干旱胁迫下杂草稻和栽培稻根系基因表达差异研究

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1、中国水稻科学(ChinJRiceSci),2016,30(5):458-468http://www.ricesci.cn458DOI:10.16819/j.1001G7216.2016.5180干旱胁迫下杂草稻和栽培稻根系基因表达差异研究丁国华1,2,#孙健2,#杨光3张凤鸣1白良明1孙世臣1姜树坤1王彤彤1郑洪亮1夏天舒1沈希宏4马殿荣2,∗陈温福2,∗(1黑龙江省农业科学院博士后科研工作站/黑龙江省农业科学院耕作栽培研究所/中国科学院北方粳稻分子育种联合研究中心,哈尔滨155086;2沈阳农业大学

2、水稻研究所,沈阳110866;3辽宁省经济作物研究所,辽宁辽阳111000;4中国水稻研究所,杭州310006;#共同第一作者;∗通讯联系人,EGmail:madianrong@163.com;wfchen5512@126.com)GlobalGenomeExpressionAnalysisofRootGenesunderDroughtStressinWeedyRiceandUpGlandRiceDINGGuoGhua1,2,#,SUNJian2,#,YANGGuang3,ZHANGFengGming

3、1,BAILiangGming1,SUNShiGchen1,JIANGShuGkun1,WANGTongGtong1,ZHENGHongGliang1,XIATianGshu1,SHENXiGhong4,MADianGrong2,∗,CHENWenGfu2,∗(1PostdoctoralScientificResearchStationofHAAS/CultivationandFarmingResearchInstituteofHASS/NorthernJaponicaRiceMolecularBre

4、edingJointResearchCenter,Harbin150086,China;2ShenyangAgriculturalUniversity,Shenyang110866,China;3InstituteofEconomicCropofLiaoning,Liaoyang111000,China;4ChinaNationalRiceResearchInstitute,Hangzhou310006,China;#Theseauthorscontributedequallytothiswork;∗

5、Correspondingauthor,EGmail:madianrong@163.com,wfchen5512@126c.om)DINGGuohua,SUNJian,YANGGuang,etal.GlobalgenomeexpressionanalysisofrootgenesunderdroughtstressinweedyriceandupGlandrice.ChinJRiceSci,2016,30(5):458G468.Abstract:Theexpressionchangesofrootge

6、nesindroughtGresistanceweedyriceHEB07G2(Oryzasativaf.spontanea)andupGlandriceIAPAR9(Oryzasativa)wereanalyzedunderpolyethyleneglycol(PEG)GsimulatedwithdroughtstressconditionwithAffymetrixGeneChipricegenomearray.Theresultsindicatedthattheextentanddirectio

7、noftranscriptomeresponseofHEB07G2andIAPAR9todroughtdifferedgreatly.ForHEB07G2,among6878expressedgenes,4693wereupGregulatedand2185weredownGregulatedunderdroughtcondition.ForIAPAR9,among2923expressedgenes,983wereupGregulatedand1940weredownGregulated.Analy

8、sisofdifferentiallyexpressedgenesinHEB07G2andIAPAR9showedthattheweedyriceHEB07G2hadahigherchangingfoldthantheupGlandriceIAPAR9.GeneontologyanalysisrevealedthatgenesofHEB07G2inpotassiumiontransporting(GO:0006813),secondarymetaboli

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