血清蛋白质指纹图谱诊断模型在肾癌中应用及临床意义

血清蛋白质指纹图谱诊断模型在肾癌中应用及临床意义

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1、摘要血清蛋白质指纹图谱诊断模型在肾癌中的应用及临床意义研究生:陈新洲导师:王玉杰副教授摘要目的:检测肾癌患者血清蛋白质指纹图谱,筛选特异的蛋白质标记物,构建用于肾癌早期诊断、预后监测的血清蛋白质指纹图谱诊断模型并分析其临床意义。方法:应用蛋白质芯片CM10及表面增强激光解吸/离子化飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)技术测定193例血清标本(其中肾癌53例、肾良性占位性病变47例、健康志愿者68例、肾癌术后25例)的蛋白质质谱,用随机抽取的118例标本(肾癌38例,肾良性占位病变30例,健康志愿者50例)作为训练组,应用支持向量机进行训练和交叉验证,建立肾癌诊断模型;其余

2、50例标本进行盲法验证。同时观察肾癌术前与术后组、局限性肾癌组与局部进展性肾癌组血清蛋白质指纹图谱的差异。结果:利用质荷比分别为5350、4100、3446、5027和6115的5个蛋白峰建立区分肾癌和正常人的诊断模型,其敏感性94.74%,特异性92%。盲法验证显示敏感性为93.33%,特异性为88.89%。区分肾癌和肾良性占位病变的诊断模型,敏感性为92.11%,特异性为90%。区分肾透明细胞癌和其他病理类型的肾癌的诊断模型对肾透明细胞癌的判别率为92.86%,对其他病理类型的肾癌的判别率为81.82%。术后肾癌血清蛋白质谱中,原高表达的蛋白质明显下调。利用质荷比分别为3

3、117、3258、4524、和5521的4个蛋白峰建立区分局限性肾癌与局部进展性肾癌的诊断模型,对局限性肾癌的判别率为90.91%,对局部进展性肾癌的判别率为85%。结论:表面增强激光解吸电离/飞行时间质谱技术结合支持向量机建立肾癌血清蛋白质指纹图谱模型对诊断肾癌具有较高的敏感性与特异性。关键词:肾细胞癌;表面增强激光解吸电离-飞行时间-质谱技术;蛋白质组;支持向量机;诊断模型1新疆医科大学医学硕士学位论文Applicationofserumproteinfingerprintmodelindiagnosisofrenalcellcarcinomaandtheirclinic

4、alsignificancePostgraduate:xinzhouchenSupervisor:ProfyujiewangAbstractObjective:Todetectnewbiomarkersandtoestablishaserumproteinfingerprintmodelforearlydetection,diagnosisandprognosisofrenalcellcarcinomaandtodiscusstheirclinicalsignificance.Methods:Theserumsamplesof53renalcellcarcinomapatie

5、nts,47benignrenalmassespatients,68healthyvolunteersand25patientswithrenalcellcarcinomaafteroperationwererandomlydividedinto2sets:trainingset(n=118,including38renalcellcarcinomapatients,30benignrenalmassespatients,and50healthyvolunteers)andtestset(n=50).Thefingerprintexpressionsofproteinchip

6、swereobtainedbyusingsurfaceenhancedlaserdesorption/ionizationtime-of-flightmassspectrometry(SELDI-TOF-MS)andCMl0proteinchip,Thedataofspectrawereanalyzedbysupportvectormachine(SVM)toestablishadiagnosticmodel.Tostudythechangesofserumproteomicspectrainpatientswithrenalcellcarcinomabeforeandaft

7、ersurgicaloperation,localizedrenalcellcarcinomaandlocallyadvancedrenalcellcarcinoma.Results:Fivepeakswiththemolecularweightof5350、4100、3446、5027and6115weredetectedandthedetectivemodelcombinedwith5biomarkerscoulddifferentiatetheserumofrenalcellcarcinomafr

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