番茄ssr标记在茄子及其他茄科作物上的通用性分析

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1、华南农业大学学报2014,35(4):56-60http:∥xuebao.scau.edu.cnJournalofSouthChinaAgriculturalUniversitydoi:10.7671/j.issn.1001-411X.2014.04.011汪国平,牛玉,汪文毅,等.番茄SSR标记在茄子及其他茄科作物上的通用性分析[J].华南农业大学学报,2014,35(4):56-60.番茄SSR标记在茄子及其他茄科作物上的通用性分析11,2134汪国平,牛玉,汪文毅,乐素菊,林鉴荣(1华南农业大学

2、园艺学院,广东广州510642;2中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所,海南儋州571737;3仲恺农业工程学院生命科学学院,广东广州510225;4广州市农业科学研究院,广东广州510308)摘要:【目的】利用已完成测序的番茄基因组发展大量的SSR标记,并将这些标记转移到茄子及其他茄科作物上,节省开发SSR标记的成本.【方法】本研究利用近缘物种转移法分析了番茄SSR标记在茄子及其他茄科作物上的通用性情况.【结果和结论】1046对番茄SSR引物中有887对能在茄子基因组DNA上扩增出产物,425对

3、引物扩增出的带型在番茄与茄子间相似程度高,标记的通用率为40.6%;EST-SSR比基因组SSR的通用性更好,前者通用率为54.5%,后者为38.9%;414个通用SSR标记被电子定位到番茄染色体上,不同染色体来源的标记通用率明显不同;93对引物在2份用于遗传图谱构建的栽培茄子亲本间表现出多态性;获得的425对通用引物在马铃薯、辣椒、枸杞上通用率分别为96.2%、78.1%、54.1%.关键词:番茄;茄子;SSR标记;通用性;茄科蔬菜中图分类号:S641.2文献标志码:A文章编号:1001-411X(

4、2014)04-0056-05TransferabilityoftomatoSSRmarkerstoeggplantsandotherSolanaceousvegetables11,2134WANGGuoping,NIUYu,WANGWenyi,YUESuju,LINJianrong(1CollegeofHorticulture,SouthChinaAgriculturalUniversity,Guangzhou510642,China;2TropicalCropsGeneticResourcesIn

5、stitute,ChineseAcademyTropicalAgriculturalSciences,Danzhou571737,China;3CollegeofLifeSciences,ZhongkaiUniversityofAgricultureandEngineering,Guangzhou510225,China;4GuangzhouAcademyofAgriculturalSciences,Guangzhou510308,China)Abstract:【Objective】Tomatogen

6、omewassequencedandalargenumberofSSRmarkerscouldbeob-tained.Cross-speciesamplificationoftomatoSSRmarkerswillbeaneconomicmethodtoaddupthenumberofrobustSSRmarkersineggplantandSolanaceousvegetables.【Method】ThisstudytestedalargesetoftomatoSSRmarkersoneggplan

7、tandotherSolanaceousvegetablesbycloserelativespeciestransfermethod.【Resultandconclusion】887outof1046testedtomatoSSRmarkerscouldsuccessfullyamplifyoneggplants,butonly425producedverysimilarbandsontomatoesandeggplants,givingatransferrateof40.6%.EST-SSRmark

8、erswerefoundtobemoretransferablethangenomicSSRmarkers(54.5and38.9%respectively).414transferableSSRmarkersweremappedelectronicallyontotomatogenomeandtheirdistributiononindividualchromosomeshighlyvaried.93SSRmarkersshowedpolymor-收稿

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