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时间:2018-11-10
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1、改良盐酸胍法提取脐血DNA用于HLA基因分型.L.编辑。作者:汤雪薇,廖灿,李焱,谢杏梅,黄以宁【摘要】为了比较经典的盐酸胍(Gu·HCl)抽提DNA法和改良盐酸胍抽提DNA法在提取脐血DNA的效果,探讨这两种方法在脐血组织相溶性抗原(HLA)基因分型中的应用,使用盐酸胍抽提DNA法和改良盐酸胍抽提DNA法提取72例脐血标本的DNA,并分别测定其DNA的浓度和纯度,采用序列特异性引物聚合酶反应方法(PCR-SSP)比较这两种方法所提取的DNA。 结果表明:两种方法提取脐血DNA均获成功;根据对DNA的质量监测发现,用改良盐酸胍抽提DNA在质量上较盐酸胍法好;
2、用于HLA基因分型时,改良盐酸胍抽提DNA法可减少非特异性条带的出现。 结论:改良盐酸胍抽提DNA法不但操作简便,成本下降,而且在最少血量中能提取出高纯度的DNA,减少非特异性条带的出现。该法完全可以满足脐血库的日常脐血样品DNA的提取以及脐血HLA基因分型的要求。【关键词】DNA提取 ModifiedGuanidineHydrochlorideMethodforDNAExtractionfromCordBloodUsedinHLAGenotyping AbstractToparetethodsforextractinggenomicDNAfromcor
3、dbloodandtoevaluatethEirapplicationsforHLAgenotyping,thegenomicDNAfrom72samplesodifiedguanidinehydrochloride,theDNAyieldandpurityetryanddetectedbyPCRers.TheresultshoicDNAethods.ThemodifiedGu·HClmethodusedethodasthemodifiedmethodproducesbetterqualityofDNAandlessambiguousbandsinPCR.I
4、tisconcludedthatmodifiedGu·HClmethodhastheadvantagesoflopleoperation,highqualityoutputandclearpositivebandsinHLA-genotyping,themodifiedmethodisoptimalforextractingDNAfrommultiplesamplesofcordbloodbank. Keyethod;modifiedguanidinehydrochloridemethod;HLAgenotype高产量和高纯度的真核细胞DNA分离技术是进行
5、PCR,Southernblot等分子生物学研究的前提条件,而在HLA基因分型中,模板DNA的质量是分型结果准确性的重要保证。Boa产品),MicroSSPTM试剂盒(美国莱姆德公司产品)。 主要仪器 高速冷冻离心机(HermleZK380)、紫外分光光度仪(PharmaciaGeneQuatII)、PE-9600PCR仪(PerkinElmer),自动凝胶成像仪(Phamacia)。 DNA提取 盐酸胍法[1] 取200μl脐血标本用生理盐水洗3-4次,离心至上层液体清晰,弃去上清液后,加入6mol/L盐酸胍200μl和0.1mol/L醋酸钠20
6、0μl(pH5.5),充分混匀,至少1小时。取以上液体至5ml冰冷无水乙醇中,小心吸放,使絮状物缠绕成团。将絮状DNA吸至新的1.5ml离心管中,离心,加70%乙醇洗1次,离心。室温干燥后加无菌水溶解。-20℃保存。 改良盐酸胍法 取600μl脐血标本用生理盐水洗3-4次,离心至上层液体清晰,弃去上清液后加入6mol/L盐酸胍300μl和0.1mol/L醋酸钠300μl(pH5.5),充分混匀,至少1小时。在原1.5ml离心管立即加入氯仿,颠倒混匀,离心,取上清液平分到2个新的1.5ml离心管中,分别加入等量的异丙醇,颠倒混匀至有絮状DNA沉淀出现,离心
7、,弃上清。用70%乙醇洗1次,离心。室温干燥后,一管加无菌水溶解,另一管为干粉状。-20℃保存。 DNA质量测定 72份经-20℃保存的CPD-A抗凝脐血标本分别采用以上2种方法进行DNA抽提,所得的DNA经PharmaciaGeneQuatⅡ紫外分光光度计测定浓度和纯度(A280/A260)。 HLA基因配型 采用PCR-SSP方法。随机挑选不同方法的不同脐血按操作方法按美国莱姆德公司的MicroSSPTM试剂盒(HLA-DRB)说明书进行HLA基因配型。PCR产物经常规琼脂糖电泳后,EB染色,自动成像仪照相。利用人工和电脑软件同时判读实验结果。
8、 结果 DNA的提取结果和纯度测定 受测试的72
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