利用酵母双杂交系统筛选甘蓝型油菜atp6的相互作用蛋白质

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1、2010年7月四川大学学报(自然科学版)Ju1.2010第47卷第4期Journa1ofSichuanUniversity(Natura1ScienceEdition)Vo1.47No.4doi:103969/j.issn.0490—6756.2010.04.041利用酵母双杂交系统筛选甘蓝型油菜ATP6的相互作用蛋白质孙力,李娜娜,余渝,柴靓,王健美,杨毅,李旭峰(四川大学生命科学学院生物资源与生态环境教育部重点实验室,成都610064)摘要:通过酵母双杂交系统,以ATP6作为诱饵蛋白筛选与ATP6有相互作用的蛋白质.通过筛选和鉴定,获得了5个与ATP6有相互作用的蛋白质.其中一个与拟南

2、芥中内质网膜上的蛋白转运复合体中的口亚基(Sec61a)有很高的相似性.通过TAILPCR和设计简并引物扩增初步得到了甘蓝型油菜Sec61a全长基因组序列和cDNA序列.并利用生物信息学分析手段对甘蓝型油菜Sec61a进行了比对和分析,推测该蛋白质可能参与了花粉的发育过程.关键词:ATP6;酵母双杂交;细胞质雄性不育;Sec61a;TAILPCR中图分类号:Q78文献标识码:A文章编号:0490—6756(2010)04—0899—07ScreeningofproteinsinteractingwithATP6inBrassicanapusbyyeasttwohybridsystemSUN

3、Li,LNa—Na,yUYu,CHAILiang,WANGJian—Mei,YANG,LXu—Feng(KeyLaboratoryofBio—ResourceandEco—EnvironmentofMinistryofEducation,CollegeofLifeSciences,SichuanUniversity,Chengdu610064,China)Abstract:Yeast—Two—Hybrid—Systemwasemployed,withATP6asabaitprotein,toscreenproteinswhichwouldinteractwithATP6.Fiveposit

4、iveproteinswereobtainedandoneofthemwasfoundtohavehighsimilaritywithputativeasubunitofproteintranslocationcomplex(Sec61a)inendoplasmicre—ticulumofArabidopsisthaliana.Then,TAILPCRandgradationPCRwithdegeneratedprimerwereusedtoamplifythecompletecDNAandgenomicDNAsequenceswhichwereanalyzedbymeansofbioin

5、—formatics,inferringthatthisproteinmaybeinvolvedinthedevelopmentofpollen.Keywords:ATP6,Yeast—Two—Hybrid,CMS,Sec61a,TAILPCR具有很高的实用价值.油菜(BrassicanapusL.)是1引嗣世界上重要的油料作物之一,对于油菜中雄性不育细胞质雄性不育(cytoplasmicmalesterility,的研究有重大意义[1].到目前为止越来越多的研究CMS)是广泛存在于高等植物中的一种自然现象,表明线粒体DNA(mitochondria1DNA,mtDNA)表现为母体遗传、花

6、粉败育和雌蕊正常,这种遗传与其表达产物与CMS相关[2].通过比较分析限制特点可以在杂交育种中免去人工去雄的繁杂工作,性内切酶水解线粒体的基因组DNA得到的物理提高杂交种子的纯度和保证杂种一代的增产效应,图谱,发现与CMS相关的线粒体DNA序列大都收稿日期2009-03—24基金项目国家自然科学基金项目(30971816,30740056)作者简介孙力(1983一),四川成都人,四JJI大学生命科学学院遗传学专业2006级硕士研究生通讯作者李旭峰.E—mail:yangyi528@vip.sina.corn900四川大学学报(自然科学版)第47卷和编码ATP合成酶亚基的基因ATP6相关[3

7、“].2.2实验方法在高粱和水稻中,ATP6被证实与育性相关.6].在构建dscDNA文库,诱饵载体(pGBKT7一甘蓝型油菜体细胞杂合子也发现油菜波里马CMSATP6),并将诱饵载体转化到酵母菌株AH109.株系的后代都含有0l尺F224/ATP6座位,而且该以上步骤由本实验室其他师生完成n。J.位点与植株CMS性状高度连锁].在油菜波里马用经过验证的带有pGBKT7一A丁P6的CMS株系中,ATP6与0RF224“共

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