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《草菇锰过氧化物酶编码基因生物信息学分析及其转录水平和酶活性的测定new》由会员上传分享，免费在线阅读，更多相关内容在教育资源-天天文库。
1、菌物学报jwxt@im.ac.cn15September2013,32(5):919-927Http://journals.im.ac.cnMycosystemaISSN1672-6472CN11-5180/Q©2013IMCAS,allrightsreserved.·简报Shortcommunication·草菇锰过氧化物酶编码基因生物信息学分析及其转录水平和酶活性的测定1,222222*朱刚吴林陈明杰汪虹谭琦鲍大鹏1上海海洋大学食品科学与工程学院上海2013062国家食用菌工程技术研究中心农业部南
2、方食用菌资源利用专业重点实验室上海市农业遗传育种重点开放实验室上海市农业科学院食用菌研究所上海201403摘要：在草菇全基因组中发现了4个担子菌锰过氧化物酶MnP基因同源物（vv-mnp1、vv-mnp2、vv-mnp3和vv-mnp4）的基础上，对这4个MnP进行了生物信息学分析，并对其基因表达和酶活性进行测定。结果表明vv-mnp1与vv-mnp2基因结构相同，vv-mnp3与vv-mnp4基因结构相似。在4个草菇MnP基因启动子区域存在AP-2、cAMP、MRE、XRE和HSE等调控元件，预示着
3、草菇中MnP基因的转录可能会受到氮源、碳源、重金属离子、芳香族化合物以及热击的影响。草菇MnP具有信号肽，不存在跨膜区域，表明其是分泌蛋白。草菇MnP中形成4个二硫键的8个半胱氨酸、潜在的锰离子和钙离子结合位点，在担子菌MnP中高度保守。系统进化树分析显示草菇MnP1和MnP2与香菇MnP1亲缘关系最近，而MnP3和MnP4与灰盖鬼伞过氧化物酶有较近的亲缘关系。RT-PCR检测到vv-mnp1、vv-mnp3与vv-mnp4能在含锰离子的培养基中表达，但运用锰离子氧化法没有检测到MnP活性，推测草菇中
4、的MnP不具有将2+3+Mn氧化成Mn的能力。关键词：草菇，锰过氧化物酶，生物信息学，RT-PCRBioinformatic,geneexpressionandenzymeactivityanalysesofmanganeseperoxidasesinVolvariellavolvacea1,222222*ZHUGangWULinCHENMing-JieWANGHongTANQiBAODa-Peng1CollegeofFoodSciencesandTechnology,ShanghaiOceanUni
5、versity,Shanghai201306,China2NationalEngineeringResearchCenterofEdibleFungi;KeyLaboratoryofAppliedMycologicalResourcesandUtilization,MinistryofAgriculture;ShanghaiKeyLaboratoryofAgriculturalGeneticsandBreeding;InstituteofEdibleFungi,ShanghaiAcademyofAgr
6、iculturalSciences,Shanghai201403,ChinaAbstract:Weidentifiedfourputativemanganeseperoxidases（MnP）inthegenomeofthestrawmushroomVolvariella基金项目：上海市科委重点项目（No.10dz2212400）；上海市农委重点攻关项目[沪农科攻字（2011）第1–2号]*Correspondingauthor.E-mail:baodp@hotmail.com.cn收稿日期:201
7、2-07-25,接受日期:2012-10-26920ISSN1672-6472CN11-5180/QMycosystemaSeptember15,2013Vol.32No.5volvacea,andfurtheranalyzedtheirbioinformatictraits.Themnpgeneexpressionandenzymeactivityanalyseswerealsoconductedinthisstudy.TheupstreamregionofmnpgenesofV.volvaceac
8、ontainsputativeAP-2,cAMP,MRE,XREandHSEresponseelements,whichareknowntobeinvolvedinregulationofcarbon,nitrogen,heavymetalionsandaromaticcompounds.EachMnPproteinhasasignalpeptidebutwithouttransmembranehelices,suggestingtheyarethese
