黄鳝黄鳝群体遗传结构的研究

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1、分类号Ｑ３４密级ＵＤＣ编号１０４８６博士学位论文黄缮黄鳝？群体遗传结构的研冗研究生姓名：陈锋指导教师姓名、职称：周荣家教授程汉华教授专业名称：遗传学研究方向：动物及人类分子发育遗传学二〇＿六年十月学位论文使用授权书一（式两份，此份交《中国博士学位论文全文数据库》期刊社存档）本论文作者完全了解学校关于保存、使用学位论文的管理办法及规定，即学校有权保留并向国家有关部门或机构送交论文的复印件和电子版，允许论文被査阅和借阅，接受社会监督。本人授权武汉大学可以将本学位论文的部分或全部内容编入学校有关数据库和收

2、录到《中国博士学位论文全文数据库》进行信息服务，也可以采用影印、缩印或扫描等复制手段保存或汇编本学位论文。一□两年／□三年以后。本论文提交□当年／□年／，同意发布一年以后同意发布若不选填则视为。Ｚ注：保密学位论文，在解密后适用于本授权书。作者签名：导师签名：。２年丨月曰＜＾武汉大学研究生学位论文作者信息论姻Ｈ群許遙食菇＃如蚪钇羲姓名学号答辩曰期＞丨石年土月占Ｉ曰￥论文级别博士５＾硕士口院／系／所＾＾１１ＩＩ联系电话Ｅ＿ｍａｉｌ通信地址（邮编＞备注：ＣｌａｓｓｉｆｉｅｄＴａｘｏｎｏｍｉｃ

3、Ｎｏ．Ｑ３４ＧｒａｄｅＵＤＣＳｅｒｉａｌＮｏ．１０４８６ＷＵＨＡＮＵＮＩＶＥＲＳＩＴＹＤＩＳＳＥＲＴＡＴＩＯＮＦＯＲＤＯＣＴＯＲＡＬＤＥＧＲＥＥＰｏｕｌａｔｉｏｎＧｅｎｅｔｉｃＳｔｒｕｃｔｕｒｅｏｆＳｗａｍＥｅｌｐｐＭｏｎｏｐｔｅｒｕｓＡｌｂｕｓ｛）ＤｏｃｔｏｒａｌＣａｎｄｉｄａｔｅ：ＦｅｎｇＣｈｅｎＳｕｐｅｒｖｉｓｏｒｓ：ＰｒｏｆｅｓｓｏｒＲｏｎｇｉａＺｈｏｕｊＰｒｏｆｅｓｓｏｒＨａｎｈｕａＣｈｅｎｇＳｅｃｉａｌｉｔ：ＧｅｎｅｔｉｃｓｐｙＳｕｂｅｃｔ：ＭｏｌｅｃｕｌａｒａｎｄＤｅｖｅｌｏｍ

4、ｅｎｔａｌＧｅｎｅｔｉｃｓｊｐＡｒｉｌＴｅｎｔｈ２０１６ｐ，论文原创性声明本人的学位论文是在导师指导下独立撰写并完成的，学位论文没有剽窃、抄袭、造假等违反学术道德、学术规范和侵权行为，否则，。本人愿意承担由此而产生的法律责任和法律后果，特此郑重声明学位论文作者：年丨。月曰砰本论文的创新点１、具有ＩＮＤＥＬ或ＳＮＰ的基因比没有ＩＮＤＥＬ或ＳＮＰ的基因表达量高。本研宄Ｔ－－利用ｒｉｎｉｔ、兼性Ｓｅｎｏｖｏ组装，ｙ对黄鳝雌性、雄性三组ＲＮＡｑ数据进行Ｄｅ然后将组装结果与参考基因组Ｂｌａｓｔ，首次幵发黄鳝编码区的ＩＮＤＥＬ或ＳＮＰ标记。然后，

5、比较含有ＩＮＤＥＬ或ＳＮＰ标记的基因与不含ＩＮＤＥＬ和ＳＮＰ标记的基因表达量，发现前者比后者要高很多，而且具有极显著差异。这可能是因为相对低表达基因，表达量高的基因长期处于活跃状态，ＤＮＡ双链打开，因此更容易产生ＳＮＰ或ＩＮＤＥＬ。２一、黄鳝在个小群体中繁殖后代，群体内趋于纯化。ＩＮＤＥＬ标记在各个黄鱔群体的基因型分析结果说明黄鲭基因纯化现象明显，遗传上显著性偏离Ｈａｒｄ－Ｗｅｎｂｅｒ，ｙｉｇ平衡。结合黄鳝自身生理形态特点黄鱔可能是在小群体中繁殖。３、黄鳝核基因组多样性较低，而在水陆交通发达的地区黄鳝核基因组多样性相ＤＮＡＤ－对较高。线粒体ｌｏｏｐ单体

6、型显示武汉、合肥、南京、台湾以及三明黄鳝多样性较高，达州和重庆黄鳝多样性较低；核基因ＩＮＤＥＬ标记分析显示合肥、南京、达州、重庆、台湾三明黄鳝由于长期在小群体繁殖多样性较低，而武汉黄鳝由于群体间交流频繁导致多样性相对较高。目录ＩＡｂｓｔｒａｃｔＩｌｌ一１第章前言１黄鳝生物学特性对遗传结构的影响１ｌ．ｉ１黄鳝的迁徙能力及其与遗传结构的关系１．２黄鳝人为迁徙对遗传结构分析的千扰１１．３２黄鳝特殊的生殖方式２、２转录组测序分析及应用．２１ＲＮＡ分类３２．２ＲＮＡ研究方法发展历程３－２＿３ＲＮＡＳｅ的测序流程

7、和策略ｑ４２－．４ＲＮＡＳｅ测序结果分析７ｑ２－．５ＲＮＡＳｅ技术的应用１１ｑ３线粒体基因组结构，遗传方式及在物种鉴定和演化研究中的应用１４．３１黄轄ｍｔＤＮＡ结构１４３．２ｍＤＮＡ１５ｔ遗传方式３．３ｍＤＮＡ在１６ｔ物种鉴定和演化研究中的优势４１７核基因组遗传标记的种类及其在物种鉴定和演化中的应用４．１核基因组分子标记的种类１８４．２人类基因组ＩＮＤＥＬ和ＳＮＰ开发的流程