梨‘中矮1号’矮生基因的筛选及pcahs克隆与表达分析

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1、密级:论文编号:中囯农业科学院学位论文梨‘中矮1号’矮生基因的筛选及克隆与表达分析ScreeningofDwarfGenesandCloneandExpressionAnalysisofPcAHSGenefrom#ZhongaiVPear硕士研宄生:汤常永指导教师:魏等串请学位类别:农业推广硕士专业领域名称:园艺培养单位:中国农业科学院研宄生院2015年5月独创性声明本人声明所呈交的论文是我个人在导师指导下进行的研究工作及取得的研宄成果。尽我所知，除了文中特别加以标注和致谢的地方外，论文中不包含其他人己经发表或撰写过的研究成果，也不包含为获得中国农业科学院或其它教育机构的学位或证书

2、而使用过的材料。与我一同工作的同志对本研宄所做的任何贡献均己在论文中作了明确的说明并表示了谢意。研宂生签名:h时间：又&^年孓月”曰关于论文使用授权的声明本人完全了解中国农业科学院有关保留、使用学位论文的规定，即：中国农业科学院有权保留送交论文的复印件和磁盘，允许论文被查阅和借阅，可以采用影印、缩印或扫描等复制手段保存、汇编学位论文。同意中国农业科学院可以用不同方式在不同媒体上发表、传播学位论文的全部或部分内容。研究生签名:时间:W：T年5、月时间：h[卜年厂月}^曰中国农业科学院硕士学位论文评阅人、答辩委员会签名表论文题I梨‘中矮1号’矮生基因筛选及克隆与表达分析果树遗传论文作者

3、汤常永专业园艺研究方向育种指导教师培养单位（研究所）果树研究所硕（博)职称单位专业签名导师评硕导口、中丨mf博导0阅硕导试y人博导®/答辩主席硕博导导□立中国农业科学院果树学果树研究所硕导口李天忠教授中国农业大学果树学博导这硕导口李喜宏教授天津科技大学食品科学博导#a硕导敁中国农业科学院刘凤之研究员果树学博导口果树研究所辩硕导口中国农业科学院曹玉芬研究员果树学参博导果树研究所J委硕导□口博导口贝硕导口博导□硕导口博导□会议丨己录(.秘书）L1—论文答辩时间地点射胂“上十健i、'•谢祕況播纽1密级:论文编号:中国农业科学院学位论文梨‘中矮1号’矮生基因的筛选及PcAHS克隆与表达分析

4、ScreeningofDwarfGenesandCloneandExpressionAnalysisofPcAHSGenefrom‘Zhongai1’Pear硕士研究生：汤常永指导教师：姜淑苓申请学位类别：农业推广硕士专业领域名称：园艺培养单位：中国农业科学院果树研究所中国农业科学院研究生院2015年5月Secrecy:No.ChineseAcademyofAgriculturalSciencesDissertationScreeningofDwarfGenesandCloneandExpressionAnalysisofPcAHSGenefrom‘Zhongai1’PearM.S

5、.Candidate：TangChangyongSupervisor：JiangShulingMajor：HorticultureSpecialty:InheritanceandBreedingofFruitsMay2015摘要‘中矮1号’是从‘锦香’梨实生后代中选出的优良梨矮化砧木。树体矮小紧凑，作砧木促进树体矮化，但其矮生和致矮机理尚不清楚。以‘中矮1号’及‘锦香’新梢嫩叶为试材，进行RNA-Seq分析，共获得2个品种46619个unigenes，其中长度大于1000bp占23.25%，约71%的unigenes至少具有1条注释。使用IDE6软件对基因进行表达分析，控制FDR低

6、于0.05，并且基因的最高表达量达到最低表达量的1.5倍时，该基因为差异表达基因。‘中矮1号’和‘锦香’中存在很多个差异表达的基因，有些可以作为矮化相关的候选基因，包括1个编码GA-3氧化酶基因，5个编码生长素相关蛋白基因，4个编码细胞色素P450蛋白基因，1个编码类LRR受体丝氨酸/苏氨酸激酶基因；2个编码脱落酸合成酶基因，3个编码乙烯响应转录因子基因，6个编码水分相关蛋白基因，2个NAC类转录因子和4个WRKY类转录因子基因。从中选取10个差异表达基因进行qRT-PCR验证，结果表明qRT-PCR结果与RNA-Seq结果一致。在上述差异表达的基因中，有1个注释为生长素氢转运体的

7、基因在‘中矮1号’中为低表达，可能限制生长素的极性运输而导致‘中矮1号’矮生。因此，根据转录组测序结果，设计特异性引物，分别在‘中矮1号’和‘锦香’中克隆到了该基因序列。其全长1239bp，在2个品种间没有序列差异，均编码412个氨基酸，其氨基酸序列与苹果（NM_001293843.1）、梅（xp_008242099.1）、毛果杨（xp_002306421.2）、草莓（xp_004287713.1）的生长素氢转运体基因氨基酸序列的相似性在67%~99%之间，将其命名为