宁夏回族hlaa，b，drb1基因座遗传多态性和单倍型分析_论文

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1、宁夏回族HLAA，B，DRB1基因座遗传多态性和单倍型分析作者：沈春梅朱波峰刘孟黎张华东李生斌【摘要】目的：研究宁夏回族自治区地区回族人群HLAA，B，DRB1基因座的等位基因及其组成的单倍型频率分布特征.方法：采集宁夏回族122名无关健康个体静脉血，应用聚合酶链反应序列特异性引物方法对其HLAA，B和DRB1基因座进行基因分型.直接计数法统计基因频率，采用最大数学预期值算法计算HLA单体型频率.结果：122名宁夏回族个体的HLAA，B，DRB1基因座分别检出14，29，13个等位基因.高频等位基因分

2、别为HLAA*02；HLAA*11；HLAA*24；HLAA*03，HLAB*35；HLAB*46；HLAB*13；HLAB*51，HLADRB1*15；HLADRB1*09；HLADRB1*07；HLADRB1*12.高频单倍型分别为HLAA*02B*46；HLAA*11B*60；HLAA*02B*51；HLAB*46DRB1*09；HLAB*13DRB1*07；HLAB*58DRB1*17；HLAA*02B*46DRB1*09；HLAA*02B*58

3、DRB1*17；HLAA*02B*13DRB1*12.结论：宁夏回族自治区回族人群HLA基因座的等位基因和单倍型具有较高的遗传多态性.HLAA*01B*37,HLAA*30B*13,HLAA*02B*50,HLAB*31DRB1*10在该民族具有极强的连锁不平衡.8/8【关键词】宁夏回族；HLA抗原；单倍型频率；遗传多态性0引言人类白细胞抗原(humanleukocyteantigen,HLA)系统位于，是目前所知人类基因组中多态性最高、最为复杂的免疫遗传系统,其研究已广泛应用于器官移植

4、配型以及疾病相关性研究等领域.由于HLA基因座具有高度的遗传多态性,在不同种族、民族、不同地域的人群中,其等位基因和单倍型的频率存在差异,因此对于民族起源、进化、迁徙、融合等人类群体遗传学研究具有重要意义,并且在法医学个体识别中也发挥着重要的作用［1-4］.我们采用聚合酶链反应序列特异性引物方法(polymerasechainreactionsequencespecificprimers,PCRSSP),对宁夏回族自治区回族人群HLAA，B和DRB1基因座进行分析研究.1材料和方法材料宁夏回族自治区122

5、名健康、无血缘关系的回族个体,其个体3代以上无与其他民族个体通婚史.采集其外周血各2mL,EDTA抗凝.HLAA，B，DRB1分型试剂（美国PELFREEZ公司，美国GT公司）.PE9700型PCR仪.方法基因组DNA制备采用盐析法提取基因组DNA,DNA浓度为50～80ng/L,纯度为～8/8A，B和DRB1基因座基因分型按HLAA，B，DRB1分型试剂说明进行分型.对模棱两可的结果采用第二家试剂进行分型，仍不出结果的进行测序分型.遵循WHO下属HLA系统命名委员会规定,按标准HLA命名法则低分辨判

6、读等位基因,分析分别得出HLAA，B和DRB1基因座基因型,并按HLA命名委员会公布的HLA等位基因与其表型对应关系将等位基因型转化为相应的表现型.Weinberg平衡检验采用χ2方法做吻合度检验,通过Arlequin软件计算χ2和P值,检验水准设为统计学处理：应用直接计数法统计HLAA，B，DRB1基因座基因频率.采用最大数学预期值算法(expectationmaximization,EM),通过Arlequin软件计算HLA单体型频率，以频率大于1/（N为样本量）为观察到有意义单倍型［5］.依文献［6

7、］计算两基因座连锁不平衡参数，依文献［7］报道有意义两基因座单倍型正连锁不平衡参数.不同民族HLAB基因座数据源自文献［3-4,8-11］，用Nei［12］方法以HLAB基因座基因频率数据计算不同民族间的遗传距离，将遗传距离导入软件,根据邻接法构建NeighborJioning(NJ)系统发生树.2结果8/8A，B和DRB1等位基因频率分布在122名回族个体中HLAA基因座中共检出14个等位基因,基因频率分布在～之间（表1）,其中高频等位基因分别为HLAA*02(GF=)，A*11(GF=)，A*2

8、4(GF=)；HLAB基因座共检出29个等位基因,基因频率分布在～之间,其中高频等位基因分别为HLAB*35(GF=)，B*46(GF=)，B*13(GF=)；HLADRB1基因座共检出13个等位基因,基因频率在～之间,其中高频等位基因分别为HLADRB1*15(GF=)，DRB1*09(GF=)，DRB1*07(GF=).Weinberg平衡检验通过Arlequin软件进行