mirna155在nkt细胞淋巴瘤中表达及意义

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1、学位论文原创性声明本人郑重声明：所呈交的学位论文，是本人在导师的指导下，独立进行研究所取得的成果。除文中已经注明引用的内容外，本论文不包含任何其他个人或集体已经发表或撰写过的科研成果。对本文的研究做出重要贡献的个人和集体，均已在文中以明确方式标明。本声明的法律责任由本人承担。学位论文作者：够＼日期：wr3年c，月77日学位论文使用授权声明本人在导师指导下完成的论文及相关的职务作品，知识产权归属郑州大学。根据郑州大学有关保留、使用学位论文的规定，同意学校保留或向国家有关部门或机构送交论文的复印件和电子版，允许论文被查

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3、。NK／T细胞淋巴瘤为非霍奇金淋巴瘤的一个亚型，发病率居T细胞淋巴瘤的首位，中国发病率远高于西方国家，WHO于2001年将其作为淋巴造血组织肿瘤中的一种独立类型。恶性淋巴瘤的病因和发病机制还不完全明确，一般认为是多种因素相互作用的结果，如病毒感染、某些理化刺激、免疫缺陷等。化疗、放疗、免疫治疗和生物治疗等是目前治疗淋巴瘤的主要手段，虽然部分亚型的淋巴瘤通过上述治疗能够在早期获得较好的治疗效果，但仍有部分类型淋巴瘤难以得到有效治疗，或者在治疗后出现复发。目前研究表明淋巴瘤的复发、耐药等生物学特性与某些关键靶标基因或小

4、分子标志物有着重要联系，因此开展淋巴瘤的基础和临床研究，为临床诊治提供有效作用靶点和标志物，具有重要意义。近年来陆续发现一些miRNA与哺乳动物造血细胞的分化，造血过程以及血液系统疾病发生密切相关。最近研究表明，特定的miRNA在T细胞和B细胞发育过程中也起重要的调节功能。另外，miRNA与淋巴瘤的发生也有一定的相关性。例如在弥漫性大B淋巴瘤中发现miRNA一17—92家族可与癌基因C．myc相互协调，诱导淋巴瘤形成。miRNA．17．92家族也可以调控PTEN肿瘤抑制基因和Bim促凋亡蛋白来促进淋巴增生性疾病和自

5、身免疫病的形成。中文摘要近年来许多研究证实miRNA．155具有广泛多样的生物学功能：miRNA．155在造血细胞分化过程中扮演重要角色；miRNA．155在炎症因子调控以及免疫反应中发挥着重要的生物学作用；miRNA-155在不同肿瘤中高表达，与其他表达下调的miRNAs直接或间接作用，促使肿瘤发生发展。miRNA．155在淋巴瘤病人样本中的表达量是正常组织的10—30倍，而不同淋巴瘤细胞中miRNA-155的表达量也不尽相同，说明miRNA．155可能淋巴瘤的发生分化有一定的相关性。目前，围绕miRNA一155

6、在胃癌、乳腺癌、宫颈癌、白血病及B细胞淋巴瘤中作用机制的研究已有不少涉及，但在其他类型如T细胞和NK细胞淋巴瘤中，miRNA．155的表达情况和相关研究鲜有报道。本课题利用高通量测序技术对NK／T细胞淋巴瘤细胞株SNK一6和YTS以及正常NK细胞的小RNA进行了高通量深度测序，检测这些细胞系中基因和miRNA表达谱；筛选并建立内源性高表达和低表达miRNA．155的淋巴瘤细胞系，研究其生物学特性，并对高通量检测数据进行生物信息学分析。从而评价miRNA．155对淋巴瘤细胞生物学特性的影响，揭示miRNA．155在淋

7、巴瘤细胞中的分子作用机制，为淋巴瘤的基础和临床研究提供新的诊治靶点，同时为miRNA在恶性肿瘤中的研究，提供新的有效研究方法。主要内容第一部分：NK／T细胞淋巴瘤细胞系小RNA测序及miRNA-155的表达鉴定方法：1．提取NK细胞、NK／T细胞淋巴瘤细胞系SNK-6细胞和YTS细胞总RNA，纯化总RNA，使提取的总RNA达到建库测序要求；利用华大基因solexa高通量测序技术对上述细胞系进行小RNA测序。2．测序结果的生物信息学分析：首先对小RNA测得的原始数据(Rawdata)进行基本数据评估和处理，然后进一步

8、进行高级生物信息学分析，包括：基因组比对；已知miRNA鉴定和统计信息、表达谱信息；重复序列比对；Genbank中文摘要和Rfam比对；外显子、内含子比对；小RNA分类注释；候选miRNA预测；miRNA差异分析；聚类分析；miRNA靶基因预测。3．为了进一步鉴定高通量测序的可靠性，我们又从中选取了miRNA．34a、miRNA-34b、miRNA．34c、