资源描述：
《六株鸽源新城疫病毒的分离_鉴定及生物信息学分析》由会员上传分享，免费在线阅读，更多相关内容在学术论文-天天文库。
1、中国动物传染病学报2014,22(5):1-9ChineseJournalofAnimalInfectiousDiseases·研究论文·六株鸽源新城疫病毒的分离、鉴定及生物信息学分析111222111李仕超，仇旭升，刘开春，周锦萍，刘健，鞠厚斌，谭磊，孙英杰，宋翠萍，21刘佩红，丁铲（1.中国农业科学院上海兽医研究所,上海200241；2.上海市动物疫病预防控制中心,上海201103）摘要：新城疫是严重危害世界养禽业的一种禽类传染病。近年来，鸽新城疫的流行越来越严重，引起了养殖户和兽医工作者的广泛关注。本研究在4批发病鸽组织病料中分离到了4株鸽源新城疫强毒株和2株鸽源弱毒株。病毒分离株经鸡
2、胚有限稀释法纯化5次后，新鲜尿囊液用于提取病毒RNA。经RT-PCR扩增、测序得到分离株的F基因和HN基因序列。通过对F基因的遗传进化分析发现，4株鸽源强毒株属于ClassⅡ基因Ⅵb亚型，2株鸽源弱毒株与ClassII基因II型疫苗株LaSota高度同源。进一步遗传进化分析结果显示，4株鸽源新城疫病毒强毒株与目前国内流行株属于同一遗传分支，这些毒株与欧洲流行株亲缘关系十分相近，而与中国20世纪90年代鸽源分离株遗传距离稍远，因此推测当前鸽源流行强毒株可能源自欧洲。生物信息学分析显示鸽源毒株HN蛋白345~353位的一个线性抗原表位发生了改变，而血清学实验显示LaSota疫苗株和鸽源毒株的交叉
3、血凝抑制存在明显差异，暗示鸽源毒株已经发生了抗原性变异。因此，使用鸡疫苗株LaSota免疫鸽存在免疫失败的风险，需要研发鸽专用新城疫病毒疫苗用于鸽新城疫的防疫工作。关键词：新城疫病毒；鸽源；基因型Ⅵb亚型；F基因；HN基因中图分类号：S852.659.5文献标志码：A文章编号：1674-6422（2014）05-0001-09ISOLATION,IDENTIFICATIONANDBIOINFORMATICSANALYSISOFSIXNEWCASTLEDISEASEVIRUSESOFPIGEONORIGIN1112221LIShi-chao,QIUXu-sheng,LIUKai-chun,ZH
4、OUJin-ping,LIUJian,JUHou-bin,TANLei,1121SUNYing-jie,SONGCui-ping,LIUPei-hong,DINGChan(1.ShanghaiVeterinaryResearchInstitute,CAAS,Shanghai200241,China;2.ShanghaiAnimalDiseaseControlCenter,Shanghai201103,China)Abstract:Newcastlediseaseisasevereinfectiousdiseaseinbirds,threateningpoultryindustryworldw
5、ide.PigeonsareverysusceptibletoNewcastlediseasevirus(NDV)infection,whichcauseshighmorbidityandmortality.Inthisstudy,sixNDVstrainswereisolatedfromthepigeontissuesamples,fourofwhichwerehighlyvirulentandtwowerelowvirulent.Thesepigeonviruseswerecloned5timesinembroynatedSPFchickeneggsvialimiteddilutionm
6、ethod.ThefreshallantoicfluidswerecollectedforRNAextraction.TheresultingRNAsampleswereconvertedtocDNAsfollowedbyPCRamplificationandsequencingofFandHNgenes.PhylogeneticanalysisbasedonFgenesequencesshowedthatfourhighlyvirulentstrainsbelongedtoClassⅡⅥbsubgenotypeandtwolowvirulentstrainsweresimilartoLaSo
7、taandbelongedtoClassⅡgenotypeⅡ.Inaddition,fourhighlyvirulentstrainsweremorecloselyrelatedtothestrainisolatedinItalyafewyearsagothanthosestrainsobtainedinChinain1990’s.Therefore,thesevirulentpigeonstrainscur
