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时间:2018-07-30
《HBeAg阴性血清中乙肝病毒前C区变异分析.doc》由会员上传分享,免费在线阅读,更多相关内容在学术论文-天天文库。
1、HBeAg阴性血清中乙肝病毒前C区变异分析作者:郭龙华,黄宪章,庄俊华【关键词】,乙型肝炎病毒;变异;前C基因【摘要】目的了解本地区乙型肝炎病毒(HBV)流行株前C(PreC)基因的变异,为临床提供诊疗信息。方法通过设计2条特异性引物进行PCR扩增病人血清中PreC基因序列,回收PCR产物直接进行DNA测序和比对分析。结果PreC变异主要集中在nt1896位G→A。结论PreC变异可使HBeAg阴转。 【关键词】乙型肝炎病毒;变异;前C基因 AstudyonthemutationsofprecoregeneofhepatitisBvi
2、rusgenomeineantigen-negativesera 【Abstract】ObjectiveToinvestigatethemutationsofprecoregeneintheeantigen-negativeseraofpatientswithhepatitisBvirus(HBV)infectionandprovideinformationfordiagnosisandremedyofthediseases.MethodsPrecoregenewereamplifiedbyheminested-PCRfromeanti
3、gen-negativeseraandeantigen-postivesera,andthePCRproductsweresequenced,andthesequenceswereanalysed.ResultsTherewasahotpointmutationinnucleotideposition1896G→Ainprecoregene.ConclusionThemutationsinprecoregeneancauseeantigenseroconversion. 【Keywords】hepatitisBvirus;mutatio
4、n;precoregene乙型肝炎病毒(hepatitisBvirus,HBV)是不完全双链环状DNA病毒,基因组全长约3.2kb,为目前已知对人类致病的最小DNA病毒。HBV复制过程中要经过逆转录,由于逆转录酶缺乏有效的碱基校对功能,故HBV基因组比一般DNA病毒易发生变异。这给疾病的预防、诊断、治疗和预后带来新的问题。有关HBV基因组的变异,近些年来一直是人们研究的热点。 过去认为乙肝病毒e抗原(HBeAg)阴转,表明病情向好的方面发展。研究证明,如果体内还有HBV在复制,HBeAg阴转往往是HBV在体内发生变异的结果,易使疾病慢性
5、化。HBVPreC基因定位于乙肝病毒基因组nt1814-1900,PreC由于突变,提前出现终止子,HBeAg合成提前终止,影响干扰素疗效[1]。PreC是高变区,研究PreC的变异具有重要的临床意义。 1材料与方法4 1.1材料 1.1.1血清标本 来源于我院门诊和住院病人。 1.1.2主要仪器 Roche公司LightCycler型荧光定量PCR仪、飞鸽牌TGL-16B台式高速离心机。 1.1.3主要试剂 广州达安基因公司HBVDNA荧光PCR定量检测试剂盒、蛋白酶K(Merck公司)、平衡酚(国产),裂解液(自配)。
6、TaqDNA酶(MBI公司)、dNTP(Promega公司)、PCR产物直接回收试剂盒和DNAMarker(北京天为时代公司)。 1.1.4引物 参照GenBank中的HBV基因组序列,用PrimerPremier5.0软件设计2条特异性引物(半巢式PCR):正义引物P1:5′-GACTCTCAGCAATGTCAACG-3′(nt1669-1688);反义引物P2:5′-TCATCAACTCACCCCAACAC-3′(nt2099-2080);由北京三博远志生物公司合成。设计PCR终产物431bp。 1.2方法 1.2.1标本采集
7、 收集30例HBeAg阴性标本(HBVDNA含量3.0×103~3.1×105copies/ml)和5例HBeAg阳性标本(HBVDNA含量都高于5×105copies/ml,用于对照)。 1.2.2HBVDNA的提取 方法参照文献[2]。 1.2.3PCR扩增 10×缓冲液5μl,P1、P2(5μmol/L)各2μl,dNTP(10mmol/L)1μl,TaqDNA酶(1U/μl)1μl,MgCl2(25mmol/L)3μl,模板6μl,ddH2O30μl。加石蜡油30μl,94℃5min。然后94℃1min,53℃1min,
8、72℃1min共循环35次,72℃延伸5min。 1.2.4结果的观察及回收4 取第二轮PCR产物在1.2%琼脂凝胶(含EB)上电泳,观察结果。用试剂盒直接回收剩余PCR产物。回收的PCR
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