欢迎来到天天文库
浏览记录
ID:29616176
大小:166.32 KB
页数:4页
时间:2018-12-21
《arraycgh数据的常规流程分析_上海丰核信息科技有限公司》由会员上传分享,免费在线阅读,更多相关内容在应用文档-天天文库。
1、arrayCGH数据的常规流程分析一介绍异常的DNA拷贝数变化(CNV)是许多人类疾病(如癌症、遗传性疾病、心血管疾病)的一种重要分子机制。作为疾病的一项生物标志,染色体水平的缺失、扩增等变化已成为许多疾病研究的热点,然而传统的方法(比如G显带,FISH,CGH等)存在操作繁琐,分辨率低等问题,难以提供变异区段的具体信息。基于芯片技术的比较基因组杂交(aCGH:array-basedComparativeGenomicHybridization)平台解决了上述问题。通过在一张芯片上用标记不同荧光素的样品(病例样品
2、和对照样品)进行共杂交可检测样本基因组相对于对照基因组的DNA拷贝数变化(CNV),常用于肿瘤或遗传性疾病全基因组CNV检测,直观地表现出肿瘤及遗传性疾病基因组DNA在整个染色体组的缺失或扩增。对肿瘤而言缺失片段可能包含抑癌基因,而扩增片段则可能存在致癌基因。二分析流程________________________________________________________________________上海丰核www.microsci.comSCI论文发表,基金申请,实验外包4000-331-887三应用
3、1:挖掘疾病样本中DNA层面上的拷贝数变异,比如在癌症中发现特定的DNA变异,并深入挖掘DNA变异区域是否为基因功能区域。________________________________________________________________________上海丰核www.microsci.comSCI论文发表,基金申请,实验外包4000-331-887四参考文献1:MarkA.vandeWiel,FranckPicard,Preprocessinganddownstreamanalysisofmicro
4、arrayDNAcopynumberprofiles.BRIEFINGSINBIOINFORMATICS.20102:Venkatraman,E.S.andOlshen,A.B.(2007).Afastercircularbinarysegmentationalgorithmfortheanalysisofarraycghdata.Bioinformatics3:NigelPCarteretal,MethodsandstrategiesforanalyzingcopynumbervariationusingDNA
5、microarrays.NatGenet.2007July4:NancyR.Zhang,JointEstimationofDNACopyNumberfromMultiplePlatforms.BIOINFORMATICS.20055:KentaroNakaoetal.,High-resolutionanalysisofDNAcopynumber________________________________________________________________________上海丰核www.micros
6、ci.comSCI论文发表,基金申请,实验外包4000-331-887alterationsincolorectalcancerbyarray-basedcomparativegenomichybridization.Carcinogenesisvol.25no.8pp.1345--1357,2004________________________________________________________________________上海丰核www.microsci.comSCI论文发表,基金申请,实验外
7、包4000-331-887
此文档下载收益归作者所有