基于线粒体DNA COⅢ基因序列研究四个长蛸Octopus variabilis野生群体的遗传多样性【毕业论文】

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1、本科毕业论文（20届）基于线粒体DNACOⅢ基因序列研究四个长蛸Octopusvariabilis野生群体的遗传多样性专业：生物科学目录摘要IAbstractII引言11材料与方法21.1实验材料21.2实验仪器21.3实验方法21.3.1长蛸基因组DNA的提取21.3.2凝胶电泳检测DNA31.3.3长蛸线粒体DNACOⅢ基因-PCR反应体系优化31.3.4PCR产物的测序和分析31.4本章小结42结果与分析52.1长蛸DNA提取52.2COⅢ-PCR引物设计52.3PCR体系优化52.3.1正交试验设计52.3.2两个因素的梯度实验62.3.3正交试验的

2、结果62.3.4退火温度梯度实验72.3.5正交试验结果72.4PCR反应结果82.4.1PCR最优反应体系82.4.2测序82.5长蛸COⅢ基因序列分析结果82.6本章小结113讨论13小结19参考文献20致谢24摘要[摘要]目的长蛸是我国传统海产，具有重要经济价值，对我国沿海四个地区长蛸野生群体进行遗传多样性分析，是海洋生态学以及水产资源学不可缺少的应用基础性的研究工作。本实验是对大连、青岛、舟山、厦门四个地区的长蛸Octopusvariabilis线粒体DNACOⅢ基因序列的测定来研究四个野生群体的遗传多样性，从而讨论遗传多样性与遗传变异之间的关系。方

3、法取长蛸外套肌组织，采用《分子克隆实验指南》蛋白酶K、酚/氯仿提取法（稍作修改）提取基因组DNA。细胞色素氧化酶亚基Ⅲ基因片断的扩增引物源自A.L.Allcock的一篇文献，COⅢ基因片段的两条引物分别为：F1(5′CAATGATGACGAGATATTATYCG3′),R1(5′TCAACAAAGTGTCAGTATCA3′)。在合适的反应条件下，通过PCR技术扩增目的基因，并对其进行纯化，纯化后的产物送交上海英骏生物技术公司测序。结论由PCR扩增和测序获得COⅢ基因504bp的序列57个，其多态性遗传参数统计显示，COⅢ基因检出9个单倍型，总群体单倍型多样性

4、指数(Hd)为0.802(COⅢ)，核苷酸多样性指数(Pi)为0.045(COⅢ)，平均核苷酸差异数(K)为22.628(COⅢ)，显示出较丰富的遗传多样性。基因遗传分析结果显示，厦门长蛸群体可能已单独形成一个亚种。初步分析长蛸各群体遗传分化的原因是洋流格局的形成阻隔了群体间的基因交流，从而导致厦门群体与北方各群体间的巨大分化。[单击此处输入论文正文。祝您顺利完成论文！][关键词]长蛸；COⅢ；遗传多样性；分子标记技术23Abstract[Abstract]PurposeOctopusvariabilisistraditionalChineseseafood

5、,withtheimportanteconomicvalue.thefourregionsofcoastaloctopusofwildpopulationsarebeinggeneticdiversity,whicharealsobasictostudiesonmarineecologyandfisheryresources.ThisexperimentistoOctopusvariabilisoffourdistrictsofdalian,Qingdao,zhoushan,xiamenmitochondrialDNAwasreviewed，andthede

6、terminationofCOⅢgenesequencestostudythegeneticdiversityofthefourwildpopulationgeneticdiversity,anddiscusstherelationshipbetweenwithgeneticvariation.MethodTotakethelongcoatmuscleofOctopus,usingtissue&tube"molecularcloningexperimentsguide"proteinaseK,phenolic/chloroformextraction(sli

7、ghtlyrevised)extractiongenomicDNA.CellenzymecytochromeoxidasehushaisgenefragmentsfromtheliteratureofA.L.AllcockthatCOⅢgenefragmentsoftwoprimerrespectivelyis:F1(5′CAATGATGACGAGATATTATYCG3′),R1(5′TCAACAAAGTGTCAGTATCA3′)。Attheappropriatereactionconditions,throughthePCRtechnologyaugmen

8、tationpurposegene,andcarri