刺参消化道及养殖环境细菌多样性分析及一株新菌株的鉴定

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1、分类号：Q93密级：公开单位代码：10422学号：201114317硕士学位论文论文题目：娘剃妣遁及豸殖群钐动彩摊锄圾，挣劾劲埠作者姓名砺砌群作者姓名反彻解学院名称!鱼叠垄堕专业名称丝叁垒丝望指导教师合作导师2014年5月16日厶itZ至硕士学位论文原创性声明本人郑重声明：所呈交的学位论文，是本人在导师的指导下，独立进行研究所取得的成果。除文中已经注明引用的内容外，本论文不包含任何其他个人或集体已经发表或撰写过的科研成果。对本文的研究作出重要贡献的个人和集体，均已在文中以明确方式标明。本声明的法律责任由本人承担。论文作者签名：垄』勿丝Et论文作者签名：丛!型缉

2、期：丝!垒：!：堑关于学位论文使用授权的声明本人完全了解山东大学有关保留、使用学位论文的规定，同意学校保留或向国家有关部门或机构送交论文的复印件和电子版，允许论文被查阅和借阅；本人授权山东大学可以将本学位论文的全部或部分内容编入有关数据库进行检索，可以采用影印、缩印或其他复制手段保存论文和汇编本学位论文。(保密论文在解密后应遵守此规定)论文作者签名：爱励哗导师签名：枷节日期：Mj矽。量z呈硕士学位论文目录摘要⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯IABSTRACT⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．．m缩略

3、词⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯V第一章绪论⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．11．1海参肠道及其养殖环境细菌多样性的研究现状⋯⋯⋯⋯⋯⋯11．2菌落物种多样性的研究⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．．21．2．1细菌的纯培养方法⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．．21．2．2BIOLOG微平板法⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．2l-2．3PLFA法⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯31．2．4RFLP技术⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．31．2．5RAPD技术⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．41．2．6AFLP技术⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．41

4、．2．7PCR—DGGE技术⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯41．2．8前景展望⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯51．3细菌新物种的分类鉴定⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．．51．3．1新菌的定义及命名⋯⋯．⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．51．3．2新菌的分类⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．．61．3．3新菌的分类鉴定⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．6第二章刺参肠道及养殖环境异养细菌多样性的比较研究⋯⋯⋯⋯．．92．1实验材料⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．．92．1．1培养基⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯92．1．2主要仪器⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．92．2试验方法⋯⋯⋯⋯

5、⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．102．2．1样品采集⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯102．2．2样品处理⋯⋯⋯⋯⋯⋯．⋯⋯⋯．⋯⋯⋯⋯⋯．102．2．3菌株的分离纯化及保藏⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯10厶f只互硕士学位论文2．2．4弧菌属的筛选⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．．102．2．5细菌的16SrDNA序列测定⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．102．2．6细菌多样性指数计算⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．．112．3实验的结果与分析⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．．112．3．1细菌的分离及弧菌属的筛选⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．．112．3．2刺参肠道与养殖环境底泥弧菌变化情况⋯⋯⋯⋯⋯⋯．

6、122．3．3养殖池底泥随季节可培养微生物类群的多样性的变化及特征．132．3．4刺参肠道与养殖环境底泥细菌多样性比较⋯⋯⋯⋯⋯．．152．4结果讨论⋯．⋯⋯．⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．．．．⋯⋯⋯．152．4．1刺参肠道及其生长环境茵系趋势⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．15第三章养殖池底泥及富集过程中细菌多样性研究⋯⋯⋯⋯⋯⋯．173．1实验材料⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．173．1．1样品⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．173．1．2所需培养基⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．173．1．3实验所需试剂⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．．173．2实验方法⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯

7、⋯．．⋯⋯⋯．．173．2．1样品处理⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯173．2．2菌株的分离纯化与保藏⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯173．2．3实验数据记录⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．⋯⋯．183．3样品分析及结果⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．183．3．1可培养微生物的分类⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．．183．3．2宏基因组分析⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．．183．4实验结果的分析讨论⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯24第四章海洋细菌新属新种一一威海海洋菌(Pelagimicrobitnnweihaiensis)C4的鉴定⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．274．1实验材料⋯⋯⋯⋯⋯⋯

8、⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．274．i．1材