基于taqman-tamra探针技术的apoe基因快速分型方法研究

《基于taqman-tamra探针技术的apoe基因快速分型方法研究》由会员上传分享，免费在线阅读，更多相关内容在学术论文-天天文库。

1、基于TaqMan-TAMRA探针技术的ApoE基因快速分型方法研究何骏奇1,2任峻2王祯媚2卢大儒1(1复旦大学生命科学学院上海杨浦200433)(2上海星健生物科技有限公司上海闸北200070)【摘要】目的建立基于TaqMan-TAMRA探针技术的快速、准确的载脂蛋白E(ApoE＞基因型检测方法，为临床诊断、治疗和预防ApoE基因相关疾病提供依据。方法对1049例血液样本提取DNA后，利用TaqMan-TAMRA探针对ApoE基因进行检测和分型，并利用测序法进行验证。结果1049例样本屮，共检出1048例

2、，ApoE基因的6种基因型(ε3/ε3、ε2/ε3、ε3/ε4、ε2/ε4、ε2/ε2、ε4/ε4)所占比例分别为68.64%、13.54%、14.97%、1.72%、0.76%、0.38%。TaqMan-TAMRA探针法分型结果与测序结果完全一致。结论TaqMan-TAMRA探针法操作简便，分型结果准确度高，是一种适

3、用于临床的ApoE基因快速分型方法。【关键词】载脂蛋白ETaqMan-TAMRA基因分型测序【中图分类号】R319【文献标识码】A【文章编号】2095-1752(2013)35-0132-02DevelopmentofafastgenotypingforApoEbasedonTaqMan-TAMRAprobes[Abstract]Objective:!"。establishamethodforfastandaccurategenotypingApoEwithTaqMan-TAMRAprobesandtosu

4、pporttheclinicaldiagnosis、treatmentandprevention.Methods:DNAwasextractedfrom1049bloodsamples,thendetectedandgenotypedwithTaqManTAMRAprobes.Thegenotypeswerecomparedwithsequencingresults.Results:DNAweredetectedin1048outof1049samples.Ofwhich,sixgenotypesofApo

5、Egene(ε3/ε3,ε2/ε3,ε3/ε4,ε2/ε4,ε2/ε2,ε4/ε4)accountedfor68.64%,13.54%,14.97%,1.72%,0.76%,0.38%.TaqMan-TAMRAprobegenotypeswereconsistentwithsequencingresults.Concl

6、usion:TaqMan-TAMRAisafastandaccuratemethodforgenotypingApoE.【Keywords】ApolipoproteinETaqMan-TAMRAgenotypingsequencing载脂蛋白(ApoE)基因位于人的第19号染色体，编码由299个氨基酸组成的ApoE蛋A,该蛋A具有脂蛋A转运、代谢及修复细胞膜等功能［1，2］。由于ApoE基因存在一些突变位点，因此会产生不同的等位基因，在人群中表现出遗俾多态性。ApoE基因有3种最为常见的等位基因即&epsi

7、lon;2、ε3、ε4,对应蛋白分别为E2(112Cys;158Cys)、E3(112Cys;158Arg)、E4(112Arg;158Arg),其区别在于氨基酸序列上的两个位点。3种等位基因共产生6种基因型，分别为ε2/ε2、ε2/ε3、ε2/ε4、ε3/ε3、ε3/ε4、ε4/ε4，

8、其中ε3/ε3在人群中所占比例最大，因ApoE基因型不冋，苏对成的生物学功能也出现较大差异［3】。研究表明，ε2/ε2可能与III型高脂血症有关，而ε4基因型频率升高可能引起阿尔茨海默病、动脉粥样硬化等疾病［4-5］。因此，在临床上对ApoE基因进行分型具有十分重要的意义。0前对ApoE基因进行分型的方法主要有扩增阻滞突变系统PCR(