亚洲带绦虫烯醇酶基因及其蛋白质的结构与功能

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1、亚洲带绦虫烯醇酶基因及其蛋白质的结构与功能【摘要】分析和预测亚洲带绦虫烯醇酶基因及其编码蛋白的结构和特性，用于指导其生物学功能的实验研究。【方法】利用美国国家生物技术信息中心和瑞士生物信息学研究所的蛋白分析专家系统中有关基因和蛋白的序列和结构信息分析的各种工具，结合其他生物信息学分析软件包，如Ｐｃｇｅｎｅ和ＶｅｃｔｏｒＮＴＩｓｕｉｔｅ，从亚洲带绦虫全长ｃＤＮＡ质粒文库中识别烯醇酶基因及其编码区，分析、预测该基因编码的蛋白质的理化特性、翻译后的修饰位点、功能域、亚细胞定位、拓扑结构、二级结构、三维空间构象等。【结果】该基因全长１７３７ｂｐ，编码区为第２

2、０５～１５０３ｂｐ，编码４３３个氨基酸，为全长基因。ＧｅｎＢａｎｋ中与棘口吸虫烯醇酶氨基酸序列同源性最高，达７８％。相对分子量理论预测值为４６６５３．５Ｋｕ。没有质体、线粒体定位序列。预测编码蛋白有１个跨膜区，３个亲水性部位。与吸虫属的烯醇酶进化关系最近。【结论】应用生物信息方法从亚洲带绦虫成虫ｃＤＮＡ文库中筛选出了亚洲带绦虫烯醇酶ｃＤＮＡ全长序列并预测得到其结构与功能方面信息。【关键词】亚洲带绦虫烯醇酶结构能生物信息学　　Ａｂｓｔｒａｃｔ：【Ｏｂｊｅｃｔｉｖｅ】Ｔｏｇｅｔｔｈｅｍｅｓｓａｇｅｓｏｎｔｈｅｓｔｒｕｃｔｕｒｅｓａｎｄｃｈａｒａｃｔｅｒｉ

3、ｓｔｉｃｓｏｆｅｎｏｌａｓｅｆｒｏｍＴａｅｎｉａａｓｉａｔｉｃａ（Ｔ．ａ．ＥＮＯ）ｂｙｂｉｏｉｎｆｏｒｍａｔｉｃｓ．【Ｍｅｔｈｏｄｓ】Ａｆｕｌｌ-ｌｅｎｇｔｈｃＤＮＡｓｅｑｕｅｎｃｅｅｎｃｏｄｉｎｇｅｎｏｌａｓｅｆｒｏｍｃＤＮＡｐｌａｓｍｉｄｌｉｂｒａｒｙｏｆＴａｅｎｉａａｓｉａｔｉｃａｗａｓｉｄｅｎｔｉｆｉｅｄｂｙｕｓｉｎｇｔｏｏｌｓｏｆｂｉｏｉｎｆｏｒｍａｔｉｃｓａｔｗｅｂｓｓｉｔｅｓｏｆＮＣＢＩ．Ｔｈｅｃｈａｒａｃｔｅｒｉｓｔｉｃｓｏｆｔｈｅｄｅｄｕｃｅｄｐｒｏｔｅｉｎｉｎｃｌｕｄｉｎｇｔｈｅｐｈｙｓｉｃｏ-ｃｈｅｍｉｃａｌｃｈａｒａｃｔｅｒｉ

4、ｓｔｉｃｓ，ｍｏｄｉｆｉｃａｔｉｏｎｓｉｔｅｓａｆｔｅｒｔｒａｎｓｌａｔｉｏｎ，ｄｏｍａｉｎｓ，ｓｕｂｃｅｌｌｕａｒｌｏｃａｔｉｏｎ，ｔｏｐｏｌｏｇｉｃａｌｓｔｒｕｃｔｕｒｅ，ｓｅｃｏｎｄａｒｙｓｔｒｕｃｔｕｒｅｓ，ａｎｄ３ＤｓｔｒｕｃｔｕｒｅｗｅｒｅｐｒｅｄｉｃｔｅｄｂｙｅｍｐｌｏｙｉｎｇｂｉｏｉｎｆｏｒｍａｔｉｃｓｓｏｆｔｗａｒｅｐａｃｋａｇｅｓｕｐｐｌｉｅｄｂｙｔｈｅｗｅｂｓｉｔｅｏｆＥｘＰａＳｙ．【Ｒｅｓｕｌｔｓ】ＴｈｅｆｕｌｌｃＤＮＡｓｅｑｕｅｎｃｅｅｎｃｏｄｉｎｇＴ．ａ．ＥＮＯｉｎｃｌｕｄｅｓａｃｏｍｐｌｅｔｅｏｐｅｎｒｅａｄｉｎｇｆｒａ

