豌豆基因组SSR标记在蚕豆中的通用性分析-论文.pdf

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1、第51卷第1期湖北农业科学V0】．51No．12012年1月HubeiAgriculturalSciencesJan．，2012豌豆基因组SSR标记在蚕豆中的通用性分析侯万伟，刘玉皎(青海省农林科学院，西宁810016)摘要：分析了21对豌豆(Pisumsativum)~Lt,．因组SSR引物在10个蚕豆(Vicia0)品种中的通用性。结果表明，豌豆基因组SSR引物在蚕豆中的通用性达38．10％，有效引物在蚕豆品种中的多态性比例为100％。关键词：豌豆(Pisumsativum)；蚕豆(Viciafa6a)；SSR；通用性中图分类号：$643文献

2、标识码：A文章编号：0439—8114(2012)01—0185—03TransferabilityofPeaSSRMarkersinHorsebeanHOUWan-wei，LIUYu-jiao(QinghaiAcademyofAgriculture＆Forestry，Xining810016，China)Abstract：Transferabilityof21pairsofSSRmarkersofpea(Pisumsativum)inhorsebean(Vieia口)wastested．Resultsshowedthatthetransfera

3、bilityrateofpeaSSRinhorsebeanwas38．10％，andpolymorphismrateofeffectiveSSRinhorse—beanwas100％．Keywords：pea(Pisumsativum)；horsebean(Viciafaba)；SSR；transferability简单序列重复(Simplesequencerepeats，SSR)，1材料与方法是一类由1～6个碱基组成的基序(motif)串联重复而成的DNA序列。它在真核生物的基因组中广泛1．1试验材料存在，其基序两端的序列多是相对保守的单拷贝序

4、供试蚕豆品种为：青海9号、青海1l号、青海列l1]。与其他分子标记相比，SSR标记具有数量丰12号、马牙、陵西一寸、法D、透心绿、双“0”、湟饲、富、等位基因变异多、共显性遗传、重复性强和对基130。使用ZONG等_l7报道的2l对豌豆SSR引物因组有很好的覆盖性等特点，已被广泛应用于基因(表1)．由上海生工生物工程技术服务有限公司合定位、品种鉴定、图谱构建、种子纯度检测及遗传多成。样性分析等[2-6]。SSR引物的获得可以通过3条途径：1．2DNA提取与SSR分析一是在公共的序列数据库(GenBank)里寻找微卫星1．2．1蚕豆基因组DNA提取

5、取蚕豆幼嫩叶片约序列：二是基因组文库的筛选；三是从近缘物种中1g，加液氮研磨至粉末状，加入装有0．8mLDNA提获得已设计好的引物对l7]。为了降低SSR引物的开取缓冲液[100mmol／LTris(pH8．0)+150mmol／L发成本，近年来很多学者对SSR引物在不同种、属EDTA(pH8．O)+2．1mol／LNaCl+2％CTAB+2％PVP]物种间的通用性进行了深入研究[8-161。本研究对21的1．5mL离心管中，65℃水浴45min后加入等体对豌豆(P／su，nsativum)基因组SSR引物在蚕豆中积氯仿／异戊醇(体积比为24：1

6、)混匀，12000r／min的通用性和多态性进行初步研究，以快速找出可用离心10min，将上清液转入另一离心管中，加入等于蚕豆(Viciafaba)遗传多样性分析、分子标记辅助体积无水乙醇。冰上静置20min，10000r／min离心育种等研究的分子标记。5min，弃上清，用75％乙醇清洗沉淀3次，风干后加收稿时间：2011-05～13基金项目：现代农业产业技术体系建设专项(CARS一09)；青海高原作物种质资源创新与利用国家重点实验室培养基金：青海省高校“135高层次人才培养工程”专项作者简介：侯万伟(1982_)，男，青海湟源人，助理研究员，

7、硕士，主要从事作物遗传育种研究，(电话)1373468568O(电子信箱)h0uWanwei333@163．corn；通讯作者，刘玉皎，研究员，主要从事蚕豆遗传育种研究，(电子信箱)lyujiao2000@yahoo．com．ca。186湖北农业科学2012正PBl4F25GAGTGAGCTrrI．I’AGCTrGCAGCCTPBl4LG—VIIPB14R22TGCTTGAGAACAGTGACTCGCAPSAA18F22CTGTAGACCAAGCCCAAAAGATPSAA18LG—II．LG—VPSAA18R22TGAGACACT兀TGACAAG

8、GAGGPSAA175F22TrGAAGGAACACAATCAGCGACPSAA175LG—III．U：一VPSAA175R22TGCG