基于随机扩增多态dna标记研究的我国不同地方群体黄鳝的遗传多样性差异

基于随机扩增多态dna标记研究的我国不同地方群体黄鳝的遗传多样性差异

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时间:2019-02-27

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1、上海水产大学硕士学位论文基于随机扩增多态DNA标记研究的我国不同地方群体黄鳝的遗传多样性差异姓名:韦荣编申请学位级别:硕士专业:水生生物学指导教师:邱高峰;楼允东2002.6.18摘要本文首次从群体水平上应用随机扩增多态DNA标记技术研究了我国境内盐城、绵阳、保定、宿迁、安顺、邵阳及南宁7个不同地区黄鳝群体的遗一传多样性及遗传差异。佣了50个随机引物筛选出13个作分析,在72个个体弋中检测到122个多态位点,从各个群体检测到的位点的多态性来看,多态比例最高的为盐城及绵阳群体的同为82.79%,其次为保定、宿迁、南宁群体的66.3

2、9%,57.38%,38.52%,最小的为安顺群体的37.70%及邵阳群体的29.5l%。7个群体之间的遗传距离最大者为南宁~安顺群体对的O.6199,遗传距离最小的为保定一宿迁群体对的0.0485,平均为0.3505。以群体间的遗传距离用UPGMA法构建的系统树,首先是保定群体与宿迁群体聚在一起再和盐城群体聚,然后与安顺群体聚,再与绵阳群体聚,之后与邵阳群体聚,最后与南宁群体相聚。NJ法构建的结果也基本如此。群体内个体的平均遗传距离最大者为绵阳(0.5130)及盐城(0.4139)群体,其次为保定(0.2503)、南宁(0.2

3、314)、宿迁(o.2284)群体,群体内个体间遗传距离最小的为邵阳(0.1782)及安顺(0.1524)群体。在按地理分布划分的3个区组中,同一区组内群体间的遗传距离最大者为中南组,遗传距离最小的为东部组。7群体黄鳝的遗传距离与地理距离有一定的相关性,但相关性较小。通过Mantel检验发现这些黄鳝群体的遗传距离与地理距离遵从“地理距离引起分化”模式(Isolation—by-distancemodel)。推测由地理距离隔离群体间存在一定程度的遗传分化,但还不是很大。,无论以地理分布区划或以生活环境(平原、山区)区划,在包括区组

4、、群体、个体三阶元的总体遗传变异分析(AMOVA)均得知,最大的变异来源i于群体内个体之间,其次为区组内群体之间,最小的变异来自于区组之间。以地理分布区划对总变异的来源进行定量分析表明,绝大部分的变异(61.72%)来源于各群体内的个体之间,其次来源于各区组内群体之间(27.90%),最小的变异来源于各区组之间(10.38%)。群体遗传的多样性的Shannon信息指数分析,也发现多样性信息指数是绵阳群体(0.4568)与盐城群体(0.4251)最高,其它群体的多样性信息指数大小依次为,保定(O.3515)、宿迁(0.3028)、

5、南宁(0.2019)、安顺(0.1946)及邵阳(0.1551)群体。在按地理分布划分的三个区组的遗传多样性分析中最大者为西南组(I=0.4722),东部组居中(0.4298),最小的为中南组(0.3204)。而这三个区组内群体之间的遗传分化程度最大的为中南组(Gst=O.4569),其次为西南组(0.3194),东部组排在最小(O.1366)。7个黄鳝群体从整体上来分析,群体间显示了一定程度的遗传分化(Gst=0.1798),群体间也存在一定的基因流,数目为2.2813个。但这个基因流水平不足以抵消整体水平上群体的分化。山区地

6、区的遗传多样性(I=0.4731)比平原地区(0.4298)要大,遗传分化程度(0.4714)也比平原组的(0.1366)大,群体间的基因流数目则是平原组(3.1599)比山区组(0.5607)为大。另外,还找到了两个地方群体(安、顺、南宁群体)黄鳝的群体特异RAPD标记,可作为群体鉴定的依据。广1广一本研究表明了目前我国各地的黄鳝遗传多样性及遗传资源比预计的由于近亲繁殖、农药污染及过度捕捞引起的衰退要好。从整体上来说目前中国大陆境内的黄鳝资源还具有比较丰富的遗传多样性。本研究结果可为我国黄鳝ff,j}q,质资源保护,选择育种,

7、指导人工繁殖及养殖实践提供基础资料。关键词:黄鳝,群体,遗传多样性,遗传差异,中国大陆,RAPD,分子标记●,

8、I●●,f。,■t,■,事●v,●-0■J薯',0蕾●·●!AbstractWefirstlyreportthegeneticdiversityandgeneticvariationofMonopterusalbusof7different1.egionsinChina—Yancheng(YCinshort),Mianyang(MY),Banding(BD),Suqian(SQ)Anshun(AS),Shaoyang(

9、SH)andNanning(NN)一basedonrandomlyamplifiedpolymorphicDNAmarkeranalysis.13arbitrateprimerswasusedtodetect122polymorphiclociin72indiv

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