优秀单板u型场地滑雪运动员外周血淋巴细胞cdna文库构建及ests分析

优秀单板u型场地滑雪运动员外周血淋巴细胞cdna文库构建及ests分析

ID:12165174

大小:46.00 KB

页数:17页

时间:2018-07-16

优秀单板u型场地滑雪运动员外周血淋巴细胞cdna文库构建及ests分析_第1页
优秀单板u型场地滑雪运动员外周血淋巴细胞cdna文库构建及ests分析_第2页
优秀单板u型场地滑雪运动员外周血淋巴细胞cdna文库构建及ests分析_第3页
优秀单板u型场地滑雪运动员外周血淋巴细胞cdna文库构建及ests分析_第4页
优秀单板u型场地滑雪运动员外周血淋巴细胞cdna文库构建及ests分析_第5页
资源描述:

《优秀单板u型场地滑雪运动员外周血淋巴细胞cdna文库构建及ests分析》由会员上传分享,免费在线阅读,更多相关内容在教育资源-天天文库

1、优秀单板U型场地滑雪运动员外周血淋巴细胞cDNA文库构建及ESTs分析  摘要:��建一个优秀单板U型场地滑雪运动员血液的cDNA文库,经测序从中获取大量的表达序列标签(ExpressedSequenceTags)ESTs,用于基因筛选和功能预测。方法:通过对多名优秀冰雪运动员血液样品的总RNA进行提取、混合总RNA,合成双链cDNA、蛋白酶K消化、Sfi1酶切并连接载体、λ噬菌体的包装,经扩增最终获得优秀冰雪运动员cDNA文库;随后从文库中随机挑选500个克隆提交至北京诺赛基因组研究中心有限公司进行测序,测序结果利用Chromas软件去低质量样品,使用GenBank中的BLAST功能对

2、所获序列进行比对获取相关信息,将获得的ESTs信息提交PANTHR和GO(GeneOntology)生物信息数据库进行基本归类分析,从中获取运动员cDNA文库中所涵盖的重要遗传信息。结果:得到滴度分别为1.32×106pfu/mL和1.65×1010pfu/mL的未扩增文库和扩增后文库,扩增后文库的重组率为90.6%;得到长度在300~1100bp序列360个,平均长度60617bp;通过BLAST比对得出201条具有注释的基因信息,利用PANTHER数据库基本分析发现这些基因分布在27个pathway上,其中TXN、MDH1、ARL1、ARPC3、ACTG1等基因分别分布在参与新陈代谢

3、、氧化应激反应、心血管系统机能等相关联的信号通路上,推测其可能与运动能力存在关联。通过GO分析对所测序列进行归类得到在该数据库中具有功能注释的基因143个,参与31项不同功能,主要包括细胞组分、分子功能和生物过程。结论:构建了一个全长的运动员cDNA文库,其质量符合构建cDNA文库的标准。关键词:单板U型场地滑雪;外周血淋巴细胞;全长cDNA文库;表达序列标签中图分类号:G804.2文章编号:1009-783X(2017)03-0254-05文献标识码:AAbstract:Objective:TheaimofthisstudyistoconstructacDNAlibraryofbloo

4、dfromelitehalf-pipesnowboarders.AndwecangetalargenumberofESTs(ExpressedSequenceTags)fromitbysequencingthegenes.Wecanalsouseitforgenescreeningandfunctionprediction.Methods:ThecDNAlibraryofbloodfromelitehalf-pipesnowboarderswasconstructedbyaseriesofexperimentsextractingandmixingTotalRNAofseveraleli

5、teice-snowathletes,synthesizingdouble-strandedDNA,proteinaseKdigestion,Sfi1enzymedigestion,connectingwithvector,packagingphageλandamplification.Then500clonesfromthe17librarywererandomlyselectedtobesequenced.Low-qualitysamplesintheresultsofsequencewereremovedbyChromassoftware.Therelevantinformatio

6、nofESTswascapturedbymatchinggenesequenceswithBLASTofGenBank.ThentheinformationofESTswaspresentedtoPANTHRandGO(GeneOntology)bioinformaticsdatabasetomakeabasicclassificationandanalysisandtogetsomeimportantgeneticinformationinthecDNAlibraryofathletes.Results:ThetiterofcDNAlibraryunamplifiedwas1.32×1

7、06pfu/ml,andthetiterofcDNAlibraryamplifiedwas1.65×1010pfu/ml.TherecombinantrateofcDNAlibraryamplifiedwas90.6%.Wefinallygot360sequenceswhoselengthwerebetween300bpand110bp,andtheaveragelengthwas606bp.201Geneinformationwi

当前文档最多预览五页,下载文档查看全文

此文档下载收益归作者所有

当前文档最多预览五页,下载文档查看全文
温馨提示:
1. 部分包含数学公式或PPT动画的文件,查看预览时可能会显示错乱或异常,文件下载后无此问题,请放心下载。
2. 本文档由用户上传,版权归属用户,天天文库负责整理代发布。如果您对本文档版权有争议请及时联系客服。
3. 下载前请仔细阅读文档内容,确认文档内容符合您的需求后进行下载,若出现内容与标题不符可向本站投诉处理。
4. 下载文档时可能由于网络波动等原因无法下载或下载错误,付费完成后未能成功下载的用户请联系客服处理。