两种苎麻纤维素合酶基因cdna序列的克隆及表达

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1、作物学报ACTAAGRONOMICASINICA2014,40(11):19251935http://zwxb.chinacrops.org/ISSN0496-3490;CODENTSHPA9E-mail:xbzw@chinajournal.net.cnDOI:10.3724/SP.J.1006.2014.01925两种苎麻纤维素合酶基因cDNA序列的克隆及表达1,**2,**1111刘昱翔陈建荣彭彦黄妤赵燕黄丽华21,*郭清泉张学文12湖南农业大学生物科学技术学院,湖南长沙410128;长沙学院生物工程与环境科学系,湖南长沙410003摘要:从苎麻转录组数据出

2、发,利用Blast工具从中分析出与多种植物纤维素合酶高度相似的片段CL789和Unigene20360。根据片段信息设计特异性引物,从苎麻[Boehmerianivea(Linn.)Gaud.]栽培种湘苎3号中克隆纤维素合酶核心片段,并利用5'及3'RACE技术获得2个片段的全长cDNA。两者都具有典型的纤维素合酶特征结构域,表明为2个苎麻纤维素合酶基因CesA的cDNA序列,分别命名为BnCesA2和BnCesA3。BnCesA2基因编码区全长度3240bp,编码1079氨基酸多肽;BnCesA3基因编码区全长3120bp,编码1039氨基酸多肽。对BnCesA

3、2和BnCesA3基因在湘苎1号、湘苎3号、湘潭大叶白和城步青麻苎麻品种木质部和韧皮部荧光定量PCR分析显示,2个基因在不同品种苎麻的木质部及韧皮部都有表达,但表达量存在着一定差异,整体而言BnCesA2具有更高的表达水平,其木质部和韧皮部的表达都为BnCesA3的2~5倍。推测BnCesA2和BnCesA3均参与了苎麻细胞壁的次生合成。关键词:苎麻;纤维素合酶基因;cDNA克隆;表达分析cDNACloningandExpressionofTwoCelluloseSynthaseGenesfromBoeh-merianivea1,**2,**1111LIUYu-X

4、iang,CHENJiang-Rong,PENGYan,HUANGYu,ZHAOYan,HUANGLi-Hua,GUO21,*Qing-Quan,andZHANGXue-Wen12CollegeofBioscienceandBiotechnology,HunanAgriculturalUniversity,Changsha410128,China;DepartmentofBiotechnologyandEnviron-mentalScience,ChangshaUniversity,Changsha410003,ChinaAbstract:Twopotential

5、lyhighhomologousfragmentsCL789andUnigene20360wereidentifiedasplantcellulosesynthasecharactersequencefromthetranscriptomedataweobtainedpreviouslybyBlastaligningandhomologousscreening.ThetwopairsofspecificprimerswerethendesignedbasedontheCL789andUnigene20360sequencesinformation.Theinter

6、mediatefragmentsoftwocellulosesynthasegenecDNAwereclonedfromramievarietyXiangzu3byRT-PCR.AndthewholecDNAwasclonedbyfollowed5'and3'RACE.ThefulllengthcDNAsweresequencedandtheirencodedputativeproteinswereidentifiedascellulosesynthasebytheconserveddomainanalysis.The‘setwocDNAsequenceswere

7、namedasBnCesA2andBnCesA3respec-tively.Thefull-lengthcodingsequenceofBnCesA2geneis3240bp,andencodesaputative1079aminoacids.Thecodingse-quenceofBnCesA3geneis3120bp,andcouldbetranslatedintoa1039aminoacidsprotein.WedesignedthespecificprimersbasedoncDNAsequencesofthetwogenesandtheirexpress

8、ionle

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