小麦蛋白磷酸酶2a基因tapp2abb-a启动子的克隆及表达分析

《小麦蛋白磷酸酶2a基因tapp2abb-a启动子的克隆及表达分析》由会员上传分享，免费在线阅读，更多相关内容在学术论文-天天文库。

1、作物学报ACTAAGRONOMICASINICA2016,42(9):12731281http://zwxb.chinacrops.org/ISSN0496-3490;CODENTSHPA9E-mail:xbzw@chinajournal.net.cnDOI:10.3724/SP.J.1006.2016.01273野生小豆和栽培小豆microRNA全基因组鉴定与比较分析1211121马燕明陈春海杨凯李奕松赵波李江李永强1,*万平12北京农学院/北京农业应用新技术北京市重点实验室,北京102206;深圳华大基因科技有限公司,广东深圳518083摘要

2、:MicroRNA(miRNA)是一种非编码的小RNA分子,对真核生物基因表达起着非常重要的调控作用,miRNA系统鉴定对于研究其功能及作用机制具有重要意义。本研究分别以栽培小豆京农6号(JN6)和野生小豆CWA108为试验材料,进行了深度miRNA测序。系统鉴定和注释这2个物种的miRNA,并分析了其miRNA种类的异同、表达量的差异和靶基因在功能富集上的差别。鉴定出了JN6和CWA108共有和特有的miRNA,明确了它们之间差异表达的miRNA,以及这些特有和差异miRNA的靶基因在功能富集上的差异,发现可能和抗病与抗逆途径相关。关键词:miR

3、NA;栽培小豆(Vignaangularis);野生小豆(Vignaangularisvar.nipponensis)GlobalIdentificationandComparisonofMicroRNAinWildandCultivatedAdzukiBean1211121MAYan-Ming,CHENChun-Hai,YANGKai,LIYi-Song,ZHAOBo,LIJiang,LIYong-Qiang,and1,*WANPing12BeijingUniversityofAgriculture/BeijingKeyLaboratoryofN

4、ewTechnologyinAgriculturalApplication,Beijing102206,China;BGI-Shenzhen,Shenzhen518083,ChinaAbstract:MicroRNAs(miRNAs)areaclassofsmallregulatoryRNAswiththefunctionascrucialregulatorsthatrepresstheexpressionoftheirtargetgenesatthetranscriptionalorpost-transcriptionallevel.Global

5、identificationofmiRNAisimportantforthefunctionalstudy.Adzukibean(Vignaangularis)genomesequencinghasbeenfinishedrecently,butlackofasystematicalanalysisofmiRNA.Inthisstudy,weperformeddeepmiRNAsequencinginwild(CW108)andcultivated(JN6)adzukibeans.Ourinvestigationnotonlyidentifiedt

6、hemiRNAsthatsharedbythesetwospecies,butalsofoundmiRNAsthatspecificallyexistedinindividualaccession.ThroughcomparisonofthemiRNAexpressionandtheirtargetgenepredictionsbetweenthewildandcultivatedadzukibeans,wefoundthatthemiRNAwasdivergedbetweenthem,whichmaybeassociatedwithplant-p

7、athogeninteractionpathway.Ourstudyprovidedavaluableresourceforfunctionalanalysisinadzukibean.Keywords:miRNA;Wildadzukibean(Vignaangularis);Cultivatedadzukibean(Vignaangularisvar.nipponensis)MicroRNA(miRNA)是一类长度为20~25nt的基因转录和转录后调控中发挥重要作用。迄今研究内源单链非编码调控小分子RNA。1993年,miRNA结果表明,miRN

8、As可以影响生物体的各个方面,首次在秀丽线虫(Caenorhaditselegans)中被克隆,其功能可以分为以下几个方面