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《梨矮化砧木‘中矮1号’生长素氢转运体基因pcahs及其启动子的克隆与表达分析》由会员上传分享,免费在线阅读,更多相关内容在学术论文-天天文库。
1、园艺学报,2015,42(4):613–622.ActaHorticulturaeSinicadoi:10.16420/j.issn.0513-353x.2014-1056;http://www.ahs.ac.cn613梨矮化砧木‘中矮1号’生长素氢转运体基因PcAHS及其启动子的克隆与表达分析12111,*汤常永,段续伟,欧春青,王斐,姜淑苓12(中国农业科学院果树研究所,农业部园艺作物种质资源利用重点实验室,辽宁兴城125100;中国农业大学农学与生物技术学院,北京100193)摘要:以梨(PyruscommunisL.)紧凑型矮化砧木
2、‘中矮1号’及其母本‘锦香’新梢韧皮部为试材,根据转录组测序结果设计特异性引物,克隆到1个长1239bp的基因序列。该序列在两个品种间不存在差异,均编码412个氨基酸,其氨基酸序列与苹果(np_001280772.1)、梅(xp_008242099.1)、毛果杨(xp_002306421.2)、草莓(xp_00428771.1)的生长素氢转运体基因(AHS)编码的氨基酸序列的相似性在67%~99%之间,命名为PcAHS。qRT-PCR分析发现,‘中矮1号’新梢韧皮部中PcAHS的表达量均低于母本‘锦香’,推测其启动子序列存在差异。‘中矮1号
3、’及其母本‘锦香’PcAHS基因上游启动子长度分别为828bp和888bp,二者相似性89.1%。序列分析发现‘中矮1号’PcAHS基因启动子有一段58bp(–496bp~–553bp)的缺失;利用植物顺式作用元件数据库PLACE和PLANTCARE分析表明,‘中矮1号’启动子含有一个‘锦香’没有的BPBF转录因子结合元件P-box。推测‘中矮1号’PcAHS基因启动子特有的片段缺失和P-box转录因子结合元件可能是导致其表达量低并通过影响生长素的运输最终引起矮化的原因。关键词:梨;矮化砧木;生长素氢转运体基因;启动子;克隆中图分类号:S6
4、61.2文献标志码:A文章编号:0513-353X(2015)04-0613-10IsolationandAnalysisofPcAHSGeneandItsPromoterfromDwarfingRootstock‘Zhongai1’Pear12111,*TANGChang-yong,DUANXu-wei,OUChun-qing,WANGFei,andJIANGShu-ling1(InstituteofPomology,ChineseAcademyofAgriculturalSciences,KeyLaboratoryofHorticult
5、uralCropsGermplasm2ResoursesUtilization,MinistryofAgriculture,Xingcheng,Liaoning125100,China;CollegeofAgricultureandBiotechnology,ChinaAgriculturalUniversity,Beijing100193,China)Abstract:‘Zhongai1’isapeardwarfingrootstockselectedfromtheopenpollinatedseedlingsof‘Jinxiang’.O
6、negenewith1239bpwasobtainedfromthenewshootphloemof‘Zhongai1’and‘Jinxiang’anditwasdesignatedasPcAHS.PcAHShadnodifferenceinsequencebetweenthetwovarietiesanditencoded412aminoacidswhichhadasequenceidentityfrom67%to99%withtheAHSgeneinMalus×domestica(np_001280772.1),Prunusmume(X
7、P_008242099.1),Populoustrichocarpa(XP_002306421.2)andFragariavesca(xp_00428771.1).TheexpressionofPcAHSgeneinnewshoot收稿日期:2015–01–21;修回日期:2015–04–01基金项目:国家自然科学基金项目(31101516);中央级公益性科研院所基本科研业务费专项(1610032012006);农业公益性行业科研专项(201203075-05)*通信作者Authorforcorrespondence(E-mail:jshl
8、ing@163.com)TangChang-yong,DuanXu-wei,OuChun-qing,WangFei,JiangShu-ling.Isolationandanaly
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