长非编码rna rian_irm在骨骼肌发育中的功能初步研究

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1、硕士学位论文长非编码RNARian/Irm在骨骼肌发育中的功能初步研究THEPRELIMINARYFUNCTIONSTUDYOFLONGNONCODINGRNARian/IrmINTHEMUSCLEDEVELOPMENT秦庚哈尔滨工业大学2015年6月国内图书分类号:Q71学校代码:10213国际图书分类号:577.21密级:公开理学硕士学位论文长非编码RNARian/Irm在骨骼肌发育中的功能初步研究硕士研究生:秦庚导师:陈岩副教授申请学位:理学硕士学科:生物学所在单位:生命科学与技术学院答辩日期:2015年6月授予学位单位:哈尔滨工业大学ClassifiedIndex:U.D.C

2、:DissertationfortheMasterDegreeinScienceTHEPRELIMINARYFUNCTIONSTUDYOFLONGNONCODINGRNARian/IrmINTHEMUSCLEDEVELOPMENTCandidate:QinGengSupervisor:AssociateProf.ChenYanAcademicDegreeAppliedfor:MasterofScienceSpeciality:BiologyAffiliation:CollegeofLifeScienceandTechnologyDateofDefence:June,2015Degre

3、eConferringInstitution:HarbinInstituteofTechnology哈尔滨工业大学理学硕士学位论文摘要Rian是一个母源表达的长非编码RNA(longnon-codingRNA,lncRNA),位于小鼠12号染色体,包括Irm,Meg8和AB063319三个长转录本。大量研究数据显示,其参与多种生物学过程的调控。前期研究发现,作为Rian的主要转录本,Irm在骨骼肌发育的重要时期高表达并且在骨骼肌整个发育过程中呈上升趋势,然而在骨骼肌发育成熟后其表达水平较低,这与许多骨骼肌发育的调控基因的时空表达特点相一致,提示Irm在骨骼肌发育过程中Irm在具有特殊

4、作用。本研究以小鼠肌源性细胞系C2C12和小鼠原代骨骼肌细胞为实验材料,首先检测了Irm在体外骨骼肌细胞增殖分化过程中的表达规律;其次通过改变内源Irm的表达水平,研究其对骨骼肌细胞增殖、迁移和分化等生物学过程的影响;最后采用全基因组表达谱芯片测序的方法筛选骨骼肌发育相关的差异基因,探讨了Irm对骨骼肌细胞增殖分化可能的作用机制。形态学观察及结果分析表明,过表达Irm可以导致骨骼肌细胞增殖和迁移能力的下降,但是在一定程度上促进了骨骼肌细胞的终末端分化,同时使肌调节因子MyoD和Myogenin的表达上调;而干扰Irm则在一定程度上促进了细胞增殖和迁移,但是会明显抑制骨骼肌细胞的分化能

5、力,并且使肌调节因子MyoD和Myogenin的表达显著下调。通过芯片数据分析及qRT-PCR验证,发现Irm表达水平的改变会影响p38MAPK信号通路上下游基因的表达。综上所述,Irm既可以对骨骼肌细胞的增殖和迁移能力产生一定负调控作用,也可以对骨骼肌细胞的分化能力产生正调控作用,这一过程可能是通过p38MAPK信号通路完成。这些研究结果对lncRNA的深入研究以及为发育、疾病和进化中lncRNA的重要性的研究提供新的依据。关键词:长非编码RNA;Rian;Irm;骨骼肌发育;基因芯片-I-哈尔滨工业大学理学硕士学位论文AbstractRianisanidentifiedmater

6、nalexpressedlongnon-codingRNA(lncRNA),whichislocatedinmousedistalchromosome12.AnditcontainsthreeoflongtranscriptsIrm,Meg8andAB063319.AlargestudyshowedthatRianplaysanimportantroleincontrollingbiologicalprocesses.Onthebasisofothers'researchachievements,asthemaintranscriptofRian,Irmisfrequentlyexp

7、ressionindevelopingskeletalmuscleandtheexpressionisrising.ButinthematureskeletalmuscleIrmislowexpression,whichisinagreementwithmanygenes,whichareregulatedtodevelopmentofskeletalmuscle,suggestingIrmplaysanimportantroleinskeletalmus

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