ttv核酸模板快速制备方法论文

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1、TTV核酸模板快速制备方法论文.freelittedvirusnucleicacidtemplateSUMing-Quan1,FENGJi-Hong2,YUAYue-Yun1,ZHANGJian-Fang1,ZHANGLin1,LIUJia-Yun11CenterofClinicalMolecularBiology,XijingHospi-tal,FourthMilitaryMedicalUniversity,Xi'an710033,China,2DeparmentofInfectiousDiseases,CollegeofMed

2、icine,Yan'anUniversity,Yan'an716000Keyittedvirus;polymerasechainreaction;DNApreparationAbstract:AIMToestablishamethodadaptingtorapidpreparationofTTVDNAfrombulksamplesforPCR.METHODSTTVnucleicacidtemplateethods,viz.hydroxybenzenechloro-formextractionanddirectlyrapidcrac

3、king.RESULTSDNAabstractedbythetethodsplifiedatsamePCRparameterandthecoincidencerateainlaboratorydiagnosismethodistodetectit'sDNAbyPCR,soitisveryimportanttoestablishamethodforrapidpreparationofTTVDNAfrombulksamples.0引言TT病毒是近年新发现的一种肝炎病毒,当发现一种新的病原性相关病毒因子时,建立一种敏感、快速、特异的实验

4、室检测方法并评价该病毒因子在肝病中的价值是十分重要的,该方法的临床适用性和可行性,是评价所建立方法在临床上应用价值的关键所在.目前主要以实验室检测病毒核酸的存在为诊断依据,建立具有快速、简便、适合大批量临床标本中TTV核酸制备方法,对TTV肝炎的快速诊断,具有重要的意义.我们从临床快速检测需要为目的,寻求建立一种快速、简便的TTV核酸制备方法,用于大批量临床标本的检测,获得满意的结果.1材料和方法1.1材料非甲~非庚型肝炎血清30例,来自延安大学医学院传染科;慢性乙型肝炎患者血清50例,来自西京医院就诊患者;引物及合成:根据Nis

5、hizamolL-1Tris-HClpH8.0,200mmolL-1NaCl,10mmolL-1EDTA,20gL-1SDS,1gL-1蛋白酶K),60℃水浴60min,加等体积酚:氯仿:异戊醇(25∶24∶1)混匀,4℃冰浴下30min,2000g离心10min,取上清加等体积预冷无水乙醇-20℃过夜,1000g离心20min,沉淀溶于20μL0.1×TE缓冲液中,备用.②直接快速制备法:20μL血清加50μL快速裂解液(50mmolL-1TrisHCl,pH8.0,50mmolL1KCl,1.5mmolL-1MgCl,10gL

6、-1NP-40,5gL-1Tin,1000g离心10min,取上清做模板.③PCR扩增:第1轮PCR扩增:总反应体积为25μL,包括:10×PCR缓冲液2.5μL;4×dNTP2.0μL;外引物各1.0μL(50pmolL-1);DNA模板5.0μL;TaqDNA酶3UμL-1;无菌蒸馏水12.5μL;无菌石蜡油30μL覆盖液面,94℃变性3min,进入PCR循环,循环条件:94℃50s,55℃50s,72℃70s,32个循环,最后72℃延伸5min.第2轮PCR扩增:总反应体积为25μL,包括:10×PCR缓冲液2.5μL;4×

7、dNTP2.0μL;内引物各1.0μL(50pmolL-1);第1次PCR产物5.0μL;TaqDNA酶1.5UμL-1;无菌蒸馏水12.5μL;无菌石蜡油30μL覆盖液面,94℃变性3min,进入PCR循环,循环条件:94℃50s,55℃50s,72℃70s,32个循环,最后72℃延伸5min.④产物检测:取15μL第2次PCR扩增产物,于20gL-1琼脂糖(含EB)凝胶中,电泳100V30min,紫外灯下观察结果,出现196bp片段者为TTV阳性.2结果2.130份非甲~非庚型肝炎2种TTV核酸制备方法检测结果采用巢式聚合酶链

8、反应(nest-PCR),对2种方法分别制备的TTV核酸为模板进行扩增,结果在30份血清中2种制备方法均同时检测出6份为TTV阳性,二者符合率为100%.2.250份慢性乙型肝炎2种TTV核酸制备方法检测结果采用巢式聚合酶链反应(nest-PCR)

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