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时间:2019-02-19
《rna干扰survivin基因表达对肝癌细胞放射敏感性影响》由会员上传分享,免费在线阅读,更多相关内容在行业资料-天天文库。
1、第1章材料与方法1.1材料1.1.1主要试剂与仪器标准胎牛血清杭州四季青生物工程材料有限公司RPMI1640培养基美国Gibco公司磷酸盐缓冲液北京中杉金桥生物技术有限公司胃蛋白酶(1:30)北京中杉金桥生物技术有限公司胰蛋白酶(1:100)北京中杉金桥生物技术有限公司Lipofectamine2000转染试剂盒Invitrogen公司OPTI—MEMI优化培养基Invitrogen公司四甲基偶氮唑蓝(MTT)Sigma公司Trizol试剂Invitrogen公司细胞周期与凋亡检测试剂盒碧云天RT—PCR试剂盒大连宝生生物工程有限公司小分子量蛋白MarkerGalen公司二氧化碳培养箱美国T
2、hermoElectronCorporation公司液氮罐美国ThermoElectronCorporation公司电子分析天平(卧式,BP3100S)SartoriusBasicplus,Germany高速离心机上海医用仪器生产厂恒温磁力搅拌器Heidolph,Germany细胞培养瓶美国Corning公司倒置显微镜0LYMPUS公司恒温水浴箱北京医疗设备厂台式微称量天平上海天平仪器厂BTY-S.D.1000KT型超净工作台国家海洋局第一海洋研究所高压消毒柜MicromseriesSA一300凝胶成像系统KodakEDAS290酶标检测仪BIO-RAD流式细胞仪(B.D.Vantage型)
3、Becton—DiksonFACSVantageUSAPCR扩增仪美国RE公司2ul,10
4、l1,200ul,1000u121:I样枪LabsystemsFinland1青岛大学硕士学位论文1.1.2细胞株人肝癌细胞株HepG2由青岛大学医学院附属医院中心实验室提供,在RPMI1640培养液(含体积分数为0.10胎牛血清)中培养,置于37。C体积分数为0.05的C0:温箱中,每2-3天传代一次,选用处于对数生长期的肝癌细胞开始实验。1.2方法1.2。1重组质粒的构建根据RNA设计原则及survivin基因(NM一001168)编码序列,利用BLAST进行查询,并以前期实验结果为依据畸1,特异
5、性的合成1对针对survivin编码序列的siRNA片段,并构建survivin基因的重组载体pshRNA—survivin一387,基因靶点位于survivin基因序列第387位点,靶基因序列为5’一GAAAGTGCGCCGTGCCATC一3’。重组载体两端设有BarnHI或Bbs工酶切位点,以利于与pGPHl/GFP/Neo载体连接。按照实验设计,由上海吉玛公司构建合成阴性对照表达载体pshRNA—survivin—NC及阳性对照表达载体pshRNA-survivin-GAPDH。三种重组质粒包含绿色荧光蛋白的表达框架,转入细胞后可表达绿色荧光蛋白,用荧光显微镜可确定转染效率。图1pGP
6、HI/GFP/Neo载体绪构1.2.2细胞分组和转染4第1章材料与方法转染前24h,取处于对数生长期的HepG2细胞,传代接种于6孔板,2ml无抗完全培养基,使细胞数约5×105个/每孔,培养于37。C、含体积分数0.05C02培养箱中,转染时细胞融合度达到70"--'90%。分别设置空白对照组(不加液体)、阴性对照组(每孔加pshRNA—survivin—NC4ug)、siRNA转染组(每孑LJJnpshRNA-survivin一3874ug)。每组各设5个复孔,转染过程按Lipofectamine2000转染试剂盒说明书进行。质粒(ug)与脂质体(u1)的比例为l:2.5。转染后将细胞板
7、置于培养箱中培养,孵育4—6h后除去复合物,更换培养基,转染24-48h后于荧光显微镜下计算转染效率。1.2.3RT-PCR技术检测surviVinmRNA水平转染48h后分别收集3组细胞,调整细胞浓度为107/L,采用TrizoL法提取总RNA。RT反应体系为20uL(包括提取的RNA2uL,PrimescriptRTaseluL、OligodTlul、dNTPlul和适量5*RTbuffer、氯化镁),混匀,于PCR仪上行RT反应,反应条件:42℃60min,95℃5min,终止反应合成eDNA。PCR扩增体系为50uL,反应条件:94。C变性30s,55。C退火45s,72"(2延伸1
8、min,共35个循环。取PCR产物,在含EB的20g/L的琼脂糖凝胶中电泳分离后,以凝胶成像系统分析结果。PCR扩增引物由上海生工生物工程技术服务有限公司合成,上游引物序列:5’一TCAAGGACCAcCG—CATCTCTA一3’,下游引物序列:5’一CCAGCTCCTT—GAAGCAGAAGAA一3’。以GAPDH作为内参照。应用分析软件进行相对定量分析,survivinmRNA水平以survivin产物量
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