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时间:2018-05-15
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1、用于PCR分析的芥菜型油菜总DNA的快速提取用于PCR分析的芥菜型油菜总DNA的快速提取是小柯论文网通过网络搜集,并由本站工作人员整理后发布的,用于PCR分析的芥菜型油菜总DNA的快速提取是篇质量较高的学术论文,供本站访问者学习和学术交流参考之用,不可用于其他商业目的,用于PCR分析的芥菜型油菜总DNA的快速提取的论文版权归原作者所有,因网络整理,有些文章作者不详,敬请谅解,如需转摘,请注明出处小柯论文网,如果此论文无法满足您的论文要求,您可以申请本站帮您代写论文,以下是正文。 摘要通过对所提DNA质量、效率和PCR检测,建立和优化了可用于PCR分析的
2、芥菜型油菜总DNA的提取方法,这一方法快速,所提的DNA质量好,可在芥菜型油菜生长发育早期进行。 关键词芥菜型油菜;快速提取DNA;PCR分析 中图分类号Q523;S565.401文献标识码A文章编号1007-5739(2008)16-0172-02 DNA的快速提取是分子标记技术广泛应用的基础。一般植物DNA提取技术大都采用CTAB法、SDS法。本研究在前人的基础上改进了DNA的提取方法,并根据油菜叶子蛋白多、脂类物质含量高、DNA难以提取的特点,选择了成苗时期叶片为材料,摸索可用于PCR分析的DNA快速提取方法,并优化了芥菜型油菜PCR反应
3、体系。 1材料与方法 1.1试验材料 芥菜型地方品种为四川黄籽和紫叶芥的自交系。 1.2方法 提取液配方采用文献法[1],分别配SDS和CTAB提取液。 1.2.1油菜总DNA提取步骤。①在新配DNA提取液中加β-巯基乙醇,每毫升提取液加4μLβ-巯基乙醇备用。②取0.5g幼嫩叶片,加液氮,研磨成粉末状。迅速加入2mL上述提取液,轻轻摇动研钵,使材料在提取液中分散均匀。③静置10min,用剪口的1mL吸头吸取600μL上清液匀速加入已编号的1.5mL灭菌eppendorf管中,每材料取2管(其中紫叶芥加适量的活性炭,吸附色素)。④加入
4、等体积的氯仿-异戊醇混合液(氯仿∶异戊醇=24∶1)充分摇匀,63℃水浴25min。⑤取出离心管迅速置于-20℃冰箱冷却3~5min,12000rpm离心5min。⑥小心取出离心管,用剪口的0.2mL吸头吸取上清液300μL,合并2管上清液。⑦加入等体积的氯仿-异戊醇,充分混匀,12000rpm离心4min。⑧用剪口的0.2mL吸头吸取上清液400μL转入1.5mL离心管中,加入3mol/LNaAC使其终浓度至0.3M(每100μL上清液加11.11μL3mol/LNaAC),混匀。⑨加入2倍体积冰冷无水乙醇(预先在-20℃冷藏),温和倒转数次,置于-2
5、0℃冰箱中15min(使DNA充分沉淀析出)。⑩倾斜离心管,用干净枪头带出絮状沉淀,转入加有0.5mL70%乙醇的新灭菌离心管中,5000rpm离心3min。{11}倒去上清液,再加0.5mL70%乙醇洗1次。再倒去上清液,瞬时离心,用20μL吸头吸干残留液体后,离心管置于超净工作台上吹干。{12}将粗提DNA溶在200μLTE(10mmol/LTris-Cl∶1mmol/LEDTA)溶液中。{13}加入等体积的氯仿-异戊醇混匀,12000rpm离心5min。{14}转移上清液150μL,加入2倍体积冰冷无水乙醇,混匀,置-20℃冰箱20min。{15}
6、10000rpm离心3min,倒去上清液,用70%乙醇洗涤2~3次。{16}瞬时离心,用20μL吸取残留液体,置于超净工作台上吹干。{17}用灭菌超纯水或TE(10mmol/LTris-Cl∶0.1mmol/LEDTA)100μL溶解DNA。{18}用核酸蛋白质分析仪检测浓度,并结合琼脂糖凝胶电泳检测质量,后置于-70℃冰箱长期保存。 1.2.2特异引物PCR。引物1的上游引物为GTCAGAAAGAGACCGTNTGYGTNAC、下游引物为TTCCATTCACTGTCGGYTTDAT;引物2的上游引物为CATCTTGGCTATTGGNACNGC、下游引
7、物为CTTGACGGAAGGACGNARNCC[2];由上海生物工程技术服务有限公司合成。反应体系和扩增程序参照《靶向新基因分子克隆策策略》的方法进行优化[3]。反应体系总体积为25μL,反应体系各成分见表1。 引物1反应扩增程序为(T-gradientPCR热循环仪):94℃预变性3min;93℃变性50s;55℃退火50s;72℃延长100s,循环39次,72℃延长5min。引物2反应扩增程序为:94℃预变性3min;93℃变性50s;57℃退火50s;72℃延长100s,循环39次,72℃延长5min。 1.2.3随机引物PCR。随机引物、Ta
8、q酶、dNTP、10XBuffer、Mg2+购自上海生物工程技术服务有限公司,反
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