生物信息学作业实验3

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1、开课学院及实验室:生命科学学院计机楼407广州大学学生实验报告2013年11月15日学院生命科学学院年级、专业、班生物工程10姓名学号10142000实验课程名称生物信息学成缋实验项目名称实验=序列分析与比较指导教师一、实验目的1、掌握已知或未知序列接受号的核酸序列检索的基木步骤;2、掌握使用BioEdit软件进行核酸序列的基木分析;3熟悉基于核酸序列比对分析的真核基W结构分析(内含子/外显子分析);4、了解基因的电子表达谱分析。二、实验内容1、归纳对人痩素(leptin)的核酸序列分析的结果,列出主要的分析结果;2、总结核酸序列分析的基本步骤,相互对比结來,指出应注意的事项。三、实验步骤3

2、.1、人痩素(leptin)的核酸序列分析Homosapiensleptin(LEP),mRNANCBIReferenceSequence:NM_000230.2FASTAGraphicsGoto:LOCUSDEFINITIONACCESSIONVERSIONKEYWORDSSOURCEORGANISMNM_0002303444bpmRNAHomosapiensleptin(LEP),mRNA.NM_000230NM_000230.2GI:169790920RefSeq.Homosapiens(human)HomosapienslinearPRI03-NOV-2013Eukaryota;Me

3、tazoa;Chordata;Craniata;Vertebrata;Euteleostomi;Mammalia;Eutheria;Euarchontoglires;Primates;Haplorrhini;Catarrhini;Hominidae;Homo.REFERENCE1(bases1to3444)AUTHORSLee,J.H.,Zhou,L•,KwonzK.S•zLee,D.,Park,B.H•andKim,J.R.TITLERoleofleptininLegg-Calve-PerthesdiseaseJOURNALJ.Orthop.Res.31(10),1605-1610(201

4、3)PUBMED23832827REMARKGeneRIF:LeptinmightplayanimportantroleinLegg-Calve-PerthesREFERENCEAUTHORSTITLEJOURNALPUBMEDREMARKREFERENCEAUTHORSTITLEJOURNALPUBMEDREMARKREFERENCEAUTHORSTITLEJOURNALdiseasepathogenesis•2(bases1to3444)Fourati,M.zMnif,KharratzN.,Charfi,N.zKammoun,M.,Fendri,N.zSessi,S.,Abid,M.,R

5、ebai,A.andFakhfakhzF.AssociationbetweenLeptingenepolymorphismsandplasmaleptinlevelinthreeconsanguineousfamilieswithobesityGene527(1),75-81(2013)23751306GeneRIF:TwofunctionalvariantsintheregulatoryregionoftheLEPgeneareassociatedwithplasmaleptinlevelasaquantitativetrait•3(bases1to3444)Miranda-Filloyz

6、J.A.zLopez-Mejias,R.,Genre,F.,Carnero-Lopez,Ochoa,R.,DiazdeTeran,T.,Gonzalez-Juanatey,C.,Blanco,R.,Llorca,J.andGonzalez-Gay,M.A.Leptinandvisfatinserumlevelsinnon-diabeticankylosingspondylitispatientsundergoingTNF-alphaantagonisttherapyClin.Exp.Rheumatol.31⑷,538-545(2013)23711190GeneRIF:Innon-diabet

7、icpatientswithankylosingspondylitisontreatmentwithinfliximableptinandvisfatinserumlevelsdonotcorrelatewithdiseaseactivityorsystemicinflammation.4(bases1to3444)Gulcelik,N.E.,Halil,M.,Ariogul,S.andUsman,A.Adi

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