emb基因330密码子分子dna探针设计及荧光检测的论文

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1、EMB基因330密码子分子DNA探针设计及荧光检测的论文emb基因330密码子分子dna探针设计及荧光检测【关键词】耐乙胺丁醇embb基因;330密码子点突变;分子dna探针;荧光分光光度计【摘要】目的针对结核杆菌耐乙胺丁醇embb330密码子位点设计分子dna探针,尝试运用荧光分光光度计直接观测液相中分子dna探针与embb330密码子扩增产物杂交后的荧光信号,从而检出该位点突变。方法运用软件beacondesigner设计embb基因包含330密码子的分子dna探针,应用荧光分光光度计检测embb30

2、6密码子扩增片段与探针杂交后荧光信号,比较扩增产物测序结果。结果通过荧光分光光度计观测到结核标准株及embb330密码子突变株pcr产物与探针杂交后荧光信号存在显著差异;33株耐乙胺丁醇组与10株h37rv标准株对照组荧光信号强度比较,耐乙胺丁醇组embb330密码子突变检出率为3%,测序法突变检出率为3%。结论分子dna探针技术可以有效检测embb330密码子单碱基靶点突变;应用荧光分光光度计直接观测液相荧光杂交信号简单、灵敏。【关键词】耐乙胺丁醇embb基因;330密码子点突变;分子dna探针;荧光分

3、光光度计fluorescencedetectionandmoleculardnaprobedesignof330codoninembbgenechenqinghai,fuilitarymedicaluniversity,chongqing400038,china)abstract:objectivetodesignmoleculardnaprobedetectingembb330codonofethambutolresistantmycobacteriumtuberculosis(mtb),andtod

4、etectfluorescenceofmutationsiteofembb330codoninliquidbyfluorescencespectrophotometer.methodsthesoftoleculardnaprobedetectingembb306codonanddetectingfluorescencesignalfromhybridizationbetplifiedproductandprobebyfluorescencespectrophotometer,andconfertothes

5、equencingresults.resultsthedifferencebetstandardstrainandethambutolresistantoneisobviousindetectingthefluorescentlightbyuseoffluorescencemicroscope.butolresistantstrainsand10h37rvstandardstrains.therateofresistantethambutoldetectedisabout3%,andtherateofse

6、quencingisabout3%.conclusionthetechnologyofmoleculardnaprobecaneffectuallydetectamutationsinglebasylsiteofembb330codon.fluorescencespectrophotometerhavecharacteristicssuchashighsensitiveness,simpletodirectlydetectthefluorescentlightinliquid.keybutolresist

7、antembbgene;330codonofmutationsite;moleculardnaprobe;fluorescencespectrophotometer近年来,国内外学者在分子水平上对引起结核乙胺丁醇(ethambutol,emb)耐药的突变基因作了详尽的研究。.研究结果表明结核杆菌embb基因306位密码子突变是耐emb产生的主要原因,其他285、303、330密码子等突变也是引起该类耐药的重要原因[1]。针对广泛存在的单碱基突变位点不易检测,应用分子探针高灵敏直接检测单碱基突变是近年来一个

8、重要技术发展。其中具有茎环结构分子dna探针就是一类根据核酸碱基配对原则和荧光共振能量转移(fret)现象而设计的dna探针,对单碱基检测具有很高的灵敏性和特异性[2]。本研究选择结核杆菌耐乙胺丁醇一个重要突变位点embb330密码子,设计相应的分子dna探针,通过扩增及杂交、采用荧光分光光度计观测液相杂交荧光信号,并比较测序结果,为结核杆菌耐药位点准确测定提供一种新手段。1材料与方法1.1乙胺丁醇耐药菌株、标准株来源及其基因

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