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《2011 年天津市手足口病病原检测与基因特征分析》由会员上传分享，免费在线阅读，更多相关内容在教育资源-天天文库。
1、2011年天津市手足口病病原检测与基因特征分析*吕莉琨李力杨东靖李佳萌董晓春苏旭**（天津市疾病预防控制中心，天津300011）[摘要]目的对天津市2011年手足口病（HFMD）进行病原学检测，并对引起HFMD的肠道病毒71型（EV71）和柯萨奇病毒A组16型（CVA16）进行基因特征分析，为我市手足口病的防控提供基础资料。方法采用RealtimeRT-PCR方法对HFMD疑似病例标本进行检测，用人横纹肌瘤（RD）细胞对部分阳性标本进行病毒分离，随机挑取16株EV71病毒分离株和9株CVA16病毒分离株进行VP1区基因扩增，并进行核
2、苷酸序列和遗传进化关系分析。结果共检测HFMD疑似病例1853例，总阳性率为70.91%（1314/1853），其中EV71占34.75%，CVA16占15.32%，EV71和CVA16双阳性占0.65%，其它肠道病毒（EV）占20.18%。16株EV71分离株与C4a亚型代表株具有最高的核苷酸序列同源性（97.3%～99.1%），属于C4a基因亚型。9株CVA16分离株与B1b亚型代表株具有最高的核苷酸序列同源性（94.9%～95.4%），属于B1b基因亚型。结论 2011年引起天津市HFMD的EV71型病毒流行株为C4a基因亚型
3、，CVA16型病毒流行株为B1b亚型，兼有一定比例的其它肠道病毒。[关键词]手足口病；肠道病毒71型；柯萨奇病毒A组16型；基因型EtiologydetectionofHand-Foot-MouthDiseaseandGeneticCharacteristicsanalysisinTianjin,2011LvLi-kun,LiLi,YangDong-jing,LiJia-mengSuXu.（TianjinCenterforDiseaseControlandPrevention,Tianjin300011,China）[Abstrac
4、t]ObjectiveTorevealthepathogenspectrumofhand-foot-mouthdisease(HFMD)andgeneticcharacteristicsofEnterovirus71(EV71)andCosackievirusA16(CVA16)isolatedfromTianjinin2011.MethodSpecimensofHFMDcasesweredetectedbyRealtimeRT-PCRmethod.EV71andCVA16strainswereisolatedfromsomepos
5、itivespecimensbyRDcell.16isolatedstrainsofEV71and9isolatedstrainsofCVA16wereselectedforsequencingofcompleteVP1codinggeneandanalyzedbysoftware.ResultsAmongthe1853samplesofHFMDcases,theoverallpositiverateofenteroviruswas70.91%(1314/1853),thepositivedetectableratesofEV71,
6、CVA16,EV71+CVA16andotherEnterovirus(EV)were34.75%,15.32%,0.65%,20.18%,respectively.TheVP1-basedanalysisindicatedthattheEV71strainsdetectedfromtheTianjinareaformedadistinctclusterinsubgenotypeC4a,having97.3%～99.1%nucleotidesequenceidentities;TheCVA16strainsdetectedfromt
7、heTianjinareaformedadistinctclusterinsubgenotypeB1b,having94.9％～95.4%nucleotidesequenceidentities.ConclusionC4astrainofEV71andB1bstrainofCVA16werethemajorpathogensfortheepidemicsofHFMDinTianjinin2011,whiletherewerealsootherenteroviruscocirculating.[Keywords]Hand-foot-m
8、outhdisease;Enterovirus71;CoxsackievirusA16;Genotype*[基金项目]天津市科技支撑计划重大项目(07SYSYSF05100)**[通讯作者]苏旭，Email:sux001cn@sohu
