基因芯片法和测序法检测乙肝病毒基因分型的耐药突变比较-论文.pdf

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1、热带医学杂志2014年7月第l4卷第7期JTropMed,Ju1.2014,Vo1.14,No.7·实验研究论著·基因芯片法和测序法检测乙肝病毒基因分型的耐药突变比较张惠琴,冯体玉,张灼锦(梅州市人民医院检验科,广东梅州514031)摘要:目的比较基因芯片法和测序法检测乙肝病毒基因分型及耐药突变基因的一致性。方法采用基因芯片法和测序法对120例慢性乙型肝炎患者血清标本(HBV—DNA>Ixl0IU/m1)进行检测,比较两种方法检测乙肝病毒基因分型和耐药突变基因的情况。结果120例慢性乙型肝炎患者血清中,测序法检出B型52例

2、(43.33%)、C型68例(56.67%);基因芯片法检出B型48例(40.00%)、C型64例(53.33%)、B+C混合型4例(3.33%),有4例未能分型(3.33%);测序有54例发生耐药位点突变,突变率为45.00%;基因芯片有58例发生耐药位点突变,检出率48.33%;以共有的耐药位点来统计,基因芯片法的变异检出数稍高于直接测序法,两种检测方法间差异无统计学意义。结论基因芯片法和测序法在同时进行乙肝病毒基因分型和耐药突交基因的检测中,可认为检测结果一致。关键词:乙肝病毒;基因芯片;序列分析;耐药突变基因中图分

3、类号:R512.62文献标识码:A文章编号:1672.3619(2014)07.0867.04ComparisionofgenechipandsequenceondetectionofHBVgenotypeanddrug-resistantmutationZHANGHui—qin,FENGTi-yu,ZHANGZhuo—jin(DepartmentofClinicalLaboratory,PeopleHospitalofMeizhou,Guangdong,Meizhou514031,China)Abstract:Objec

4、tiveTocomparetheresultsofgenechipandDNAsequenceondetectionofhepatitisBvirusgenotypeanddmgresistancegenemutation.MethodGenechipandDNAsequeneewereusedtodetectHBVgenotypeanddrugresistancegenemutationon120serumsamples(HBV-DNA>lxl0IU/m1)。ResultsIn120seFumsamplesofpatie

5、ntswithchronichepatitisB,therewere52casesoftypeB(43.33%),68casesoftypeC(56.67%)detectedbyDNAsequence,andtherewere48casesoftypeB((40.o0%),64casesoftypeC(53.33%),4casesoftypeB+C(3.33%),4casesofundiferentiatedtypedetectedbygenechip.54casesofdmgresistancegenemutationw

6、eredetectedbysequenceand58casesbygenechip.Basedonthecommonresistanceloci,caseofmutationdetectedbygenechipwasalittlemorethanbyDNAsequence,buttherewasnostatisticallysignificantdiference.ConclusionTheresultsofHBVgenotypeanddrugresistancegenemutationdetectedbygenechip

7、wereconsistentwiththatbysequence.Keywords:HBV;genechip;sequence;resistancegenemutation乙型肝炎是由乙型肝炎病毒(hepatitisBvirus,和耐药相关位点的突变.以评价两种方法的一致HBV)引起的一种传染性疾病,HBV基因型分布呈性,现报告如下。现地区区域性分布特点[1-4],根据HBV全基因序列1材料与方法的同源性>92%或者s基因序列同源性>96%,可将HBV分为A.I等9种基因型。目前临床治疗应用1.1对象收集2012年6月至2

8、0l3年6月梅最多的抗乙肝病毒药物是核苷类似物,患者长期服州市人民医院门诊病人服用拉米夫定等核苷(酸)类用此类药物可诱导HBV基因区发生变异,会降低药物治疗1年以上,HBV.DNA大于1×10IU/ml病毒对药物的敏感性。HBV基因型和耐药相关位的120例慢性乙型肝炎患者血清,其中男72例,点的突变常用

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