生物信息学作业实验3.doc

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1、广州大学学生实验报告开课学院及实验室：生命科学学院计机楼4072013年11月15日学院生命科学学院年级、专业、班生物工程10姓名学号10142000实验课程名称生物信息学　成绩　实验项目名称　实验三序列分析与比较指导教师　一、实验目的1、掌握已知或未知序列接受号的核酸序列检索的基本步骤；2、掌握使用BioEdit软件进行核酸序列的基本分析；3熟悉基于核酸序列比对分析的真核基因结构分析（内含子/外显子分析）；4、了解基因的电子表达谱分析。二、实验内容1、归纳对人瘦素(leptin)的核酸序列分析的

2、结果，列出主要的分析结果；2、总结核酸序列分析的基本步骤，相互对比结果，指出应注意的事项。17三、实验步骤3.1、人瘦素(leptin)的核酸序列分析Homosapiensleptin(LEP),mRNANCBIReferenceSequence:NM_000230.2FASTA GraphicsGoto:LOCUSNM_0002303444bpmRNAlinearPRI03-NOV-2013DEFINITIONHomosapiensleptin(LEP),mRNA.ACCESSIONNM_000

3、230VERSIONNM_000230.2GI:169790920KEYWORDSRefSeq.SOURCEHomosapiens(human)ORGANISMHomosapiensEukaryota;Metazoa;Chordata;Craniata;Vertebrata;Euteleostomi;Mammalia;Eutheria;Euarchontoglires;Primates;Haplorrhini;Catarrhini;Hominidae;Homo.REFERENCE1(bases1t

4、o3444)AUTHORSLee,J.H.,Zhou,L.,Kwon,K.S.,Lee,D.,Park,B.H.andKim,J.R.TITLERoleofleptininLegg-Calve-PerthesdiseaseJOURNALJ.Orthop.Res.31(10),1605-1610(2013)PUBMED23832827REMARKGeneRIF:LeptinmightplayanimportantroleinLegg-Calve-Perthes17diseasepathogenesi

5、s.REFERENCE2(bases1to3444)AUTHORSFourati,M.,Mnif,M.,Kharrat,N.,Charfi,N.,Kammoun,M.,Fendri,N.,Sessi,S.,Abid,M.,Rebai,A.andFakhfakh,F.TITLEAssociationbetweenLeptingenepolymorphismsandplasmaleptinlevelinthreeconsanguineousfamilieswithobesityJOURNALGene5

6、27(1),75-81(2013)PUBMED23751306REMARKGeneRIF:TwofunctionalvariantsintheregulatoryregionoftheLEPgeneareassociatedwithplasmaleptinlevelasaquantitativetrait.REFERENCE3(bases1to3444)AUTHORSMiranda-Filloy,J.A.,Lopez-Mejias,R.,Genre,F.,Carnero-Lopez,B.,Ocho

7、a,R.,DiazdeTeran,T.,Gonzalez-Juanatey,C.,Blanco,R.,Llorca,J.andGonzalez-Gay,M.A.TITLELeptinandvisfatinserumlevelsinnon-diabeticankylosingspondylitispatientsundergoingTNF-alphaantagonisttherapyJOURNALClin.Exp.Rheumatol.31(4),538-545(2013)PUBMED23711190

8、REMARKGeneRIF:Innon-diabeticpatientswithankylosingspondylitisontreatmentwithinfliximableptinandvisfatinserumlevelsdonotcorrelatewithdiseaseactivityorsystemicinflammation.REFERENCE4(bases1to3444)AUTHORSGulcelik,N.E.,Halil,M.,Ariogul,S.andUsman,