所基本科研

7、业务费专项资金项目（RISF61253）*通信作者Authorforcorrespondence（E-mail：gongbc@126.com）致谢：感谢山东省果树研究所刘庆忠研究员、陈新助理研究员为本研究提供板栗资源名称和试验材料。江锡兵，汤丹，龚榜初，赖俊声.基于SSR标记的板栗地方品种遗传多样性与关联分析.园艺学报，2015，42(12)：2478–1488.2479（2）PercentageofpolymorphiclociofShandongandJiangsupopulationreachth