3种死菌悬液制备方法对pma_qpcr结果的影响

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1、中国畜牧兽医2014年第41卷第12期生物技术·15·3种死菌悬液制备方法对PMA-qPCR结果的影响王慧党1,温书香1,王慧勤2,曹旭东3,陈创夫1(1.石河子大学动物科学学院,新疆石河子832003;2.石河子大学生命科学学院,新疆石河子832003;3.石河子大学医学院,新疆石河子832003)摘要:本试验利用热灭活致死法、超声裂解致死法和紫外线照射法3种制备结核分支杆菌死菌悬液的方法,比较不同灭菌方法制备的死菌对PMA-qPCR偶联技术结果的影响,选择结核分支杆菌死菌悬液的最佳制备方法制备后续试验中用到的结核分支杆菌死菌;探索PMA-qPCR偶联技术的适用范围和局限性。结

2、果表明,热灭活法和超声裂解致死法制备的结核分支杆菌死菌悬液影响PMA-qPCR检测的Ct值的变化;紫外线照射法制备的结核分支杆菌死菌悬液对PMA-qPCR检测的Ct值没有影响;热灭活法是制备结核分支杆菌死菌悬液的最佳方法;PMA-qPCR偶联技术不适用于细胞膜无损伤致死法制备死菌的检测。关键词:PMA-qPCR偶联技术;热灭活;超声;紫外线照射中图分类号:Q78文献标识码:A文章编号:1671-7236(2014)12-0015-05PMA是一种叠氮类核酸染料,它对DNA分子Gu等,2007),而该惰性物质并不影响后续PCR的具有高度亲和力,在650W卤素灯照射条件下扩增。在细胞

3、膜受损的条件下PMA能穿透细胞膜PMA与DNA分子共价交联,交联产物不能作为并与DNA分子结合,在曝光条件下与DNA分子共DNA模板进行PCR扩增。PMA不能穿透具有完价交联从而抑制DNA分子扩增。qPCR技术是近整细胞膜的细胞,因此被阻隔在细胞膜外,在光照条几年来新兴起的一门用于PCR初始模板量定量检件下形成没有活性的惰性物质(Nocker等,2006;测的技术,研究表明其检测的灵敏度达25CFU/mL。PMA与qPCR结合技术能选择性检收稿日期:2014-06-30测活菌(Shapiro,2001;蒋志国等,2008),并被广泛作者简介:王慧党(1987-),女,河南人,硕士

4、生,研究方向:畜禽应用于食源性病原菌和其他病原菌中活菌的检测。病原分子生物学。通信作者:陈创夫。E-mail:ccf-xb@163.comPMA-qPCR偶联技术虽能从所得样品中选择性检基金项目:国家科技重大专项(2013ZX10003003-002)。测“活菌”,但这里所说的“活菌”是指具有完整细胞櫅櫅櫅櫅櫅櫅櫅櫅櫅櫅櫅櫅櫅櫅櫅櫅櫅櫅櫅櫅櫅櫅櫅櫅櫅櫅櫅櫅櫅櫅櫅櫅櫅櫅櫅櫅櫅櫅櫅櫅櫅櫅櫅櫅櫅櫅櫅櫅櫅(1.CollegeofAnimalScienceandTechnology,YangzhouUniversity,Yangzhou225009,China;2.KeyLaborator

5、yofAnimalGenetics,Breeding,ReproductionandMolecularDesignofJiangsuProvince,Yangzhou225009,China;3.JiangsuJinghaiPoultryGroupCo.,Ltd.,Nantong226103,China)Abstract:InordertounderstandthecodoncharacteristicsofGnRHRgeneandselecttheappropriateexogenousexpressionsystem,onlinetoolsCUSP,CHIPSandCodon

6、WsoftwarewereusedtoanalyzethecodoncharacteristicsofGnRHRgene.Gn-RHRgenewascomparedtoothergenesofchicken,modelanimalgenomesandGnRHRgeneofotherspecies.TheresultsshowedthatENcvalueofGnRHRgeneinJinghaiYellowchickenwassmall,whichindicatedstrongcodonbias.GnRHRgenewasbiastowardthesynonymouscodonswit

7、hGandCatthethirdcodonposition.GCcontentwasgreaterthanATcontentinCDSregionofGnRHRgene.AnalysisbyCodonWsoftwareshowedthatincodonsofGnRHRgeneinJinghaiYellowchicken,GCC,ATC,CTC,CTG,CGC,CGG,AGC,TCCandGTGwereofstrongbiasandendwithG/C.Therewere12bia

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