徐州四种市售食用菌的分子鉴定

徐州四种市售食用菌的分子鉴定

ID:28070116

大小:56.50 KB

页数:6页

时间:2018-12-07

徐州四种市售食用菌的分子鉴定_第1页
徐州四种市售食用菌的分子鉴定_第2页
徐州四种市售食用菌的分子鉴定_第3页
徐州四种市售食用菌的分子鉴定_第4页
徐州四种市售食用菌的分子鉴定_第5页
资源描述:

《徐州四种市售食用菌的分子鉴定》由会员上传分享,免费在线阅读,更多相关内容在学术论文-天天文库

1、徐州四种市售食用菌的分子鉴定摘要:本文通过扩增食用菌的ITS序列对徐州市售双孢蘑菇、香菇、杏鲍菇和草菇的分类学地位进行了研宄,将4种食用菌的ITS序列与Eztaxon数据库屮真菌模式菌株数椐进行比对,选取亲缘关系最近物种的ITS序列,采用Clustalx1.8软件和MEGA5.0软件构建分子发育树。研究结果为双孢蘑菇、香菇、杏鲍菇和草菇的ITS序列长度分别为677bp、672bp、605bp和643bp;4种食用菌与亲缘关系最近物种构建的分子发育树表明,双孢蘑菇与模式菌株Agaricusbisporus(登录号:AJ133385)序列相似性为100%;香菇与模式菌株Lentinu

2、laedodes(登录号:JQ797414)序列相似性为100%;杏鲍菇与模式菌株Plcurotusostrcatus(登录号:AB733143)序列相似性为100%;草蘇与模式菌株Volvariellavolvacea(登录号:AY636049)序列相似性为99%。初步确定双孢蘑菇力蘑菇属的Agaricusbisporus;香菇为香菇属的Lentinulaedodes;杏?U菇为侧耳属的Pleurotusostreatus;草菇为小包脚燕属的Volvariellavolvacea。关键词:食用菌;ITS序列;分子鉴定中图分类号:S646文献标识码:AD0I:10.11974/n

3、yyjs.20160912001我国食用菌种质资源丰富,而传统食用菌的分类鉴定主要是基于菌丝、孢子和子实体的形态学特征和生理生化特征。真菌形态特征易受到培养条件的影响,许多子实体类型难以获得,增加了分类鉴定的难度。真菌核糖体基因转录间隔区(Internaltranscribedspacer,简称HS)是位于真菌核糖体RNA上18S和28S基因之间的片段,其两侧分别是18SRNA基因和28SRNA基因[1],长度一般为650〜750bp。White等于1990年设计了ITSKITS4>ITS53对可用于大多数担子菌和子囊菌的特异性鉴定引物[2],此后ITS序列分析技术在真菌分类和鉴

4、定的研究中得到广泛应用。如李晶等采用形态学鉴定方法与现代分子生物学技术相结合将1种野生食用菌鉴定为金山巨菇(Tricholomasp.)[3],雷琼等也采用同样的方法将一种人型食用菌鉴定为硫磺菌(Laetiporussulphureus)[4]。木研宄通过市售食用菌子实体的形态特征进行观察,结合ITS序列分析初步确定分类学地位,为食用菌种质资源提供了依据。1材料与方法1.1供试材料供试双孢蘑菇、秃菇、杏鲍菇和草菇购自徐州市铜山新区农贸市场,编号分别为Wl、W2、W3和W4。1.2子实体形态观察取完整子实体,观察并描述菌盖、菌褶和菌柄等。1.3DNA提取将新鲜的子实体烘干后粉碎成粉

5、末并过筛,储存备用。称取适量样品粉末,放入研钵中加入液氮碾磨充分破碎细胞,将碾磨碎粉转入离心管中,样品DNA的提取方法参照改进的CTAB法[5]进行。提取的总DNA经1%琼脂糖凝胶电泳检测。1.4ITS区段的PCR扩增采用通用引物nSl(5’-TCCGTAGGTGAACCTGCGG-3’)与ITS4(5’_TCCTCCGCTTATTGATATGC—3’)[2]扩增食用菌的ITS序列。PCR反应条件为:94°C预变性5min;94°C变性40S,55°C退火45S,72°C延伸lmin,30个循环;最后72°C延伸10min。PCR产物4QC条件下保存。取5pL产物进行1%的琼脂糖

6、凝胶电泳检测。1.3PCR产物的纯化和测序采用UNIQ-10柱式DNA胶回收试剂盒(上海生工)从琼脂糖凝胶电泳中回收DNA。具体步骤参照试剂盒说明。经胶回收纯化后的PCR产物送至南京斯普金生物科技有限公司完成测序。1.6系统发育树的构建将测序所得Wl,W2,W3,W44种食用菌的ITS序列与Eztaxon数裾席中真菌模式菌株数据进行比对,选取亲缘关系最近物种的ITS序列,采用Clustalx1.8软件和MEGA5.0软件以Neighbor-Joining法构建分子发育树[6],重复取样1000次[7]。2结果与分析2.1子实体形态观察食用菌子实体形态见图1,具体特征如下:W1:菌

7、盖近半球形,白色,光滑;菌肉白色,厚;菌摺褐色至黑褐色,密,窄;菌柄近圆柱形,白色,光滑;具菌环,单层,膜质。W2:菌盖扁平,边缘内卷,表面浅褐色至深褐色,边缘常有毛状或絮状鳞片;菌肉白色,稍厚;菌褶白色,密;菌柄屮生,白色,弯曲。W3:菌盖圆碟状,浅褐色;菌摺延生,密集,乳白色;菌柄偏生,中实,棒状,表面平滑,无菌环。W4:菌盖近钟形,中部稍凸起且色深,边缘完整;菌褶着生于菌盖下方,稍密;菌柄着生于菌盖下方中央,白色稍带黄色。2.2系统发育分析基于ITS基因序列,对Wl,W2,

当前文档最多预览五页,下载文档查看全文

此文档下载收益归作者所有

当前文档最多预览五页,下载文档查看全文
温馨提示:
1. 部分包含数学公式或PPT动画的文件,查看预览时可能会显示错乱或异常,文件下载后无此问题,请放心下载。
2. 本文档由用户上传,版权归属用户,天天文库负责整理代发布。如果您对本文档版权有争议请及时联系客服。
3. 下载前请仔细阅读文档内容,确认文档内容符合您的需求后进行下载,若出现内容与标题不符可向本站投诉处理。
4. 下载文档时可能由于网络波动等原因无法下载或下载错误,付费完成后未能成功下载的用户请联系客服处理。