iTRAQ标记的蛋白质组原理等.pptx

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1、蛋白基因组学的原理ShanghaiMhelixBioTechCo.Ltd2017.09.12GenomicsisnotenoughTranslationalMedicineResearch:FromGenomicstoProteomics项目技术路线项目技术路线项目技术路线质谱图匹配早期诊断ClemontHospitalCHUdeLyonIARCMHelixBioTechAssociateDiagnosisConsortiumofBrestCancernoninvasiveclinicalsample伴随治

2、疗Internationalmuti-drugResistanceTBConsortiumLilyPharm;K-RITH;MicrobialInstitute-CAS;ChinaCDC;RussianCDC;Mhelix….clinicaldistinguishShanghaiChangzhengHospitalMHelixBioTechinstructtherapy药物筛选蛋白质组学的技术挑战1.蛋白质的提取方法2.质谱的参数设置3.数据库的选择4.数据不好的肽段单独匹配5.针对蛋白质特有的信息分析Qu

3、antitativeproteomicsconfirmcriticalpathwayresponsetospermmotility蛋白提取酶解消化同位素标记组份分离质谱检测数据处理高级信息分析ProteogenomicsPresentusabrandnewperspectivetounderstandinherentregulationPhilippetal.,Nature(2016)蛋白质组学是蛋白质组学和基因组学界面的研究领域。在这种方法中，使用基因组和转录组学信息产生的定制蛋白质序列数据库用于帮助鉴

4、定基于质谱的蛋白质组学数据的新肽（参考蛋白质序列数据库中不存在）;反过来，蛋白质组学数据可用于提供基因表达的蛋白质级证据，并帮助改进基因模型。Integratedworkflowforproteogenomicsprovidesinsightsintophotosyntheticpathwaysincyanobacteria鉴定了超过92%的预测的编码基因,校正了38个预测的编码基因并且发现了118个新基因为了研究IFN-γ调节吞噬功能的分子机制，我们利用定量蛋白质组学和生物信息学方法分析了静息和活化巨噬细

5、胞中吞噬体蛋白质的组成，丰度和磷酸化的变化。我们确定了2415个吞噬体蛋白和2975个独特的磷酸化位点，具有很高的灵敏度。使用网络分析，我们确定IFN-γ延迟了溶酶体水解酶和肽酶的吞噬体获得以获得抗原呈递。此外，抗原呈递中的这种增益取决于肌动蛋白细胞骨架和囊泡运输蛋白以及Src激酶和钙蛋白酶蛋白酶的吞噬体网络。主要组织相容性复合体I类抗原呈递测定验证了这些网络的分子参与增强IFN-γ激活的巨噬细胞向CD8+T细胞交叉外源抗原的能力。ThankYou!