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时间:2020-04-16
《兔豆状囊尾蚴TpRS1基因的克隆及其序列分析-论文.pdf》由会员上传分享,免费在线阅读,更多相关内容在行业资料-天天文库。
1、生物技术通报·研究报告·BIoTECHNoLoGYBULLETIN2014年第7期兔豆状囊尾蚴TpRSI基因的克隆及其序列分析韩乐乐李作磊苟惠天孙晓林(甘肃农业大学动物医学院,兰州730070)摘要:旨在研究兔豆状囊尾蚴TpRS1的功能,根据GenBank中猪带绦虫RS1cDNA序列设计引物,以豆状囊尾蚴总RNA为模板,利用RT.PCR技术首次克隆到兔豆状囊尾蚴TpRS1的完整开放阅读框序列,并利用生物信息学软件对该基因及其编码蛋白的基本理化性质、疏水性、信号肽、二级结构和抗原位点等方面进行了预测和分析。结果表明,兔豆状囊尾蚴TpRS1的cDN
2、A序列为275bp的基因片段,该序列含有一个由258个核苷酸组成的开放阅读框,编码85个氨基酸。其编码蛋白疏水性,分子质量为9.6kD,理论等电点为9.07。TpRS1二级结构中0L螺旋占70.59%,B折叠占5.88%,其余23.53%为无规卷曲,TpRS1没有信号肽序列,同源性分析表明与其他带科绦虫的一致性在72%以上,系统进化分析表明与泡状带绦虫处于同一进化分支。关键词:豆状囊尾蚴TpRS1基因克隆序列分析CloningandSequenceAnalysisofTpRS1GenefromCysticercuspisiformisHanLe
3、leLiZuoleiGonHuitianSunXiaolin(CollegeofVeterineryMedicine,GansuAgriculturalUnwe~ity,Lanzhou730070)Abstract:TostudythefunctionofTpRS1genefromCysticercuspisifo,m。theopenreadingframe(ORF)eDNAsequenceofTpRS1genewasclonedbyRT—PCRfromC.pisiformistotalRNAwithprimersderivedfromTaen
4、iasoliumRS1genesequenceintheGenBankdatabase.Biochemicalproperties,secondarystructure,signal,hydrophobicityandantigenicityinTpRS1proteinwerepredictedbybioinformatiestools.TheresultsindicatedthatTpRS1cDNAsequeneecontainedanORFof258nucleotidesandthededucedproteinconsistedof85am
5、inoacidswiththetheoreticalmolecularweightof9.6kDandisoeleetriepointof9.07.Analysisofsecondarystructurerevealed70.59%and5.88%of0【一helixandIB-strands,respectively,andotherswereloop.ThesignalpeptidesequenceofTpRS1werenotidentified.TpRS1proteinsequenceshowedmorethan72%identitywi
6、thotherTaeniaspp..PhylogeneticanalysisindicatedthatTpRS1locatedinthesamecladewithTaeniahydatigena.Keywords:Cysticercuspi~iformisTpRS1geneCloningSequenceanalysis豆状囊尾蚴是带科(Taeniidae)带属(Taenia)重威胁,而且给养殖业的发展造成严重影响。的豆状带绦虫(Taeniapisifo)的中绦期蚴虫,常目前,带科绦虫免疫诊断抗原的研究主要集中寄生于家兔等啮齿动物的肝脏、大网膜、
7、肠系膜和在一些低分子量抗原方面7-10]o研究证明,在带科腹腔内引起其豆状囊尾蚴病⋯。当终末宿主(如犬、绦虫囊尾蚴病诊断中具有较好应用价值,如10、14狼、狐等)吞食了感染豆状囊尾蚴的中间宿主组织和18kD等抗原都属于8kD基因家族成员,只是糖后,豆状囊尾蚴在其小肠中发育为豆状带绦虫。基化修饰程度的差异而形成大小不同的蛋白分子。该病呈世界性分布引,我困各地均有发生J。该Ferrer等71“对8kD抗原家族基因进行研究发现,病的流行,不仅对公共卫生及兔肉食品安全构成严Ts8ku糖蛋白显示出良好的免疫反应性,在猪囊尾收稿日期:2013.12—17基
8、金项目:甘肃省农业生物技术研究与应用开发项目(GNSW一2010—01),甘肃省科技支撑计划项目(1104NKCA082)作者简介:韩乐乐,女,硕士研
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