三种植物EST-SSR引物在滇重楼上的通用性分析-论文.pdf

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1、西南农业学报2014年27卷4期1686SouthwestChinaJournalofAgriculturalSciencesV01．27Nn4文章编号：1001—4829(2014)04—1686—05三种植物EST—SSR引物在滇重楼上的通用性分析杨维泽，许宗亮，杨绍兵，杨美权，左应梅，杨天梅，张金渝’(1．云南省农业科学院药用植物研究所，云南昆明650231；2．昆明理工大学生命科学与技术学院，云南昆明650504)摘要：为了筛选适合用于滇重楼种质资源整理、评价和遗传研究的SSR标记，首次利用百合(35对)、延龄草(1O对)、薯蓣(5对)的EST-SSR标记对5份滇重楼材料进

2、行PCR扩增，分析3种植物引物在滇重楼中的通用性。结果显示，4J0对引物在滇重楼中能有效扩增，占引物总数的8O．O％，其中32对引物具有多态性，占引物总数的64．0％，引物通用率较高；利用15对具有多态性的Bl物对35份滇重楼材料进行多态性检测，等位基因数(A)、有效等位基因数(Ae)、Nei’e基因多样性(H)、Shannon指数(，)及多态位点百分比(PPB％)分别为1．9955、1．2634、0．1811、0．3075和99．5％，滇重楼显示出较为丰富的遗传多样性。3种植物的EST—SSR引物在滇重楼中具有较高的通用性，通过对3种植物EST—SSRs引物的开发，有助于重楼属在

3、遗传多样性、基因定位、连锁图谱的构建及比较基因组学等方面的研究。关键词：EST—SsR；滇重楼；通用性中图分类号：s567文献标识码：ATransferabilityAnalysisofEST-SSRMarkerofThreePlantstopo&vhyUaSmithvar．yunnanensis(Franeh．)HandMazz．YANGWei—ze。．一，XUZong-liang，YANGShao—bing。，YANGMei—quan，ZUOYing—mei，YANGTian．mei，ZHANGJin—yut(1．InstituteofMedicinalPlant，Yunnan

4、AcademyofAtllralSciences，YunnanKunming650231，China；2．FacultyofLifeScienceandTechnology，KunmingUniversityScienceandTechnology，YunnanKnnming650504，China)Abstract：InordertoscreenSSRsInRI~erwhichwassuitableforcollections．evaluationandgeneticreseal~hesofgermplasmofPnpotyphythtSmithvat．Tummnens／s(Fr

5、aneh．)HandMazz．，lilium(35pairs)，trillium(10pairs)anddioseorea(5pairs)SSRprimersweIetestedforanalymngpolymorphismofP．poI’pl川la．yunaanens／s．Theresultsshowedthatapproximately80％ofSSRpfimer8generatedrepeatableandclearproductsinP．po妇Var．yuaaanens／zandapproximately64％ofSSRm啪leadedtogeneticpolymorphi

6、sms．TheIxall~fer-abilityofSSRpfimerswaghigher．15pairBSSRprimersweiagusedindetectingpo]ymorphismof35materialsofPp0I^)Val'．yun-nanens／s．Theresultshowedthatnumberofalleles(A)，numberofefectivealleles(Ai)，Nei’Sgeneticdiversityandpercentageofpolymor-phicloci1．9955，1．2634，0．1811and0．3075，respectively

7、．Thisindicatedthatgeneticdiversityof砌V81"．yunnanens／swnsveryabundant．Therewa吕atransferabilityoftheEST-SSRprimelp8ofthreeplantsinpolyphyllavat．m，l口剃．Thus，usinganddevelopingtheprimersoftlIreeplantswouldhelptostudygeneticdiversity，geneloca