srb1、itgb2基因单核苷酸多态性与冠心病的相关性研究

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1、中@费3钟3巧>硕:t研究生学位论文I北京协和医学院研究生院学校代码:100巧学号:S2012001033硕±学位论文汾没厶J7G龄基因单核昔酸多态性与冠也病的相关性研究所院;北京协和医学院姓名:孙渊指导教师:曾勇教授导师小组;朱惠娟副教授粪凤英研究员学科专业;内科学研究方向:也血管内科完成日期;20巧年5月6日1目录中》要3英文摘要6英文缩略词9前胃11研究对象与方法13一>研巧对象13二.试验与材料14H、试验方法16实

2、验结果32一32、研充纳入人群特点二、SN-Weinr32Ps位点Hardybeg平衡检验""-H、SNPs位点的病例对照关联分析33四37、连锁不平衡分析和单倍体型分析五、各位点临床及血清代谢相关指标的比较39讨论47一、单核昔酸多态性概述47二、研巧对象的选取47H、SNPs研究的技术方法和统计方法48、四:!SNPs病的相关性48、568基因与冠屯"、五G82基SNPs50、/T因与冠屯病的相关性结论51参考文献52文献综述56附65S

3、致谢662、中文摘要背景:一种由环境因素和遗传因素共同作用导致的复杂疾病冠也病是,是世界范围内一死亡和致残的首要原因之。脂代谢异常和炎症是冠也病发生、发展的两大机制,也是近年来冠也病研究的热点。B类1型清道夫受体scavengerreceptorclassBtype(1,幻?化1)是最主要的高密度脂蛋白(HDL)受体,既能介导肝脏对高密度脂蛋白中胆固醇脂的选择性摄取,又能促进外周组织细胞内游离胆固醇转运至HDL从而保持胆固醇代谢的平衡并防止游离胆固醇在动脉壁中堆积。SCSI的缺失可导致动脉壁内

4、胆固醇平衡襄乱W及脂质在动脉壁大量沉积和动脉硬化症的发生。炎症是动一脉粥样硬化性疾病发病的另重要机制,炎症反应中白细胞的粘附、趋化等过程的基础是细胞黏附和黏附分子的作用。整合素目2(/7GS2,iMegrinbeta2),即CD化,是黏附分子中整合素家族的重要成员。在前期的差异蛋白质组学研究中,我们发现,冠也病患者也外膜脂肪狙织中件682在表达水平较非冠也病患者明显上调(1.6倍),而在相应的皮下脂肪姐织中的表达水平确明显下调(0.1倍)。提示/7GS2可能通过参与炎症细胞与内皮细胞之间的粘附、炎症细胞趋化等过程,一

5、从而在动脉粥样硬化形成的起始阶段发挥作用。冠也、病是种复杂的多基因遗传一病,可能为冠也病提供,从遗传学的角度研究冠如病的发病机制种新的诊疗手段。目的:本研究的目的在于,对中国北方汉族人群5R8J和/TG82基因的单核巧酸多态性(SNP)进行分析,探讨这两个基因SNPs位点的等位基因频率、基因型频率与冠也病发病的相关性;同时探索SNPs位点与研究对象的糖、脂代谢指标的相关性。为阐明冠屯、病的遗传机制、评估冠也病的病变程度和预后提供新的指标。方法:1、研巧对象研究对象来自北京协和医院也内科冠屯、病研巧数据库,所

6、有研究对象均于我院行冠状动脉造影检查,并进行了详细的病史采集和血生化指标收集。根据我院一、冠状动脉造影检查结果进行诊断,左主干右冠、左前降支、左回旋支中有支上狭窄>50%诊断为冠屯、病。根据冠脉造影结果进行分组,冠状动脉造影结果、证实本研究入选W上血管狭窄>巧%患者为冠屯病沮,冠状动脉造影结果未见异、、常或狭窄<25%作为非冠屯病组。从冠屯病研究数据库中筛选出性别、年龄、BMI、糖尿病患者比例、血脂异常患者比例能够匹配的患者作为研究对象。32、筛选SNPs位点在1131〇乂16\/\/中挑选基因的标签SNP功能

7、区(如启动子,选择其中位于基因(叫9'Im区、外显子区、3UTR或5UTR)的SNPs位点,之后在Hapap中查找目标SNP在中国人群中的MAF值(最小等位基因频率),WMAF大于化化为原则;2依据全基因组关联研究(GWAS结果及国内外文献报道,筛选曾经报道过阳性())结果或趋势的SNPs位点。3、SNP检测方法使用OMEGA公司提供的全血基因沮DNA提取试剂盒提取DNA,通过琼脂糖凝胶电泳进行DNA质检,之后利用SequenomMassARRAYSNP检测平台进行检测。检测过程主要包括引物设计及合成、PCR扩增

8、反应、SAP纯化反应、单碱基延伸反应、质谱检测(基质辅助激光解吸附电离飞行时间质谱)分析,检测结果使用TYPER4.0软件(S巧

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