5、ｍｅｏｆ１２９９ｂｐｗｈｉｃｈｅｎｃｏｄｅｄａｐｕｔａｔｉｖｅｐｒｏｔｅｉｎｏｆ４３３ａｍｉｎｏａｃｉｄｓ．Ｔｈｅｃｏｄｉｎｇｒｅｇｉｏｎｉｓ２０５ｂｐ～１５０３ｂｐ．ＴｈｅａｍｉｎｏａｃｉｄｓｓｅｑｕｅｎｃｅｈａｓａｈｉｇｈｉｄｅｎｔｉｔｙｗｉｔｈｅｎｏｌａｓｅｆｒｏｍｏｔｈｅｒｓｐｅｃｉｅｓｉｎＧｅｎＢａｎｋ．Ｔｈｅｐｒｏｔｅｉｎｈａｓｏｎｅｔｒａｎｓｍｅｍｂｒａｎｅｒｅｇｉｏｎａｎｄｓｔａｂｌｅｐｈｙｓｉｃｏ-ｃｈｅｍｉｃａｌｃｈａｒａｃｔｅｒｉｓｔｉｃｓ．ＴｈｅｍｏｌｅｃｕｌａｒｗｅｉｇｈｔｏｆＴ．ａ．ＥＮＯｉｓｐｒｅｄｉｃｔｅｄｔｏｂｅ４６

6、６５３．５ｕ．Ｔｈｅｐｒｏｔｅｉｎｈａｓｔｈｒｅｅｈｙｄｒｏｐｈｉｌｉｃｒｅｇｉｏｎｓ．ＴｈｅｒｅｌａｔｉｏｎｓｈｉｐｏｆｐｈｙｌｏｇｅｎｅｓｉｓｂｅｔｗｅｅｎＴ．ａ．ＥＮＯａｎｄｅｎｏｌａｓｅｏｆｏｔｈｅｒｔｒｅｍａｔｏｄｅｓｉｓｃｌｏｓｅ．【Ｃｏｎｃｌｕｓｉｏｎ】ＴｈｅｃＤＮＡｓｅｑｕｅｎｃｅｅｎｃｏｄｉｎｇｅｎｏｌａｓｅｗａｓｓｃｒｅｅｎｅｄｆｒｏｍｃＤＮＡｌｉｂｒａｒｙｏｆａｄｕｌｔＴａｅｎｉａａｓｉａｔｉｃａｂｙｂｉｏｉｎｆｏｒｍａｔｉｃｓ．Ｔｈｅｓｔｒｕｃｔｕｒｅａｎｄｃｈａｒａｃｔｅｒｉｓｔｉｃｓｏｆｔｈｅｇｅｎｅａｎｄｐｒｏｔｅｉｎｏ

7、ｆＴ．ａ．ＥＮＯｗｅｒｅｏｂｔａｉｎｅｄ．　　Ｋｅｙｗｏｒｄｓ：Ｔａｅｎｉａａｓｉａｔｉｃａ；Ｅｎｏｌａｓｅ；ｓｔｒｕｃｔｕｒｅ；ｆｕｎｃｔｉｏｎ；ｂｉｏｉｎｆｏｒｍａｔｉｃｓ　　亚洲带绦虫（Ｔａｅｎｉａａｓｉａｔｉｃａ，Ｔ．ａ．）广泛分布于东南亚，包括我国西南地区及台湾，韩国、泰国、印尼和菲律宾等地［１-３］。人们通过食生或半生含有亚洲带绦虫囊尾蚴的猪、或野猪的内脏，特别是肝脏而感染，对劳动生产力和畜产品破坏极大。亚洲带绦虫成虫形态与牛带绦虫成虫相似，但其幼虫却与猪带绦虫的囊尾蚴相似。亚洲带绦虫成虫与牛带绦虫成虫的形态极为相似，人们长期以来把亚洲带

8、绦虫误认为是牛带绦虫。上世纪８０年代以来人们对其形态学、流行分布、中间宿主及实验动物感染、遗传学进行了研究，