illumina技术研究不同喂养方式婴儿肠道菌群差异

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1、食品科技2012年第37卷第9期FOODSCIENCEANDTECHNOLOGY食品安全与检测Illumina技术研究不同喂养方式婴儿肠道菌群差异*李晓敏,杨丽杰,霍贵成(东北农业大学乳品科学教育部重点实验室,哈尔滨150030)摘要:目的:比较母乳喂养、混合喂养和人工喂养婴儿肠道微生物区系的差异,探讨喂养方式对婴儿肠道菌群的影响。方法:采用Illumina高通量测序技术对24份1~6个月内婴儿粪便中所有微生物的16SrRNA-V6区进行测序检测。结果:门水平上,3组均以Firmicutes和Pro

2、teobacteria为优势菌门;科水平上,Enterobacteriaceae在3组中均为优势菌,但在人工喂养组婴儿粪便菌群中所占的比例(50.82%)明显高于母乳喂养组(28.66%),混合喂养组为41.44%;Veillonellaceae和Bacteroidaceae在母乳喂养组婴儿粪便中是优势菌,相对丰度(21.42%和12.82%)明显高于混合喂养组(3.65%和4.32%)和人工喂养组(3.25%和0.04%);Bifidobacteriaceae在母乳喂养婴儿粪便中的数量仅占总菌数的

3、8.16%,但高于混合喂养组(6.16%)和人工喂养组(1.48%)。结论:不同喂养方式婴儿肠道菌群存在明显差异,Illumina高通量测序技术为婴儿肠道菌群的研究提供了更加准确、科学的数据资源。关键词:婴儿;肠道微生物;喂养方式;高通量测序中图分类号:TS201.4文献标志码:A文章编号:1005-9989(2012)09-0319-06Illuminatechnologyresearchthedifferenceofintestinalfloraininfantswithdifferentfee

4、dfashion*LIXiao-min,YANGLi-jie,HUOGui-cheng(KeyLaboratoryofDairyScience,MinistryofEducation,NortheastAgriculturalUniversity,Harbin150030)Abstract:Objective:Tocomparethedifferenceofintestinalmicrofloraamongbreast-fed,mixed-fedand收稿日期:2012-03-13*通讯作者基金项目

5、:东北农业大学生物乳制品理论与技术创新团队项目(CXT007)。作者简介:李晓敏(1986—),女,硕士研究生,研究方向为婴儿营养。[16]LIX,ZhangG,LIUQ,etal.Developmentofimmunoassayslinkedimmunosorbentassayforultratracedeterminationforthedetectionofsulfamethazineinswineurine[J].ofantibioticsinaqueoussamples[J].JEnvir

6、onQual,2004,FoodAdditContamPartAChemAnalControlExpoRisk33(1):250-256Assess,2009,26(3):314-325[18]郭尧君.蛋白质电泳实验技术[M].北京:科学出版社,2001:[17]KUMARK,THOMPSONA,SINGHAK,etal.Enzyme-456-460·319·食品科技食品安全与检测FOODSCIENCEANDTECHNOLOGY2012年第37卷第9期formula-fedinfants,andto

7、exploretheimpactoffeedingpatternsonintestinalfloraofinfants.Methods:Illuminahigh-throughputsequencingtechnologywereusedtosequence16SrRNA-V6variableregionofallmicrobesin24fecesof1~6months-oldinfants.Results:FirmicutesandProteobacteriawerepredominantbact

8、eriainallthreegroupsatphylumlevel.TheproportionofEnterobacteriaceaeinformula-fedinfants(50.82%)wassignificantlyhigherthanbreast-fed(28.66%)infants,mixed-fedinfantscontained41.44%,butitwasdominantbacteriainallthreegroupsatfamilylevel.The

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