itraq结合质谱筛选胃癌血清生物标记物

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1、CMYK1154实用医学杂志2014年第30卷第7期iTRAQ结合质谱筛选胃癌血清生物标记物韦春回赖铭裕莫喜晶摘要目的:利用同位素标记相对和绝对定量(iTRAQ)技术筛选并鉴定胃癌、胃黏膜肠上皮化生患者和健康人血清差异表达蛋白。方法:收集胃癌(GC)、胃黏膜肠上皮化生患者(IM)及正常人血清各45例,组内等量混合后,去除高丰度蛋白,经iTRAQ试剂标记后采用二维液相色谱-串联质谱(2D鄄LC鄄MS/MS)鉴定并相对定量。结果:共鉴定出10540条独特肽段,对应199个非冗余蛋白,相对于正常组,在胃癌组和胃黏膜肠上皮化生组中均表达上调的差异蛋白有23种,下调

2、的有14种,差异蛋白中包括脂多糖结合蛋白(lipopolysaccharide鄄bindingprotein,LBP)、C反应蛋白(C鄄reactiveprotein,CRP)及无花果酶3(Ficolin鄄3,FCN3)等9种免疫反应蛋白,提示免疫反应和胃癌间存在一定的联系。结论:筛选出多种与胃癌发生发展的差异蛋白,提示iTRAQ技术对于胃癌蛋白质组学血清生物标记物的研究有很好的应用前景。关键词胃肿瘤;iTRAQ;血清生物标志物鄢ScreeningserumbiomarkersingastriccancerbyiTRAQ鄄Coupled2D鄄LC鄄MS/M

3、SWEIChun鄄hui,LAIMing鄄yu,MOXi鄄jing.鄢DepartmentofGeriatricGastroenterology,theFirstAffiliatedHospitalofGuangxiMedicalUniversity,Nanning530021,ChinaCorrospondingauthor:LAIMing鄄yuE鄄mail:laimingyu2005103@yahoo.com.cn【Abstract】ObjectiveToapplytheIsobarictagsforrelativeandabsolutequantit

4、ation(iTRAQ)toidentifyproteinsdifferentiallyinserumsofgastriccancer(GC)patients,gastricmucosalintestinalmetaplasia(IM)patientsandnormalcontrolpopulation.MethodsThestudyincludedserumsamplesfromGCgroup,IMgroupandnormalcontrolgroupwith45caseseachgroup,Proteinsdifferentiallyregulatedi

5、nserumswereidentifiedbytheiTRAQcoupledwithtwo鄄dimensionalliquidchromatography/tandemmassspectrometry(2D鄄LC鄄MS/MS)technology.Results10540uniquepeptides,ofwhichcorrespondtoasetof199proteinswereidentified,23proteinswereoverexpressedand14proteinswereunderexpressedinGCandIM.Nineimmuner

6、esponseproteinssuchasLipopolysaccharide鄄bindingprotein,C鄄reactiveproteinandFicolin鄄3werefoundinthedifferentialproteins,implyingacloselinkagebetweenimmuneresponseandGC.ConclusionsiTRAQtechnologymayhelptoidentifynovelserummarkersforearlydiagnosisofGC.【Keywords】Gastriccancer;iTRAQ;Se

7、rumbiomarkers胃癌(gastriccancer,GC)是人类常见的恶性肿寻找新的胃癌相关的分子标记物。iTRAQ技术是瘤之一,居全球肿瘤发病率的第四位和肿瘤死亡近年来研发的一种新的多肽体外同位素标记相对率的第二位[1]和绝对定量技术[4][5][6]及,在中国,其发病率和死亡率分别为,该技术在肝癌、卵巢癌第二和第三位[2]子宫癌[7]等的肿瘤研究方面已得到广泛应用。本研。目前,对于胃癌高危人群的筛查主要依赖于电子胃镜病理活检,但容易受检查医究旨在利用iTRAQ技术筛选出用于诊断早期胃癌师的经验因素而影响早期胃癌的检出率,且为有的生物标记物。创检

8、查,不易普及。而CEA、CA-199、CA72-4等用1资料与方法

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