基于线粒体DNA的16S rRNA、COⅠ和COⅡ基因的黄脊竹蝗5地理种群遗传多样性研究.pdf

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1、StudyonGeneticDiversityofRammeacriskiangsuof5geographicalpopulationsbasedonpartialsequencesof16SrRNAgene，COIgene，andCOIIgene{一byJIANGShi-ShengAthesissubmittedinpartialsatisfactionoftheRequirementsforthedegreeofMasterofSciencelnZoologylnCentralSouthUniversityofF

2、orestry&Technology498ShaoshanSouthRoad，TianxinDistrictChangshaHunan410004，ER．CHINASupervisorPmfessorHEYi．YuanJune，2011本人郑重声明：所呈交的论文是本人在导师的指导下独立进行研究所取得的研究成果。除了文中特别加以标注引用的内容外，本论文不包含任何其他个人或集体已经发表或撰写的成果作品，也不包含为获得中南林业科技大学或其他教育机构的学位或证书所使用过的材料。对本文的研究作出重要贡献的个人和集体，均已在文中

3、以明确方式表明。本人完全意识到本声明的法律后果由本人承担。作者签名：蓦％老年月日幸留轩蚕卅戢六兹学位论文版权使用授权书本学位论文作者完全了解学校有关保留、使用学位论文的规定，同意学校保留并向国家有关部门或机构送交论文的复印件或电子版，允许论文被查阅或借阅。本人授权中南林业科技大学可以将本学位论文的全部或部分内容编入有关数据库进行检索，可以采用影印、缩印或扫描等复制手段保存和汇编本学位论文。本学位论文属于：I、保密口，在年解密后适用本授权书。2、不保密口。(请您在以上响应方框打“√”)作者虢扔易导师虢留谁年月日年月日摘

4、要本论文以线粒体DNA中的16SrRNA基因、COI基因和COII基因为分子标记，对湖南桃江、广东广宁、广西桂林、重庆永昌和四川长宁5个黄脊竹蝗地理种群的遗传多样性及遗传分化进行了分析，得到了以下研究结果：(1)通过PCR扩增出的16SrRNA基因部分序列长506bp。A、T、G和C平均含量分别为32．O％，37．7％，17．6％，12．7％。A+T含量较高，为69．7％，G+C含量较低，为30．3％，存在着明显的A／T碱基偏向。所测序列经ClustalX1．81软件分析比对，其中保守位点数(C：Conserveds

5、ites)504个，变异位点数(V：Variablesites)2个，简约信息位点数(Pi：ParsimonyInformationsites)0个，自裔位点数(S：Singletonsites)2个。(2)通过PCR扩增出的COI基因序列长640bp。A、T、G$1C平均含量分别为36．8％，33．3％，13．2％，16．7％。A+17含量较高，为70．1％，(汁C含量较低，为29．9％，存在着明显的A／T碱基偏向。所测序列经ClustalX1．81软件分析比对，其中保守位点数638个，变异位点数2个，简约信息位点

6、数1个，自裔位点数1个。(3)通过PCR扩增出的COII基因序列长746bp。A、T、G和C平均含量分别为39．8％，31．7％，13．2％，15．3％。A+T含量较高，为71．5％，G+C含量较低，为28．5％，存在着明显的A／T碱基偏向。所测序列经ClustalX1．81软件分析比对，其中保守位点数742个，变异位点数4个，简约信息位点数0个，自裔位点数4个。(4)对5个地理种群黄脊竹蝗的遗传距离分析显示，16SrRNA基因序列间的遗传距离为0—0．004，所有序列的平均距离为0．0016。整个16SrRNA基因

7、序列的碱基转换数为1，颠换数为l。COI基因序列间的遗传距离为0．0．0031，所有序列的平均距离为0．0016。整个COI基因序列的碱基转换数为2，颠换数为0。COII基因序列间的遗传距离为0．0013．0．0027，所有序列的平均距离为0．0021。整个COII基因序列的碱基转换数为3，颠换数为1。总的来看，5个黄脊竹蝗地理种群之间的16SrRNA基因、COI基因和COII基因差异都很小，表明黄脊竹蝗种群分化程度很低，遗传多样性单一。(5)以16SrRNA基因、COI基因和COII基因为分子标记，利用邻近法(NJ

8、)，最小进化法(ME)，和非加权配对算术平均法(UPGMA)构建黄脊竹蝗5个地理种群的系统进化树。根据进化树分析，发现利用NJ法和ME法对同一组基因序列构建的分子系统树拓扑结构完全相同，利用UPGMA法对同一组基因序列构建的分子系统树拓扑结构与NJ法、ME法构建的具有很大的差异。用同一建树方法分别对16SrRNA基因、COI基因和COII基因序