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时间:2018-10-10
《肺癌组织细胞fhit基因启动子甲基化和转录表达 》由会员上传分享,免费在线阅读,更多相关内容在工程资料-天天文库。
1、肺癌组织细胞FHIT基因启动子甲基化和转录表达余宗涛,袁亚莉,张吉才,高琼,王元元【摘要】目的探讨FHIT(fragilehistidinetriad,脆性组氨酸三联体)基因表达水平及其启动子CpG岛甲基化状态与肺癌发生发展的关系。方法用实时定量PCR检测FHITmRNA在肺癌组织、肺癌旁组织与去甲基化剂5氮杂2’脱氧胞苷(5Aza2’deoxycytidine、5AzaCdR)处理前后A549细胞株中的表达,用甲基化特异性PCR(MSPCR)检测FHIT启动子CpG岛甲基化状态。结果FHITmRNA在肺癌旁组织中全部表达,在肺癌组织中表达缺失率为48.8
2、9%(22/45),且表达量低于正常肺组织(t=-15.851,P0.001),但在不同年龄和性别、肿瘤大小、恶性程度、肿瘤分类的差异无显著性;FHIT基因启动子在肺癌组织中发生甲基化的频率为40%(18/45)、在癌旁组织中频率8.7%(2/23)(χ2=7.184,P0.01),18份启动子区甲基化的肺癌标本中,10份同时伴有mRNA表达缺失。结论在肺癌组织中,FHIT基因启动子甲基化频率明显升高,其表达缺失或下调,提示FHIT启动子甲基化可在肺癌发生和发展中起一定作用。【关键词】肺癌;CpG岛甲基化;MSPCR;FHIT基因1资料与方法1.1资料1.1.1标本来源收
3、集湖北省十堰市太和医院2005年3月~2006年2月手术切除肺癌新鲜标本45例,男28例、女17例。小细胞肺癌(SCLC)8例、非小细胞肺癌(NSCLC)37例。全部标本均经病理证实。连同23例距离肿瘤边缘2cm外正常对照组织。-80℃冰箱保存备用。1.1.2A549细胞株培养及药物处理将对数生长期A549细胞制成5×104/ml细胞悬液,5%CO2条件下培养24h后,分别用5×10-6mol/L和5×10-5mol/L浓度5AzaCdR处理,24h后弃去药液并重新更换含新鲜培养液的药液,浓度同前,连续作用3d后弃去药液,用完全培养液继续培养4d后进行实验,用同体积PB
4、S处理的细胞作为对照组。1.1.3主要试剂及及仪器SPCR磺化修饰后的基因组DNA50~100ng(3μl),10×buffer3μl,2mmol/LdNTP3μl,25mmol/L氯化镁3μl,Taq酶2U(1μl),上下游引物各2μl(12pmol),20×SYBRGreenⅠ0.75μl,去离子水补齐至30μl。置PE7000仪进行扩增:95℃变性3min,(95℃×60s,58℃×30s,72℃×60s)×40,在72℃读取荧光值,最后一个循环72℃延伸5min。1.2.5RTPCR用无RNA酶的双蒸水稀释cDNA至100μl,PCR反应体系及循环参数同MSP
5、CR。1.2.6FHITmRNA相对定量方法利用检测得到的Ct值和计算得到的扩增效率,以GAPDHmRNA的量为参照,计算FHITmRNA的相对量。FHITmRNA/GAPDHmRNA用下述公式计算:(1+EGAPDH)Ct(GAPDH)/(1+EFHIT)Ct(FHIT)[7]。1.2.7统计学分析用SPSS10.0软件分析,mRNA表达水平定量测定用t检验,启动子甲基化状况用卡方检验。2结果2.1MSPCR检测结果肺癌基因组DNA标本中,有10例(其中SCLC3例)只存在甲基化PCR产物,另外35例标本中都存在非甲基化PCR产物,其中既有甲基化又有非甲基化产物的8例
6、(其中SCLC1例);而在23例正常对照组织中,存在甲基化2例,且均可检测出非甲基化产物的存在,两者之间差异有统计学意义,见表1;在年龄、性别、分化程度、肿瘤的病理类型、肿瘤大小差异无统计学意义(P>0.05)。表1FHIT甲基化化状况及mRNA相对定量组织病例注:①χ检验:χ2=7.184、P0.01;②两独立样本t检验:t=-15.851、P0.0012.2靶基因FHITmRNA的相对定量癌旁组织中,FHITmRNA相对定量在0.85±0.11,而在检出甲基化的18例肺癌组织中,10例FHITmRNA低于检测下限;在肺癌标本中FHITmRNA的相对定量在0.24±
7、0.20,差异显著;在A549细胞株中,FHITmRNA测定比值为0.56,但用5AzaCdR处理后,其FHITmRNA测定比值为0.97。2.3PCR产物分析经2%琼脂糖凝胶电泳证实了是一条特异的目的带,见图1~3。图1MSPCR检测肺癌中FHIT基因甲基化状态电泳图M=74bp,U=74bp图2管家基因GAPDH(226bp)内对照电泳图M:甲基化;U:未甲基化;Darker:分子量标准图3FHITmRNA(532bp)RTPCR电泳图3讨论我们实验组用SYBRGreenⅠ实时定量PCR测定FHITm
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